chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0001 p_0002 p_0002 429 202 TAGACTAAA 2 0.05 poor intergenic + AAAATCTTTATTCCTTCTGTCCTCTGCTCTCAGCATAGATGTCTTATTTTCAGAGTAGACTAAAGATAAGC 128 199 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0001 intergenic 279 631 - up TTGTTATTGTCCTTAAGCTTGTAAATCGATTTTAACGTTGAAGCTTTGTAGATATTGAAAAATATGGGAGCATCCCAATTTTGCAACTGGAGTTTAGTGGGTCATGAACTTTCAGTTCAGCACTACAGATGAAAATCTTTATTCCTTCTGTCCTCTGCTCTCAGCATAGATGTCTTATTTTCAGAGTAGACTAAAGATAAGCGCTGAGAAAATAGCACGTAGAGAAGTATAGATAAAAAATTGACATAGCTGCTTAAGTGAAAAGTCCCTGAAAAGAAAAAGCGGTCAGCTATGTTGAACTGATCGCAAATTGGTCAATGCTGATAAAAGGAAAAATCGATTCAGCTTGACC AACTGATACTTTTCTAATGTTTCCATTGTTATTGTCCTTAAGCTTGTAAATCGATTTTAACGTTGAAGCTTTGTAGATATTGAAAAATATGGGAGCATCCCAATTTTGCAACTGGAGTTTAGTGGGTCATGAACTTTCAGTTCAGCACTACAGATGAAAATCTTTATTCCTTCTGTCCTCTGCTCTCAGCATAGATGTCTTATTTTCAGAGTAGACTAAAGATAAGCGCTGAGAAAATAGCACGTAGAGAAGTATAGATAAAAAATTGACATAGCTGCTTAAGTGAAAAGTCCCTGAAAAGAAAAAGCGGTCAGCTATGTTGAACTGATCGCAAATTGGTCAATGCTGATAAAAGGAAAAATCGATTCAGCTTGACCATGGGCAGTTGGGCATTACCCCTAT p_0002 CDS_0001 p_0001 p_0001 560 71 TGAAAAATA 4 0.76 poor intergenic + TTGTTATTGTCCTTAAGCTTGTAAATCGATTTTAACGTTGAAGCTTTGTAGATATTGAAAAATATGGGAGC 1 72 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0001 intergenic 279 631 - up TTGTTATTGTCCTTAAGCTTGTAAATCGATTTTAACGTTGAAGCTTTGTAGATATTGAAAAATATGGGAGCATCCCAATTTTGCAACTGGAGTTTAGTGGGTCATGAACTTTCAGTTCAGCACTACAGATGAAAATCTTTATTCCTTCTGTCCTCTGCTCTCAGCATAGATGTCTTATTTTCAGAGTAGACTAAAGATAAGCGCTGAGAAAATAGCACGTAGAGAAGTATAGATAAAAAATTGACATAGCTGCTTAAGTGAAAAGTCCCTGAAAAGAAAAAGCGGTCAGCTATGTTGAACTGATCGCAAATTGGTCAATGCTGATAAAAGGAAAAATCGATTCAGCTTGACC AACTGATACTTTTCTAATGTTTCCATTGTTATTGTCCTTAAGCTTGTAAATCGATTTTAACGTTGAAGCTTTGTAGATATTGAAAAATATGGGAGCATCCCAATTTTGCAACTGGAGTTTAGTGGGTCATGAACTTTCAGTTCAGCACTACAGATGAAAATCTTTATTCCTTCTGTCCTCTGCTCTCAGCATAGATGTCTTATTTTCAGAGTAGACTAAAGATAAGCGCTGAGAAAATAGCACGTAGAGAAGTATAGATAAAAAATTGACATAGCTGCTTAAGTGAAAAGTCCCTGAAAAGAAAAAGCGGTCAGCTATGTTGAACTGATCGCAAATTGGTCAATGCTGATAAAAGGAAAAATCGATTCAGCTTGACCATGGGCAGTTGGGCATTACCCCTAT p_0001 CDS_0014 p_0003 p_0003 19478 128 TATAGAAAT 2 1.0 poor intergenic + ATAATTTTATTCCACAAAAAGGGAGTTTTTTACAAAATTATTTGACTATCCGTCCTATAGAAATATGTCCC 51 122 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0014 intergenic 19424 19606 - up