chrom	Lstart	Lend	Lstem	Rstart	Rend	Rstem	loop	match%	Indels	score	AT	GC	ATpairs	GCpairs	GTpairs	Center	Lseq	Rseq	intergenic	tailL	tailR	polyTL	polyTR	strand	TTseq	FACoPscore	locus_tag	type	start	end	strand_y	stream	seq	aug_seq	3primeUTR	3primeUTRlen	ID
rs04870	1570	1589	20	1594	1613	20	4	80	0	20	70	30	68	31	0	1591	TAAAATCAGTAGGCTGTCTT	AAGACAGTCTTTTGTTTTTA	True	AATTATAAT	AAACATCCC	True	True	+	TAAAATCAGTAGGCTGTCTT GTAT AAGACAGTCTTTTGTTTTTA AAACATCCC	56	CDS_0001	intergenic	1506	1896	+	down	AATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAA	TTCACAAAATCTTTACTATAGTTAAAATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAATGAAACATTATAGAAAAATAATTCA	AATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTA	107	TTerm_0001
rs04870	3005	3026	22	3035	3056	22	8	86	0	29	75	25	78	21	0	3030	ATGAAATAACACTAGCTTTAAT	ATTGAGGCTAGTGTTATTTTAT	True	TTGTTTAAA	GAATATTTT	False	True	+	ATGAAATAACACTAGCTTTAAT ACTATATA ATTGAGGCTAGTGTTATTTTAT GAATATTTT	74	CDS_0002	intergenic	2993	3249	+	down	GTTTTGTTTAAATGAAATAACACTAGCTTTAATACTATATAATTGAGGCTAGTGTTATTTTATGAATATTTTTATACTTTTTGTTTTTTGACATTATATACTATATATAAATACTTTATATTTGTAGCAATATTCAGACAAATAGTGACCTAAAAATCGTACTTTGTTTACATAAATAAAATAGTATGATATAATTATAAAAACAACTTATAATATTGGAGAAGGTTGCTTGTTCGAAAAAGGGGATGATAAATTA	ATACATGGATAGTATTCAAATGTGAGTTTTGTTTAAATGAAATAACACTAGCTTTAATACTATATAATTGAGGCTAGTGTTATTTTATGAATATTTTTATACTTTTTGTTTTTTGACATTATATACTATATATAAATACTTTATATTTGTAGCAATATTCAGACAAATAGTGACCTAAAAATCGTACTTTGTTTACATAAATAAAATAGTATGATATAATTATAAAAACAACTTATAATATTGGAGAAGGTTGCTTGTTCGAAAAAGGGGATGATAAATTATGATAGAGATAAGAAATGTAACAAA	GTTTTGTTTAAATGAAATAACACTAGCTTTAATACTATATAATTGAGGCTAGTGTTATTTTAT	63	TTerm_0002
rs04870	6037	6044	8	6051	6058	8	6	87	0	11	87	12	85	14	0	6047	AAAAAAGA	TCTTTATT	True	TCAACAATA	TTGAGACAG	False	True	+	AAAAAAGA AGCTTA TCTTTATT TTGAGACAG	30	CDS_0004	intergenic	5925	6259	+	down	AAAATTAATAGTTTATATCAAAAATTTAAGGGAGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTATATGAAATCAAATATATTTTATCATTTCAACAATAAAAAAGAAGCTTATCTTTATTTTGAGACAGTCTCTTATTTTTATGTATACCAAAACCATACCTACGATTTTTATTTATAATTAAGTTTCAAATAGAATGAACAAGTACAACCAATTTTGAATATAAATATAGTAAATGTGCTTATATACGATTTTATTATCTGGGTGATTGATATTGATAGATAGCTTTCTTTATTGAATCGAAGGGAGGGGGAATTTGTTA	CTTAGTTAAAGAAGGCTTAGTATAAAAAATTAATAGTTTATATCAAAAATTTAAGGGAGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTATATGAAATCAAATATATTTTATCATTTCAACAATAAAAAAGAAGCTTATCTTTATTTTGAGACAGTCTCTTATTTTTATGTATACCAAAACCATACCTACGATTTTTATTTATAATTAAGTTTCAAATAGAATGAACAAGTACAACCAATTTTGAATATAAATATAGTAAATGTGCTTATATACGATTTTATTATCTGGGTGATTGATATTGATAGATAGCTTTCTTTATTGAATCGAAGGGAGGGGGAATTTGTTATGGATAACTATAAGAAAGTGAAGCA	AAAATTAATAGTTTATATCAAAAATTTAAGGGAGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTATATGAAATCAAATATATTTTATCATTTCAACAATAAAAAAGAAGCTTATCTTTATT	133	TTerm_0003
