chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0050 p_0005 p_0005 229 242 TGGTATTAT 3 0.96 poor intergenic + ATACCCATACAAAATCCCAATCTTGATGAGTAAATGGTCAGATTATTGTGGGAATTGGTATTATGCCTATA 171 242 Vnat|691.131|1269495|1283072 CDS_0050 intergenic 200 471 - up AGATTTTAAGTAGGCGCAGGCTGTAGGAAACTACGGCTTGCGTCACTTATCTCTGATTATTATAAATACCTCCCCCTTTTAAACTCCTCAATTCTCTTTATCTGATTCCCTTTCTTCTATTGATTTTGCCTTATAGCGAGCATCTTTCACGCTTTTAAGCTATTACATGTCATACCCATACAAAATCCCAATCTTGATGAGTAAATGGTCAGATTATTGTGGGAATTGGTATTATGCCTATATTTAAACACGAGCCCCCGAGGTACAGATC AAGCTGCTAACGTTGAAGTAGCATAAGATTTTAAGTAGGCGCAGGCTGTAGGAAACTACGGCTTGCGTCACTTATCTCTGATTATTATAAATACCTCCCCCTTTTAAACTCCTCAATTCTCTTTATCTGATTCCCTTTCTTCTATTGATTTTGCCTTATAGCGAGCATCTTTCACGCTTTTAAGCTATTACATGTCATACCCATACAAAATCCCAATCTTGATGAGTAAATGGTCAGATTATTGTGGGAATTGGTATTATGCCTATATTTAAACACGAGCCCCCGAGGTACAGATCATGACTGATGAAGAAAGAATTGAAC p_0005 CDS_0108 p_0021 p_0021 323 107 TGACAGAAT 2 0.76 poor intergenic + GCTTTTTGCTTTCTACTCACTTTGAACTTTGGTTTGGTCTTGCATTCAAATTATCTGACAGAATAGACACA 36 107 Vnat|691.131|4304717|4306933 CDS_0108 intergenic 216 462 + up AAAACATTCCCTGGAGCCATGGAGAAAACATCCATGGCTTTTTGCTTTCTACTCACTTTGAACTTTGGTTTGGTCTTGCATTCAAATTATCTGACAGAATAGACACAAATGAATATCTGCCAATAAATGCAACTCAACTCAAAATTCGTTGTCAGATTCCCTACCATACGACGCATAGCTTTTTACATCTGCGTCGAGCTTGTTTATTATCAGCGCAGTATTTTAAAGGTTAGTAAGAAATTATTA TAAAGAGCTACTTATCGCCGCTTAAAAAACATTCCCTGGAGCCATGGAGAAAACATCCATGGCTTTTTGCTTTCTACTCACTTTGAACTTTGGTTTGGTCTTGCATTCAAATTATCTGACAGAATAGACACAAATGAATATCTGCCAATAAATGCAACTCAACTCAAAATTCGTTGTCAGATTCCCTACCATACGACGCATAGCTTTTTACATCTGCGTCGAGCTTGTTTATTATCAGCGCAGTATTTTAAAGGTTAGTAAGAAATTATTATGCAATTAAAGAAGTGGTTAGTTGC p_0021 CDS_0005 p_0024 p_0024 325 229 GTAGTTAAA 2 0.99 poor intergenic + GTAAATACACTGTGAATGGTATATTTTTAAGTTTTTGATTTATAAAAATAAAAACGTAGTTAAAGAAAGTG 156 227 Vnat|691.131|522668|525313 CDS_0005 intergenic 254 554 - up ACGATAAGAGCAAGGCAAATCAACAACTCGTAACTTTTAAATGGCAGCCAAGCGGCTGCCATTTTTATTTGCTGATTCACTAATGTGTCTAAATCCACCCACTTAATCATTTGGCGTGGGTAGATTTCACCCATTTCAAAAATAATTTTGTGATCTAGGTAAATACACTGTGAATGGTATATTTTTAAGTTTTTGATTTATAAAAATAAAAACGTAGTTAAAGAAAGTGGTTCGGTCCTTGCTTTAGTAGATGCATCAATACCCAGTGATGGGGTTGTTCATTTATCAAGGAGAATAATA