AACTATTTTTTCATAGTAATAATTGTGATGTATCAACTGATGAACTGAGCAGAATTCATAATTTTATTCCACAAAAAGGGAGTTTTTTACAAAATTATTTGACTATCCGTCCTATAGAAATATGTCCCTTTACCAGGATTTATGAATGTGGATTTTCTGGTCTTTAAGAAAGGAACAAACTA TAACTGCCGAACCAGCTGAAACTTGAACTATTTTTTCATAGTAATAATTGTGATGTATCAACTGATGAACTGAGCAGAATTCATAATTTTATTCCACAAAAAGGGAGTTTTTTACAAAATTATTTGACTATCCGTCCTATAGAAATATGTCCCTTTACCAGGATTTATGAATGTGGATTTTCTGGTCTTTAAGAAAGGAACAAACTAATGGTTAGCTATATTGAAAAGAGCG p_0003 CDS_0024 p_0006 p_0006 31712 87 ATCCAAAAT 2 0.96 poor intergenic + TCTCAAATCTCAAATCCAAAATTTCAAATCTAAACTCTAAAATCCAAAATCTCAAATCCAAAATCGA 10 81 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0024 intergenic 31716 31799 - up GAATCTGTGGAGTCAATCTCAAATCTCAAATCCAAAATTTCAAATCTAAACTCTAAAATCCAAAATCTCAAATCCAAAATCGA CTGTAAAAAAGCTTATGAATAAATAGAATCTGTGGAGTCAATCTCAAATCTCAAATCCAAAATTTCAAATCTAAACTCTAAAATCCAAAATCTCAAATCCAAAATCGAATGACTTCTATTTCTCATCACTTTG p_0006 CDS_0029 p_0007 p_0007 39532 73 AATTGAATA 2 0.9 poor intergenic + AAATTAAGTGTATAAATCAGGGTAAAACTACTCTTTGCTAAAGATAAAAAAGAGGAATTGAATACACTTAA 7 78 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0029 intergenic 39351 39605 - up ATAAATTAAGTGTATAAATCAGGGTAAAACTACTCTTTGCTAAAGATAAAAAAGAGGAATTGAATACACTTAAGTTCAAGTTTATGGGTGGGTCAATAAAAGCTCACCCACTACTTTGATTGTTGAAAAAATTTAGTAAACTTTCTATTACTTGTTCCCTGTTAAGAGTTTTGATTCAGAGTCTTTACGAGTAAGTTTATGGATCACATCTAAAGCTCATAGCTGATTATTTTACTTATAACGTGACTATTATT AAGCTGCTGATTTTGCTCTTGCTTAATAAATTAAGTGTATAAATCAGGGTAAAACTACTCTTTGCTAAAGATAAAAAAGAGGAATTGAATACACTTAAGTTCAAGTTTATGGGTGGGTCAATAAAAGCTCACCCACTACTTTGATTGTTGAAAAAATTTAGTAAACTTTCTATTACTTGTTCCCTGTTAAGAGTTTTGATTCAGAGTCTTTACGAGTAAGTTTATGGATCACATCTAAAGCTCATAGCTGATTATTTTACTTATAACGTGACTATTATTATGAAACTGAACCAAATTACTCATC p_0007 CDS_0032 p_0008 p_0008 42761 308 ATAAAATTT 3 1.0 poor intergenic + CAACTGAAAATTGATGGGTGCAGCCAGAATAAAGATTAAAGAGAAAAAACAAGGGATAAAATTTCTTTTCC 234 305 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0032 intergenic 42661 43069 - up GATAGAGCATTAGGTTACTCGGCTTTAGTCGTAGGTACTATAAATTAATCTAAACATTGAACAACCTCAAGCATTGGCAATAAAAATATGTGGGGATAGTGTAACTGAGTAACATATTGGTCTCCAAAACCAAAGAATCTAGGTTCAAATCCTAGTCCCCACGCTAGAGCATGAGGTTGCTCACTAACACCACCAGTTCTAAATCATAAATGCATAAATCTTTCAATAGTGTTTCACCAACTGAAAATTGATGGGTGCAGCCAGAATAAAGATTAAAGAGAAAAAACAAGGGATAAAATTTCTTTTCCCTTTACTCTACCAATGAAACTAGGAACTAGTGCAATGATACTTTTGCAATGCAGAGATTTTTGCTCAATTTAAGTACTAGTCACAAAGCATAGGTTTAAA