rs04870	1570	1589	20	1594	1613	20	4	80	0	20	70	30	68	31	0	1591	TAAAATCAGTAGGCTGTCTT	AAGACAGTCTTTTGTTTTTA	True	AATTATAAT	AAACATCCC	True	True	-	TAAAAACAAAAGACTGTCTT ATAC AAGACAGCCTACTGATTTTA ATTATAATT	56	CDS_0001	intergenic	1506	1896	+	down	AATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAA	TTCACAAAATCTTTACTATAGTTAAAATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAATGAAACATTATAGAAAAATAATTCA	TTATTATCACCTTTTAAAGTATAAATAGATTAATTTTATTTATATTACTTTTTAATTATACCAAACTTATGTTTCTTTTTGGTATTTTTTCATTATTTTCTTTATATATTCATATTTTCCATAAATAAAACCATCTATAATCCATTAACTTCAATATAATTTATAAAAAATCCTTAAAAACACTTGCAAAAACTATATAAAAGCTTTACAATAGGTATTCCAAGGAACTAAATTTAAAATTCCTTATGGATAACAGTATATATATTTAATTTATGGGATGTTTTAAAAACAAAAGACTGTCTTATACAAGACAGCCTACTGATTTT	326	TTerm_0004
rs04870	1853	1860	8	1870	1877	8	9	100	0	16	100	0	100	0	0	1864	TATAAATA	TATTTATA	True	AAAAGTAAT	CTTTAAAAG	True	False	-	TATAAATA GATTAATTT TATTTATA ATTACTTTT	32	CDS_0001	intergenic	1506	1896	+	down	AATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAA	TTCACAAAATCTTTACTATAGTTAAAATTATATAAAAAAATATGGGCTGTTTTAAAGTAATAGTTTGAGCAGTCCATTACAATTATAATAAAATCAGTAGGCTGTCTTGTATAAGACAGTCTTTTGTTTTTAAAACATCCCATAAATTAAATATATATACTGTTATCCATAAGGAATTTTAAATTTAGTTCCTTGGAATACCTATTGTAAAGCTTTTATATAGTTTTTGCAAGTGTTTTTAAGGATTTTTTATAAATTATATTGAAGTTAATGGATTATAGATGGTTTTATTTATGGAAAATATGAATATATAAAGAAAATAATGAAAAAATACCAAAAAGAAACATAAGTTTGGTATAATTAAAAAGTAATATAAATAAAATTAATCTATTTATACTTTAAAAGGTGATAATAATGAAACATTATAGAAAAATAATTCA	TTATTATCACCTTTTAAAGTATAAATAGATTAATTTTATTTAT	43	TTerm_0005
rs04870	5969	5975	7	5980	5986	7	4	100	0	14	71	28	71	28	0	5977	ATGAACT	AGTTCAT	True	GTCTCAAAA	GAGGCACTC	True	False	-	ATGAACT AAAA AGTTCAT TTTTGAGAC	44	CDS_0004	intergenic	5925	6259	+	down	AAAATTAATAGTTTATATCAAAAATTTAAGGGAGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTATATGAAATCAAATATATTTTATCATTTCAACAATAAAAAAGAAGCTTATCTTTATTTTGAGACAGTCTCTTATTTTTATGTATACCAAAACCATACCTACGATTTTTATTTATAATTAAGTTTCAAATAGAATGAACAAGTACAACCAATTTTGAATATAAATATAGTAAATGTGCTTATATACGATTTTATTATCTGGGTGATTGATATTGATAGATAGCTTTCTTTATTGAATCGAAGGGAGGGGGAATTTGTTA	CTTAGTTAAAGAAGGCTTAGTATAAAAAATTAATAGTTTATATCAAAAATTTAAGGGAGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTATATGAAATCAAATATATTTTATCATTTCAACAATAAAAAAGAAGCTTATCTTTATTTTGAGACAGTCTCTTATTTTTATGTATACCAAAACCATACCTACGATTTTTATTTATAATTAAGTTTCAAATAGAATGAACAAGTACAACCAATTTTGAATATAAATATAGTAAATGTGCTTATATACGATTTTATTATCTGGGTGATTGATATTGATAGATAGCTTTCTTTATTGAATCGAAGGGAGGGGGAATTTGTTATGGATAACTATAAGAAAGTGAAGCA	TAACAAATTCCCCCTCCCTTCGATTCAATAAAGAAAGCTATCTATCAATATCAATCACCCAGATAATAAAATCGTATATAAGCACATTTACTATATTTATATTCAAAATTGGTTGTACTTGTTCATTCTATTTGAAACTTAATTATAAATAAAAATCGTAGGTATGGTTTTGGTATACATAAAAATAAGAGACTGTCTCAAAATAAAGATAAGCTTCTTTTTTATTGTTGAAATGATAAAATATATTTGATTTCATATAAAAAAGAGTGCCTCATGAACTAAAAAGTTCA	290	TTerm_0006