CTGAGCAACGCATCGAGTTTCACTAACGATAAGAGCAAGGCAAATCAACAACTCGTAACTTTTAAATGGCAGCCAAGCGGCTGCCATTTTTATTTGCTGATTCACTAATGTGTCTAAATCCACCCACTTAATCATTTGGCGTGGGTAGATTTCACCCATTTCAAAAATAATTTTGTGATCTAGGTAAATACACTGTGAATGGTATATTTTTAAGTTTTTGATTTATAAAAATAAAAACGTAGTTAAAGAAAGTGGTTCGGTCCTTGCTTTAGTAGATGCATCAATACCCAGTGATGGGGTTGTTCATTTATCAAGGAGAATAATAATGTTTAAGCCTGTTACCCTACTAA p_0024 CDS_0050 p_0004 p_0004 337 134 ATTGATTTT 2 0.99 poor intergenic + AAATACCTCCCCCTTTTAAACTCCTCAATTCTCTTTATCTGATTCCCTTTCTTCTATTGATTTTGCCTTAT 60 131 Vnat|691.131|1269495|1283072 CDS_0050 intergenic 200 471 - up AGATTTTAAGTAGGCGCAGGCTGTAGGAAACTACGGCTTGCGTCACTTATCTCTGATTATTATAAATACCTCCCCCTTTTAAACTCCTCAATTCTCTTTATCTGATTCCCTTTCTTCTATTGATTTTGCCTTATAGCGAGCATCTTTCACGCTTTTAAGCTATTACATGTCATACCCATACAAAATCCCAATCTTGATGAGTAAATGGTCAGATTATTGTGGGAATTGGTATTATGCCTATATTTAAACACGAGCCCCCGAGGTACAGATC AAGCTGCTAACGTTGAAGTAGCATAAGATTTTAAGTAGGCGCAGGCTGTAGGAAACTACGGCTTGCGTCACTTATCTCTGATTATTATAAATACCTCCCCCTTTTAAACTCCTCAATTCTCTTTATCTGATTCCCTTTCTTCTATTGATTTTGCCTTATAGCGAGCATCTTTCACGCTTTTAAGCTATTACATGTCATACCCATACAAAATCCCAATCTTGATGAGTAAATGGTCAGATTATTGTGGGAATTGGTATTATGCCTATATTTAAACACGAGCCCCCGAGGTACAGATCATGACTGATGAAGAAAGAATTGAAC p_0004 CDS_0051 p_0006 p_0006 687 311 ATTTATATA 3 0.68 poor intergenic + AAAGATACATTAAATAATTCAAGCTACTAGCGCATTCAAATAATTAATTTTTTCAATTTATATAAGGGACA 234 305 Vnat|691.131|1269495|1283072 CDS_0051 intergenic 683 998 - up ATCTCACTCAATATCGTTTAAATATTGAGCTACCATTGCCGAACGTGTAAGTTCGCGGCTTTTAACATTCAGAGACGTGTAGATCCCAAAAAAATAAATACAAATAATCCTTTACATGTGATCACTAAAAGACAATAATGGCGCCGCTCTGTTGTTCAGAGTTATTAAATGAGACATCACGTAGTAAAAGTAAAACCCTTAGAAAACCAAGTTGTTATCCTCAGTGTTTCCCTTAGCTTCAAAGATACATTAAATAATTCAAGCTACTAGCGCATTCAAATAATTAATTTTTTCAATTTATATAAGGGACATATC 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TGTTTGATTTTGTCGATAGTTTCCATCGCTTCCTCATTCATAGGTTTTAACTTTGTTTATCTGCCACATTCTACTCAATAACGGCAGAATAAAAACCATATAATTGATATGGTTTAAACTAAGCTTGTTTGATGACGCAAGATTCATCACTTCGTCACAGCTAACATCTTAAAATATTTTCATATCGGGGTTTTAATAAAGTAAAAACTTGCTAAAATACCTAGCAAGTCAGTCGTATCGACTCAGAACGAATAAAAACACTGGAAGCAATCGAAAGGTTACCCTTTCATATCAATGGAGAATCGAGTAATGGCATTTGAACTACCAGCTCTTC p_0017 CDS_0028 