TGATAACTTTTGACAGCAAGAGTTAGATAGAGCATTAGGTTACTCGGCTTTAGTCGTAGGTACTATAAATTAATCTAAACATTGAACAACCTCAAGCATTGGCAATAAAAATATGTGGGGATAGTGTAACTGAGTAACATATTGGTCTCCAAAACCAAAGAATCTAGGTTCAAATCCTAGTCCCCACGCTAGAGCATGAGGTTGCTCACTAACACCACCAGTTCTAAATCATAAATGCATAAATCTTTCAATAGTGTTTCACCAACTGAAAATTGATGGGTGCAGCCAGAATAAAGATTAAAGAGAAAAAACAAGGGATAAAATTTCTTTTCCCTTTACTCTACCAATGAAACTAGGAACTAGTGCAATGATACTTTTGCAATGCAGAGATTTTTGCTCAATTTAAGTACTAGTCACAAAGCATAGGTTTAAAATGACTCAAATTATCAATATCACTC p_0008 CDS_0033 p_0010 p_0010 44212 112 AAATATAAT 5 1.0 poor intergenic + CAGCTTTATATAAAATTGGTATAAGTCTGTTTATGATAAATAACATAACTATTTTAAATATAATTTTAAAT 41 112 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0033 intergenic 44040 44324 - up TTGTTCTTTTAATTTATCGAGTTTGTTTTCTCTATTATATGCAGCTTTATATAAAATTGGTATAAGTCTGTTTATGATAAATAACATAACTATTTTAAATATAATTTTAAATATTTTTAAAAAAGTACTTGTGTAACTATCATATTCTGTAACATCAAGTTAAATTGAGTAATGTAATAGCAGTAATTGCTTCATTTTTAAATATCTAAAAAATCATTTTTTCATGCTTTAAGTAGCAAAGATATATGTGAGATTTAATTAAATTAAACTCAATAATATATGGT ATTTCAATCTTAAAAGGGCGGCTCATTGTTCTTTTAATTTATCGAGTTTGTTTTCTCTATTATATGCAGCTTTATATAAAATTGGTATAAGTCTGTTTATGATAAATAACATAACTATTTTAAATATAATTTTAAATATTTTTAAAAAAGTACTTGTGTAACTATCATATTCTGTAACATCAAGTTAAATTGAGTAATGTAATAGCAGTAATTGCTTCATTTTTAAATATCTAAAAAATCATTTTTTCATGCTTTAAGTAGCAAAGATATATGTGAGATTTAATTAAATTAAACTCAATAATATATGGTATGAAATTAAAAATGATTAGTGAAA p_0010 CDS_0034 p_0009 p_0009 44240 200 ATTTAAAAT 3 1.0 poor intergenic + ATGTTACAGAATATGATAGTTACACAAGTACTTTTTTAAAAATATTTAAAATTATATTTAAAATAGTTATG 129 200 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0034 intergenic 44040 44324 + up ACCATATATTATTGAGTTTAATTTAATTAAATCTCACATATATCTTTGCTACTTAAAGCATGAAAAAATGATTTTTTAGATATTTAAAAATGAAGCAATTACTGCTATTACATTACTCAATTTAACTTGATGTTACAGAATATGATAGTTACACAAGTACTTTTTTAAAAATATTTAAAATTATATTTAAAATAGTTATGTTATTTATCATAAACAGACTTATACCAATTTTATATAAAGCTGCATATAATAGAGAAAACAAACTCGATAAATTAAAAGAACAA TTTCACTAATCATTTTTAATTTCATACCATATATTATTGAGTTTAATTTAATTAAATCTCACATATATCTTTGCTACTTAAAGCATGAAAAAATGATTTTTTAGATATTTAAAAATGAAGCAATTACTGCTATTACATTACTCAATTTAACTTGATGTTACAGAATATGATAGTTACACAAGTACTTTTTTAAAAATATTTAAAATTATATTTAAAATAGTTATGTTATTTATCATAAACAGACTTATACCAATTTTATATAAAGCTGCATATAATAGAGAAAACAAACTCGATAAATTAAAAGAACAATGAGCCGCCCTTTTAAGATTGAAAT p_0009 CDS_0037 p_0011 p_0011 47776 120 ATAAATATT 3 1.0 poor intergenic + TTTTTGAAAATTTTGAAAACTTTTGACAACATTTAAATAATATATTGAATAAATCATAAATATTTTATTTC 