chrom Lstart Lend Lstem Rstart Rend Rstem loop match% Indels score AT GC ATpairs GCpairs GTpairs Center Lseq Rseq intergenic tailL tailR polyTL polyTR strand TTseq FACoPscore locus_tag type start end strand_y stream seq aug_seq 3primeUTR 3primeUTRlen ID NC_nif_cluster_-_CP001037 5012 5021 10 5028 5037 10 6 80 0 10 90 10 100 0 0 5024 AATAACTAAT ATTAAGTATT True AAGTGACCA TTGTGCAAT False True + AATAACTAAT GACAAA ATTAAGTATT TTGTGCAAT 28 CDS_0009 intergenic 4861 5029 - down ATTTTGTCATTAGTTATTGGTCACTTGTACTGAGCGACTTGCCTTGAGCGAAGTCGAAAGGAGCCGAAGTATTAGTCATTAGTGAATAACAAAGGACAAATGACGAAGGACAAATGACAACCTACACCTGAAATCAGAACAACTAATCGCTACAAATCAGGAGACTTA CCACGGGTATTGCACAAAATACTTAATTTTGTCATTAGTTATTGGTCACTTGTACTGAGCGACTTGCCTTGAGCGAAGTCGAAAGGAGCCGAAGTATTAGTCATTAGTGAATAACAAAGGACAAATGACGAAGGACAAATGACAACCTACACCTGAAATCAGAACAACTAATCGCTACAAATCAGGAGACTTAATGGCCGTTATTTTATCAGAAAAAG TAAGTCTCCTGATTTGTAGCGATTAGTTGTTCTGATTTCAGGTGTAGGTTGTCATTTGTCCTTCGTCATTTGTCCTTTGTTATTCACTAATGACTAATACTTCGGCTCCTTTCGACTTCGCTCAAGGCAAGTCGCTCAGTACAAGTGACCAATAACTAATGACAAAATTAAGTATT 176 TTerm_0001 NC_nif_cluster_-_CP001037 31373 31379 7 31386 31392 7 6 100 0 14 71 28 71 28 0 31382 GCTAAAA TTTTAGC True TACAAACTG TTTTGTTTA False True + GCTAAAA AATTAG TTTTAGC TTTTGTTTA 36 CDS_0037 intergenic 31143 31569 + down GTATGTTCCTTCCTTTTCCTACATCTGGTTTTCTTTTGAGGATTCTGGATTGGCAAAGCGAACGGCATATTTGGGCGTGGCTCTCTTTTTTTAGATTGCCATTGAGCAATTTGAGAAAAGTAACACCAATCTTAATCCAGCTTTGGAGAAGCTTTTGCCCGCACCGGAACTGTAAAAACCTGCACTGGCAGAGTAAATAAATCTTTTGTATTATATAGTATTACAAACTGCTAAAAAATTAGTTTTAGCTTTTGTTTAAAGGGTTGTAAAGCCTAAGAACCTCAAAATTAATTCTGTCTACTCCAGTAGTTAAGCTGTGATACACAGGTGGTATTTGAGTTCAAGCAAGGTTATAAATGTGTTGTTCTAATTTTTTTAGCTAGTTGTAATCGCCTAGCTTACTTAAGCTATCACACAAATTATTTA GCAACTGTATCTCTCCCTAACTTGAGTATGTTCCTTCCTTTTCCTACATCTGGTTTTCTTTTGAGGATTCTGGATTGGCAAAGCGAACGGCATATTTGGGCGTGGCTCTCTTTTTTTAGATTGCCATTGAGCAATTTGAGAAAAGTAACACCAATCTTAATCCAGCTTTGGAGAAGCTTTTGCCCGCACCGGAACTGTAAAAACCTGCACTGGCAGAGTAAATAAATCTTTTGTATTATATAGTATTACAAACTGCTAAAAAATTAGTTTTAGCTTTTGTTTAAAGGGTTGTAAAGCCTAAGAACCTCAAAATTAATTCTGTCTACTCCAGTAGTTAAGCTGTGATACACAGGTGGTATTTGAGTTCAAGCAAGGTTATAAATGTGTTGTTCTAATTTTTTTAGCTAGTTGTAATCGCCTAGCTTACTTAAGCTATCACACAAATTATTTATGCAAATCACTATGTGGGAAACGTT GTATGTTCCTTCCTTTTCCTACATCTGGTTTTCTTTTGAGGATTCTGGATTGGCAAAGCGAACGGCATATTTGGGCGTGGCTCTCTTTTTTTAGATTGCCATTGAGCAATTTGAGAAAAGTAACACCAATCTTAATCCAGCTTTGGAGAAGCTTTTGCCCGCACCGGAACTGTAAAAACCTGCACTGGCAGAGTAAATAAATCTTTTGTATTATATAGTATTACAAACTGCTAAAAAATTAGTTTTAGC 249 TTerm_0002 NC_nif_cluster_-_CP001037 52826 52832 7 52840 52846 7 7 100 0 14 85 14 85 14 0 52835 TAAATCT AGATTTA True ATAAGATTT TAAAATTTT False True + TAAATCT GGAAACG AGATTTA TAAAATTTT 36 CDS_0055 intergenic 52474 53029 + down GGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCCATTAATGAGCCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCTATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGAACTCCATTAACGAATTTTTAGATACCTCATTCCCAGTCTATGGCTGGGAATGACTATTGGTAGGCTCCGCCTTCCAAATTTGCAGCAGAGCCGCAATGAAGCAGATTTTCAGGTTCTACCTAAAAATAAGATTTAAATCTGGAAACGAGATTTATAAAATTTTGGCGATCGCTATTCTCGTACATCTATATAATAAGAAAACAGTCGCTACGAGCTATAACTATATTTTGAAACGTATATCTGCATACAGACAGCAAATCCTAAAAGAAAATAAAGAAACCTGTCTTTCGCTCAACTCAATAATAGGATACTAATAGTAGTAGCATATACAAAAAAT GGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCCATTAATGAGCCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCTATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGAACTCCATTAACGAATTTTTAGATACCTCATTCCCAGTCTATGGCTGGGAATGACTATTGGTAGGCTCCGCCTTCCAAATTTGCAGCAGAGCCGCAATGAAGCAGATTTTCAGGTTCTACCTAAAAATAAGATTTAAATCTGGAAACGAGATTTA 372 TTerm_0003 NC_nif_cluster_-_CP001037 52826 52832 7 52840 52846 7 7 100 0 14 85 14 85 14 0 52835 TAAATCT AGATTTA True ATAAGATTT TAAAATTTT False True + TAAATCT GGAAACG AGATTTA TAAAATTTT 36 CDS_0056 intergenic 52474 53029 - down ATTTTTTGTATATGCTACTACTATTAGTATCCTATTATTGAGTTGAGCGAAAGACAGGTTTCTTTATTTTCTTTTAGGATTTGCTGTCTGTATGCAGATATACGTTTCAAAATATAGTTATAGCTCGTAGCGACTGTTTTCTTATTATATAGATGTACGAGAATAGCGATCGCCAAAATTTTATAAATCTCGTTTCCAGATTTAAATCTTATTTTTAGGTAGAACCTGAAAATCTGCTTCATTGCGGCTCTGCTGCAAATTTGGAAGGCGGAGCCTACCAATAGTCATTCCCAGCCATAGACTGGGAATGAGGTATCTAAAAATTCGTTAATGGAGTTCAAAGCCTCATTAATGGAGTTCAGAGACTCATTAATGAGTATCAAAGCCTCATTAATGGAGTTCAGAGACTCATTAATAGAGTTCAAAGGTTCATTAATGGGGTTCAAAGACTCATTAATGAGTATCAAAGCCTCATTAATGGAGTTCAGAGGCTCATTAATGGAGTTCAAAGGTTCATTAATGGGGTTCAAAGACTCATTAATGAGTATCAAAGCC GGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCCATTAATGAGCCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTTTGAACCCCATTAATGAACCTTTGAACTCTATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGATACTCATTAATGAGTCTCTGAACTCCATTAATGAGGCTTTGAACTCCATTAACGAATTTTTAGATACCTCATTCCCAGTCTATGGCTGGGAATGACTATTGGTAGGCTCCGCCTTCCAAATTTGCAGCAGAGCCGCAATGAAGCAGATTTTCAGGTTCTACCTAAAAATAAGATTTAAATCTGGAAACGAGATTTA 372 TTerm_0004 NC_nif_cluster_-_CP001037 58069 58079 11 58088 58098 11 8 81 0 12 81 18 88 11 0 58083 AAAAACTCATG CATTATTTTTT True ACTTATTCA CTGACAAAA True True + AAAAACTCATG ATTCCAGC CATTATTTTTT CTGACAAAA 32 CDS_0065 intergenic 57892 58180 + down CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTC TAGTGGTTCGTCTACTTGTGTTTGACAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTCTATGCTAATTTCTTGCGTCGCTTGC CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTT 206 TTerm_0005 NC_nif_cluster_-_CP001037 58069 58079 11 58088 58098 11 8 81 0 12 81 18 88 11 0 58083 AAAAACTCATG CATTATTTTTT True ACTTATTCA CTGACAAAA True True + AAAAACTCATG ATTCCAGC CATTATTTTTT CTGACAAAA 32 CDS_0066 intergenic 57892 58180 - down GAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTG GCAAGCGACGCAAGAAATTAGCATAGAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTGTCAAACACAAGTAGACGAACCACTA CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTT 206 TTerm_0006 NC_nif_cluster_-_CP001037 58091 58098 8 58104 58111 8 5 87 0 11 93 6 100 0 0 58100 TATTTTTT AAAAAGTA True CCAGCCATT GCCTTTTAT False True + TATTTTTT CTGAC AAAAAGTA GCCTTTTAT 30 CDS_0065 intergenic 57892 58180 + down CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTC TAGTGGTTCGTCTACTTGTGTTTGACAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTCTATGCTAATTTCTTGCGTCGCTTGC CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTA 219 TTerm_0007 NC_nif_cluster_-_CP001037 58091 58098 8 58104 58111 8 5 87 0 11 93 6 100 0 0 58100 TATTTTTT AAAAAGTA True CCAGCCATT GCCTTTTAT False True + TATTTTTT CTGAC AAAAAGTA GCCTTTTAT 30 CDS_0066 intergenic 57892 58180 - down GAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTG GCAAGCGACGCAAGAAATTAGCATAGAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTGTCAAACACAAGTAGACGAACCACTA CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTA 219 TTerm_0008 NC_nif_cluster_-_CP001037 54642 54665 24 54672 54695 24 6 70 0 13 81 18 88 11 0 54668 ATTGGAATTTCTGATTTTTAAGTT AAATTAAGAAATTGAAAGTTCAAT True AAATAAAAA CATTTATGG True False - ATTGAACTTTCAATTTCTTAATTT GGGAAA AACTTAAAAATCAGAAATTCCAAT TTTTTATTT 26 CDS_0058 intergenic 54415 54701 + down ATCTTCTAATTAATCTTGAATTCATGACGCAATCACTGAACTTTATCCTTTTTGTTCATGGATGCACAAAGCTCAAATAGCTTTAGAGTTTGAAGCTACTGTATGCTTGCAGAATTTATTGCAGACTGAGATGGATTAGATAAGGTTTAGATTTTTTTCCTTATGCTAAATCTGAAATTCTCCTGACATATAGCAACAATTAAAAATTCGGAATTCCCAAATAAAAATTGGAATTTCTGATTTTTAAGTTTTTCCCAAATTAAGAAATTGAAAGTTCAATCATTTA CTGGTATTACAGCGATGAATCATGAATCTTCTAATTAATCTTGAATTCATGACGCAATCACTGAACTTTATCCTTTTTGTTCATGGATGCACAAAGCTCAAATAGCTTTAGAGTTTGAAGCTACTGTATGCTTGCAGAATTTATTGCAGACTGAGATGGATTAGATAAGGTTTAGATTTTTTTCCTTATGCTAAATCTGAAATTCTCCTGACATATAGCAACAATTAAAAATTCGGAATTCCCAAATAAAAATTGGAATTTCTGATTTTTAAGTTTTTCCCAAATTAAGAAATTGAAAGTTCAATCATTTATGGCGACTCGGAACAGAGATATAAA TAAATGATTGAACTTTCAATTTCTTAATTTGGGAAAAACTTAAAAATCAGAAATTCCAA 59 TTerm_0009 NC_nif_cluster_-_CP001037 58069 58079 11 58088 58098 11 8 81 0 12 81 18 88 11 0 58083 AAAAACTCATG CATTATTTTTT True ACTTATTCA CTGACAAAA True True - AAAAAATAATG GCTGGAAT CATGAGTTTTT TGAATAAGT 32 CDS_0065 intergenic 57892 58180 + down CAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTC TAGTGGTTCGTCTACTTGTGTTTGACAAATTTTATAAGCGTTACCGAGATTATTTGGAGAATAGCCTGATTAGTTTTTGTATTTGGTAACTATCTTAAAAAAAATGCCCTTGCTAGAAACTAAGGGCATTGAAGTTTACCTATTTAATGTTTAATGAGTAAATCTATATAGATTGGGATACTTTTCGCTTAATACTTATTCAAAAACTCATGATTCCAGCCATTATTTTTTCTGACAAAAAGTAGCCTTTTATTTTGTCTATAATCACTGAAAATAAATCAAGCCGTATTGCGAATAGTCCCCACACAATTTCTATGCTAATTTCTTGCGTCGCTTGC GAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTT 111 TTerm_0010 NC_nif_cluster_-_CP001037 58069 58079 11 58088 58098 11 8 81 0 12 81 18 88 11 0 58083 AAAAACTCATG CATTATTTTTT True ACTTATTCA CTGACAAAA True True - AAAAAATAATG GCTGGAAT CATGAGTTTTT TGAATAAGT 32 CDS_0066 intergenic 57892 58180 - down GAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTG GCAAGCGACGCAAGAAATTAGCATAGAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTTTGAATAAGTATTAAGCGAAAAGTATCCCAATCTATATAGATTTACTCATTAAACATTAAATAGGTAAACTTCAATGCCCTTAGTTTCTAGCAAGGGCATTTTTTTTAAGATAGTTACCAAATACAAAAACTAATCAGGCTATTCTCCAAATAATCTCGGTAACGCTTATAAAATTTGTCAAACACAAGTAGACGAACCACTA GAAATTGTGTGGGGACTATTCGCAATACGGCTTGATTTATTTTCAGTGATTATAGACAAAATAAAAGGCTACTTTTTGTCAGAAAAAATAATGGCTGGAATCATGAGTTTT 111 TTerm_0011