p_0001 p_0001 939 175 TGAAATATT 3 1.0 poor intergenic + AAACAATGTCAGTTGTTTGTTTTTTCTTACATACAGAAAGTTATACGTAAGTTATTGAAATATTGTATTTT 106 177 Vnat|691.131|1238336|1257198 CDS_0028 intergenic 764 1001 + up CGCACCCATAGGAACACCAAGAGTAACAGTCGTCTTCTGTTACTCTTTTCTTTTTCCAACCTGTTCAGTCATTCAATCACGACAAACAAATCTTGTACTAAAACAAACAATGTCAGTTGTTTGTTTTTTCTTACATACAGAAAGTTATACGTAAGTTATTGAAATATTGTATTTTTGATGGTTGGTATACATTTCGCAACAACGGTCATGAGTCTAAATTAAAAAGGAGATAGACCA TCTGCATGCTTTATTGGGGAATTAGCGCACCCATAGGAACACCAAGAGTAACAGTCGTCTTCTGTTACTCTTTTCTTTTTCCAACCTGTTCAGTCATTCAATCACGACAAACAAATCTTGTACTAAAACAAACAATGTCAGTTGTTTGTTTTTTCTTACATACAGAAAGTTATACGTAAGTTATTGAAATATTGTATTTTTGATGGTTGGTATACATTTCGCAACAACGGTCATGAGTCTAAATTAAAAAGGAGATAGACCATGGCAATTCGTCAATGTGCAATTTA p_0001 CDS_0081 p_0013 p_0013 1371 137 ACTTAAAAA 3 0.96 poor intergenic + GCGCCTTTTTTTGTTTGTATTGTAACCAATAGCCTTTAATTCCTTTAAATCAATAACTTAAAAACTTGGCA 66 137 Vnat|691.131|2229248|2231566 CDS_0081 intergenic 1318 1508 - up ATGCACAATTTTGGGTAATCAATTGTAGCTTGCTTTATATTTGGGAAAGAGGTGCACTATTATGGTGCGCCTTTTTTTGTTTGTATTGTAACCAATAGCCTTTAATTCCTTTAAATCAATAACTTAAAAACTTGGCACGTAGATTGGATTATTAGAAGTGTTTCAGGATGAATGCTTCGGAGAGAATTTA AATGGAAAGAGTTTTTGAACATTTAATGCACAATTTTGGGTAATCAATTGTAGCTTGCTTTATATTTGGGAAAGAGGTGCACTATTATGGTGCGCCTTTTTTTGTTTGTATTGTAACCAATAGCCTTTAATTCCTTTAAATCAATAACTTAAAAACTTGGCACGTAGATTGGATTATTAGAAGTGTTTCAGGATGAATGCTTCGGAGAGAATTTAATGAAAATAATCAATGCCATTATAA p_0013 CDS_0067 p_0012 p_0012 1604 81 ATAAAAAAA 3 0.15 poor intergenic + CTTTTTTGTTTTTTTAATTAACCTCTGAGGGTAAGACAGCCCCTGTTTGAATACCATAAAAAAATAGCTTC 4 75 Vnat|691.131|1780454|1782973 CDS_0067 intergenic 1516 1685 - up TTCGCGCTTCCTTTTTTGTTTTTTTAATTAACCTCTGAGGGTAAGACAGCCCCTGTTTGAATACCATAAAAAAATAGCTTCGTGCGTTAATCTAACGATATTCGCTGCATTCGCAGGCAGTTTAAGGTTAAAATCCTCTATAACAGCAACATAAAATACGACGAATATA TGATTGACAGGCAGCTGTGCTGTCATTCGCGCTTCCTTTTTTGTTTTTTTAATTAACCTCTGAGGGTAAGACAGCCCCTGTTTGAATACCATAAAAAAATAGCTTCGTGCGTTAATCTAACGATATTCGCTGCATTCGCAGGCAGTTTAAGGTTAAAATCCTCTATAACAGCAACATAAAATACGACGAATATAATGAAAATCGGACTCTTTTACGGCT p_0012 CDS_0105 p_0020 p_0020 1758 330 TGATTATGA 2 1.0 poor intergenic + CCGTAAAATTTTTTCTGATTCGAGACTAAAAAATGCTTTGATTTCACAATTTTGGTGATTATGATGCGCGC 