chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0004 p_0001 p_0001 5057 71 TGATAATAA 4 1.0 poor intergenic + TTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATG 0 71 pPR9TT CDS_0004 intergenic 4986 5502 + up TTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCA CGATGAGTGGCAGGGCGGGGCGTAATTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTAT p_0001 CDS_0004 p_0002 p_0002 5188 202 TTTTAAAAT 3 1.0 poor intergenic + GGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAG 129 200 pPR9TT CDS_0004 intergenic 4986 5502 + up TTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCA CGATGAGTGGCAGGGCGGGGCGTAATTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTAT p_0002 CDS_0004 p_0003 p_0003 5317 331 TAACATCAA 1 0.8 poor intergenic + GTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGA 257 328 pPR9TT CDS_0004 intergenic 4986 5502 + up TTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCA CGATGAGTGGCAGGGCGGGGCGTAATTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTAT p_0003 CDS_0004 p_0004 p_0004 5481 495 TGCATAATA 3 1.0 poor intergenic + ATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTA 422 493 pPR9TT CDS_0004 intergenic 4986 5502 + up TTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCA CGATGAGTGGCAGGGCGGGGCGTAATTTTTTTAAGGCAGTTATTGGTGCCCTTAAACGCCTGGTTCTACGCCTGAATAAGTGATAATAAGCGGATGAATGGCAGAAATTCGAAAGCAAATTCGACCCCGCTGATCGTGGAAACGATAGGGACCGACGGATCAGCTTGCTAGAGGGTCAGCTTTATGCTTGTAAACCGTTTTGTGAAAAAATTTTTAAAATAAAAAAGGGGACCTCTAGGGTCCCCAATTAATTAGTAATATAATCTATTAAAGGTCATTCAAAAGGTCATCCACCGGATCAATTCCCCTGCTCGCGCAGGCTGGGTGCCAAGCTCTCGGGTAACATCAAGGCCCGATCCTTGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTAT p_0004