50 121 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0037 intergenic 47509 47896 - up ATTAAATAAAAACCATGCAATAGAAAGATAAATTATTGCTGGATATATATTTTTGAAAATTTTGAAAACTTTTGACAACATTTAAATAATATATTGAATAAATCATAAATATTTTATTTCGATATTGCATTATTAACAGACACAGAGATGTACAGATGTGTTCATAAATATCAGTGCAGATTAGTAAAAGAATAAGATTCTTTGTTTAGACAATTTCATAAAAATCCTGATATAAATTTTCGGATTTTTCTCCTACTAAATATATCAGAATCCCAGCTAAAATTTATTAGTCCATTGATGTGGACTCCTTTACTGTGTCCAAAATTTCAAATTCTTTATTTGTGAAAATACAATAAGTAAACTTTTCATCTTTATAGATAAGTATTT TTTGGTGTGGTAAGTTACTCGATTGATTAAATAAAAACCATGCAATAGAAAGATAAATTATTGCTGGATATATATTTTTGAAAATTTTGAAAACTTTTGACAACATTTAAATAATATATTGAATAAATCATAAATATTTTATTTCGATATTGCATTATTAACAGACACAGAGATGTACAGATGTGTTCATAAATATCAGTGCAGATTAGTAAAAGAATAAGATTCTTTGTTTAGACAATTTCATAAAAATCCTGATATAAATTTTCGGATTTTTCTCCTACTAAATATATCAGAATCCCAGCTAAAATTTATTAGTCCATTGATGTGGACTCCTTTACTGTGTCCAAAATTTCAAATTCTTTATTTGTGAAAATACAATAAGTAAACTTTTCATCTTTATAGATAAGTATTTATGATTAGAATTATTGCTATTGTTG p_0011 CDS_0040 p_0012 p_0012 50330 123 AAAATAAAT 3 0.94 poor intergenic + GGATTTCTCAAGGGAGGCGCAAAATTTCTTTTTGTGTATTTATACTTACAAAATAAATTAACATTTTATTA 52 123 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0040 intergenic 50207 50591 + up AAATTCAGAGTGATTTTATCATAAGTTGATGAGCGCAAGTTGCAGAAGACCAGGATTTCTCAAGGGAGGCGCAAAATTTCTTTTTGTGTATTTATACTTACAAAATAAATTAACATTTTATTAACCAGCAGATAGATTCATGATTTTATTTAAAAAGAGGATAATGCTTGATTAGAGGTGGTTAGTCAATCTAAACCTAACTATTACTGCTGCTGTCGTGGATGTGCTGTCCGTGACAGTTTTTTTTATTTTAATGCGATCGCCGACGAATATTATCTTTAATGCAACAGTGAGTATAGATTTTTATCTAAATAGTATAAATAACAAAAAAATACTGACAACTATCTATCTAGTCAAGTTGTCAGCAGTTTAAATACTAACCAA AACGATTAGCAGTATTTACTAGCAAAAATTCAGAGTGATTTTATCATAAGTTGATGAGCGCAAGTTGCAGAAGACCAGGATTTCTCAAGGGAGGCGCAAAATTTCTTTTTGTGTATTTATACTTACAAAATAAATTAACATTTTATTAACCAGCAGATAGATTCATGATTTTATTTAAAAAGAGGATAATGCTTGATTAGAGGTGGTTAGTCAATCTAAACCTAACTATTACTGCTGCTGTCGTGGATGTGCTGTCCGTGACAGTTTTTTTTATTTTAATGCGATCGCCGACGAATATTATCTTTAATGCAACAGTGAGTATAGATTTTTATCTAAATAGTATAAATAACAAAAAAATACTGACAACTATCTATCTAGTCAAGTTGTCAGCAGTTTAAATACTAACCAATGTTGTCTAATATTACTTGGGTAGC p_0012 CDS_0039 p_0013 p_0013 50446 145 ATTAAAATA 3 0.04 poor intergenic + TAGATAAAAATCTATACTCACTGTTGCATTAAAGATAATATTCGTCGGCGATCGCATTAAAATAAAAAAAA 73 144 GenomeAssembly_Hapalosiphon_welwitschii_UTEX_B1830_20240418_contig2_annotated CDS_0039 intergenic 50207 50591 - 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