260 331 Vnat|691.131|4135683|4138304 CDS_0105 intergenic 1747 2088 - up TATATTATCCAAGATTCACTTGTGAAATTTTTACTGGGATACCAGTCAATTAGTGTGTCCGACATTATAAAGAATTCTAGCCACGTCTAAAATCATAACTCGCGCTCAATTCTTGCAATATCCATTATTTGGTTGATAATTGGCCACTACAAGGCCATGAAATTGAAAACAATTGTTGCAGAGTTGTAACCCTTATAAACGCTGTTGAAATTCGGACGAATCTTTTTAAAACAGTATGGTAAGGAATGATGACTTTTGCCCGTAAAATTTTTTCTGATTCGAGACTAAAAAATGCTTTGATTTCACAATTTTGGTGATTATGATGCGCGCCTCAAAAGTGA AAATCGTTCTCAAAGTCGTTGTTCATATATTATCCAAGATTCACTTGTGAAATTTTTACTGGGATACCAGTCAATTAGTGTGTCCGACATTATAAAGAATTCTAGCCACGTCTAAAATCATAACTCGCGCTCAATTCTTGCAATATCCATTATTTGGTTGATAATTGGCCACTACAAGGCCATGAAATTGAAAACAATTGTTGCAGAGTTGTAACCCTTATAAACGCTGTTGAAATTCGGACGAATCTTTTTAAAACAGTATGGTAAGGAATGATGACTTTTGCCCGTAAAATTTTTTCTGATTCGAGACTAAAAAATGCTTTGATTTCACAATTTTGGTGATTATGATGCGCGCCTCAAAAGTGAATGGCTAAAGTCACATCAATTGGCG p_0020 CDS_0111 p_0022 p_0022 1786 116 CCGTATAAT 4 0.52 poor intergenic + TTTACTTTTATTCCGCGATTGCGCAAATAAAAGGATTTCCTAACCGATATCCAGGCCGTATAATGACGCCA 45 116 Vnat|691.131|4304717|4306933 CDS_0111 intergenic 1670 1789 + up ACTTACTCCTATCGATACATGTCCAGATGAAAAGCGAGCCCCAATTTTACTTTTATTCCGCGATTGCGCAAATAAAAGGATTTCCTAACCGATATCCAGGCCGTATAATGACGCCATTA ACGCAGAACGGCTGATTTGCTTCATACTTACTCCTATCGATACATGTCCAGATGAAAAGCGAGCCCCAATTTTACTTTTATTCCGCGATTGCGCAAATAAAAGGATTTCCTAACCGATATCCAGGCCGTATAATGACGCCATTATGGCAAAGAAAAAATCAAAACAAAA p_0022 CDS_0082 p_0015 p_0015 1881 160 AAGATAAAT 3 1.0 poor intergenic + TATTAACTGATAATAAAGAGTATAAGTATTGATTTAACTTATATTATTGTCAGTTAAGATAAATAAAGGAA 83 154 Vnat|691.131|2229248|2231566 CDS_0082 intergenic 1876 2041 - up TTGTTCGCTCAACGATTTGTCGGGCAATGTTTTCGTTTAACTGCATACTCGTTTTATAAACCCAGCTCTAGTGGTGGTTTAGCGAGGCATATTAACTGATAATAAAGAGTATAAGTATTGATTTAACTTATATTATTGTCAGTTAAGATAAATAAAGGAAATAGG TTGACCGAATGAGAGATGATTGTCATTGTTCGCTCAACGATTTGTCGGGCAATGTTTTCGTTTAACTGCATACTCGTTTTATAAACCCAGCTCTAGTGGTGGTTTAGCGAGGCATATTAACTGATAATAAAGAGTATAAGTATTGATTTAACTTATATTATTGTCAGTTAAGATAAATAAAGGAAATAGGATGGACTACGAATTTAAGAAAAACA p_0015 CDS_0083 p_0014 p_0014 1950 74 CTTTATTAT 3 0.93 poor intergenic + ATTTCCTTTATTTATCTTAACTGACAATAATATAAGTTAAATCAATACTTATACTCTTTATTATCAGTTAA 2 73 Vnat|691.131|2229248|2231566 CDS_0083 