chrom ID TSS locus_tag min10seq min10score strand score class promoterSeq locus_tag_intergenic startIntergenic endIntergenic Pa p_0007 4646 p_0007 AAGTAAAAT 3 - 1.0 intergenic TAAAAGTAACATCTTCCACAAGATAGTTAATGCGTGGTTAAAGCCACTAAATTTTAAGTAAAATAACAGCA CDS_0003 4563 5001 Pa p_0003 4702 p_0003 ATTAACTAT 2 + 1.0 intergenic CTAAGCAGTTATTTATGCTGTTATTTTACTTAAAATTTAGTGGCTTTAACCACGCATTAACTATCTTGTGG CDS_0004 4563 5001 Pa p_0004 4836 p_0004 AAGGAGTCA 1 + 0.24 intergenic AAGGAGTCAGCTTGGGTTTAAATTGATCTAAATCATCATTGTTCTCTCCCAAACCCGATACTCTTTCTCTG CDS_0004 4563 5001 Pa p_0006 4847 p_0006 TCGAAATAA 3 - 1.0 intergenic TACGGGAATAAAGCAGCGGTTTTTCAATTGTTTACTAAAAGAGCTTCTCTCTGTTTCGAAATAATGAGACC CDS_0003 4563 5001 Pa p_0005 4953 p_0005 TGGCTATAC 2 + 0.97 intergenic AGTAAACAATTGAAAAACCGCTGCTTTATTCCCGTAAACCGTGCCGTTTGCACCATGGCTATACTCAGGGA CDS_0004 4563 5001 Pa p_0012 8575 p_0012 TGGTAAAAT 3 - 1.0 intergenic GATGCTAATCTGAACAGCATAAGGTGAAAATCCCCCCAGCAGCAACCTGTAGATATGGTAAAATCGGCCCT CDS_0005 8544 8961 Pa p_0008 8635 p_0008 TCACCTTAT 1 + 0.98 intergenic GATGAAAAAACAGGGCCGATTTTACCATATCTACAGGTTGCTGCTGGGGGGATTTTCACCTTATGCTGTTC CDS_0006 8544 8961 Pa p_0009 8756 p_0009 TTTTTATAC 2 + 1.0 intergenic GGTCTTTAGGTCAGGATAAATATTAAAGCACATGTGTGATTAAACATTATTTTTATACCGATAATGTATCA CDS_0006 8544 8961 Pa p_0011 8868 p_0011 ATTAAATTA 3 - 1.0 intergenic AATAGGAGAGTTGTTCTGCCCGCTAATAGTAGTGGTGGAGAAAAATAAGTTCAACATTAAATTAATTTTTT CDS_0005 8544 8961 Pa p_0010 8880 p_0010 AGCTAAAAA 3 + 1.0 intergenic CACACGTCATCGGGGTGAATTAATAATTTAATAAATTCCTCGCTTACTCTTTTTAAGCTAAAAAATTAATT CDS_0006 8544 8961