intergenic 1876 2041 + up CCTATTTCCTTTATTTATCTTAACTGACAATAATATAAGTTAAATCAATACTTATACTCTTTATTATCAGTTAATATGCCTCGCTAAACCACCACTAGAGCTGGGTTTATAAAACGAGTATGCAGTTAAACGAAAACATTGCCCGACAAATCGTTGAGCGAACAA TGTTTTTCTTAAATTCGTAGTCCATCCTATTTCCTTTATTTATCTTAACTGACAATAATATAAGTTAAATCAATACTTATACTCTTTATTATCAGTTAATATGCCTCGCTAAACCACCACTAGAGCTGGGTTTATAAAACGAGTATGCAGTTAAACGAAAACATTGCCCGACAAATCGTTGAGCGAACAATGACAATCATCTCTCATTCGGTCAA p_0014 CDS_0106 p_0019 p_0019 2008 261 ATGATTTTA 3 0.74 poor intergenic + TGTAGTGGCCAATTATCAACCAAATAATGGATATTGCAAGAATTGAGCGCGAGTTATGATTTTAGACGTGG 187 258 Vnat|691.131|4135683|4138304 CDS_0106 intergenic 1747 2088 + up TCACTTTTGAGGCGCGCATCATAATCACCAAAATTGTGAAATCAAAGCATTTTTTAGTCTCGAATCAGAAAAAATTTTACGGGCAAAAGTCATCATTCCTTACCATACTGTTTTAAAAAGATTCGTCCGAATTTCAACAGCGTTTATAAGGGTTACAACTCTGCAACAATTGTTTTCAATTTCATGGCCTTGTAGTGGCCAATTATCAACCAAATAATGGATATTGCAAGAATTGAGCGCGAGTTATGATTTTAGACGTGGCTAGAATTCTTTATAATGTCGGACACACTAATTGACTGGTATCCCAGTAAAAATTTCACAAGTGAATCTTGGATAATATA CGCCAATTGATGTGACTTTAGCCATTCACTTTTGAGGCGCGCATCATAATCACCAAAATTGTGAAATCAAAGCATTTTTTAGTCTCGAATCAGAAAAAATTTTACGGGCAAAAGTCATCATTCCTTACCATACTGTTTTAAAAAGATTCGTCCGAATTTCAACAGCGTTTATAAGGGTTACAACTCTGCAACAATTGTTTTCAATTTCATGGCCTTGTAGTGGCCAATTATCAACCAAATAATGGATATTGCAAGAATTGAGCGCGAGTTATGATTTTAGACGTGGCTAGAATTCTTTATAATGTCGGACACACTAATTGACTGGTATCCCAGTAAAAATTTCACAAGTGAATCTTGGATAATATATGAACAACGACTTTGAGAACGATTT p_0019 CDS_0012 p_0026 p_0026 2160 134 TGTAAATTA 3 1.0 poor intergenic + CGAATGGCCAAAAACATTAAACCACGAACTTCAAAGGGTTAATATATTCTTTCTTTGTAAATTAGAAATTG 63 134 Vnat|691.131|600446|602962 CDS_0012 intergenic 2091 2294 - up TATACTTTCCCGTTGGATCATCTGCAGCGATTTAACAGAATTCAATATTCCTACCATTATAGGCGAATGGCCAAAAACATTAAACCACGAACTTCAAAGGGTTAATATATTCTTTCTTTGTAAATTAGAAATTGGTCAATTATATTAGACCTCTTACCAGTTACATTTTAGTAACATAAATCGCGCAGAGAGCAGGGATTGCA TTCAGCGCCTGATTATTATCTGACATATACTTTCCCGTTGGATCATCTGCAGCGATTTAACAGAATTCAATATTCCTACCATTATAGGCGAATGGCCAAAAACATTAAACCACGAACTTCAAAGGGTTAATATATTCTTTCTTTGTAAATTAGAAATTGGTCAATTATATTAGACCTCTTACCAGTTACATTTTAGTAACATAAATCGCGCAGAGAGCAGGGATTGCAATGGATAAGCGGATTGCCAAAATTT p_0026 CDS_0013 p_0025 p_0025 2223 132 TGGTTTAAT 3 1.0 poor intergenic + TAATTGACCAATTTCTAATTTACAAAGAAAGAATATATTAACCCTTTGAAGTTCGTGGTTTAATGTTTTTG 61 132 Vnat|691.131|600446|602962 CDS_0013 intergenic 2091 2294 + up TGCAATCCCTGCTCTCTGCGCGATTTATGTTACTAAAATGTAACTGGTAAGAGGTCTAATATAATTGACCAATTTCTAATTTACAAAGAAAGAATATATTAACCCTTTGAAGTTCGTGGTTTAATGTTTTTGGCCATTCGCCTATAATGGTAGGAATATTGAATTCTGTTAAATCGCTGCAGATGATCCAACGGGAAAGTATA AAATTTTGGCAATCCGCTTATCCATTGCAATCCCTGCTCTCTGCGCGATTTATGTTACTAAAATGTAACTGGTAAGAGGTCTAATATAATTGACCAATTTCTAATTTACAAAGAAAGAATATATTAACCCTTTGAAGTTCGTGGTTTAATGTTTTTGGCCATTCGCCTATAATGGTAGGAATATTGAATTCTGTTAAATCGCTGCAGATGATCCAACGGGAAAGTATATGTCAGATAATAATCAGGCGCTGAA p_0025 CDS_0117 p_0023 p_0023 3587 98 TGGAAAAAT 3 1.0 poor intergenic + GGGTAAATACCTGAGTAAAATGGTCAGATAAATACTTGACTAAAACACTCGGGTATGGAAAAATCATAATC 28 99 Vnat|691.131|4363963|4367975 CDS_0117 intergenic 3559 3685 - up AGTGAAAAATAGCCACCTATAGTGTAAGGGTAAATACCTGAGTAAAATGGTCAGATAAATACTTGACTAAAACACTCGGGTATGGAAAAATCATAATCATTACAAACCATGTGGATACGGTGTGGT TGACCTCAATAGAGAAGAAGCGCTGAGTGAAAAATAGCCACCTATAGTGTAAGGGTAAATACCTGAGTAAAATGGTCAGATAAATACTTGACTAAAACACTCGGGTATGGAAAAATCATAATCATTACAAACCATGTGGATACGGTGTGGTATGAAACTTACATCTAAAGGAAGAT p_0023 CDS_0034 p_0002 p_0002 6481 79 TATTAATCA 2 0.82 poor intergenic + TTTTTGTCGGCTTTACGACAATGTCAGCTTTTATCTTTGTTGGTATCTTTATTAATCAATAGGTTATAGGT 8 79 Vnat|691.131|1238336|1257198 CDS_0034 intergenic 6402 6485 + up CGGCGCGTTTTTTGTCGGCTTTACGACAATGTCAGCTTTTATCTTTGTTGGTATCTTTATTAATCAATAGGTTATAGGTGGAA TTTGGTTGTCGCTCTCCACGAATAGCGGCGCGTTTTTTGTCGGCTTTACGACAATGTCAGCTTTTATCTTTGTTGGTATCTTTATTAATCAATAGGTTATAGGTGGAATGGCGCTTGCAGCTAACAAAGTGTT p_0002 CDS_0057 p_0007 p_0007 6626 263 TAGCACTGT 1 0.58 poor intergenic + TAGCACTGTATTGACGGGGTTGTTTGATTCATTCCAGTGCAAAAACGCTCCGTGGCATACGCTATGCACCA 192 263 Vnat|691.131|1269495|1283072 CDS_0057 intergenic 6363 6659 + up ACGTCTTTCCTTATACGTTTGGCGATATAAGACCGTCGATGCATTTCCTATTCCAAACACTCAAGCCAGGTATGACGGGCCCGCTTAAATGAAGGTTTGTTTGATTTCGGACAATTATTCATGCGAACAAGCGAACTTTGTTGGGTTTGTGACACAGCTATTTTGGTAAAGAAAAGCGCTTAGCCTGCGCGCTAGCACTGTATTGACGGGGTTGTTTGATTCATTCCAGTGCAAAAACGCTCCGTGGCATACGCTATGCACCACCTTCGAGAAAGGAAGCTAGTGGAGTGCTGTTA 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