chrom	Lstart	Lend	Lstem	Rstart	Rend	Rstem	loop	match%	Indels	score	AT	GC	ATpairs	GCpairs	GTpairs	Center	Lseq	Rseq	intergenic	tailL	tailR	polyTL	polyTR	strand	TTseq	FACoPscore	locus_tag	type	start	end	strand_y	stream	seq	aug_seq	3primeUTR	3primeUTRlen	ID
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	6081	6089	9	6094	6102	9	4	88	0	13	77	22	75	25	0	6091	TAAGATAAG	CTTTTCTTA	True	AGCGTGATT	TTTTAGAGT	False	True	+	TAAGATAAG AGAC CTTTTCTTA TTTTAGAGT	42	CDS_0007	intergenic	6083	6247	+	down	GATAAGAGACCTTTTCTTATTTTAGAGTTTTGGTTAAAACGGAAGAAAAGCTGGATCAAGATAAACAGGCAAGCACAATAACGAAACCTAAAAGAGGTTTATGCGAGCTTTGAAATGGCATAGAACAAGAAGAAAATTTACTTGCGTTGACTTGGAGAAAGGAA	GAGCCGCGTTTCGGAGCGTGATTAAGATAAGAGACCTTTTCTTATTTTAGAGTTTTGGTTAAAACGGAAGAAAAGCTGGATCAAGATAAACAGGCAAGCACAATAACGAAACCTAAAAGAGGTTTATGCGAGCTTTGAAATGGCATAGAACAAGAAGAAAATTTACTTGCGTTGACTTGGAGAAAGGAATGAAAAAATACGTGATTGTGGCTCT	GATAAGAGACCTTTTCTTA	19	TTerm_0001
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	6081	6090	10	6098	6107	10	7	90	0	15	85	15	88	11	0	6093	TAAGATAAGA	TCTTATTTTA	True	AGCGTGATT	GAGTTTTGG	False	True	+	TAAGATAAGA GACCTTT TCTTATTTTA GAGTTTTGG	38	CDS_0007	intergenic	6083	6247	+	down	GATAAGAGACCTTTTCTTATTTTAGAGTTTTGGTTAAAACGGAAGAAAAGCTGGATCAAGATAAACAGGCAAGCACAATAACGAAACCTAAAAGAGGTTTATGCGAGCTTTGAAATGGCATAGAACAAGAAGAAAATTTACTTGCGTTGACTTGGAGAAAGGAA	GAGCCGCGTTTCGGAGCGTGATTAAGATAAGAGACCTTTTCTTATTTTAGAGTTTTGGTTAAAACGGAAGAAAAGCTGGATCAAGATAAACAGGCAAGCACAATAACGAAACCTAAAAGAGGTTTATGCGAGCTTTGAAATGGCATAGAACAAGAAGAAAATTTACTTGCGTTGACTTGGAGAAAGGAATGAAAAAATACGTGATTGTGGCTCT	GATAAGAGACCTTTTCTTATTTTA	24	TTerm_0002
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	8550	8562	13	8568	8580	13	5	92	0	21	50	50	50	50	0	8564	AGCGCCCAAAATA	TATTGTGGGCGCT	True	GAATAAAAA	GAATTTTAT	True	True	+	AGCGCCCAAAATA TCGAG TATTGTGGGCGCT GAATTTTAT	50	CDS_0011	intergenic	8521	8611	+	down	TTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCTGAATTTTATCTGTAGTGCCTAATCGACGACT	CAATGCTAGGGCTTTGCAAAGTTGATTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCTGAATTTTATCTGTAGTGCCTAATCGACGACTTACTGTGTAAGTGGCTTAAGGTCTG	TTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCT	59	TTerm_0003
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	8550	8562	13	8568	8580	13	5	92	0	21	50	50	50	50	0	8564	AGCGCCCAAAATA	TATTGTGGGCGCT	True	GAATAAAAA	GAATTTTAT	True	True	+	AGCGCCCAAAATA TCGAG TATTGTGGGCGCT GAATTTTAT	50	CDS_0012	intergenic	8521	8611	-	down	AGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGCTTTTTATTCTGAGCGTTCTTGATAAACAA	CAGACCTTAAGCCACTTACACAGTAAGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGCTTTTTATTCTGAGCGTTCTTGATAAACAATCAACTTTGCAAAGCCCTAGCATTG	TTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCT	59	TTerm_0004
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	12186	12195	10	12203	12212	10	7	100	0	20	40	60	40	60	0	12198	AAAGCCTCCC	GGGAGGCTTT	True	TTCAATGGA	TCTTTTTTA	False	True	+	AAAGCCTCCC TTTAATT GGGAGGCTTT TCTTTTTTA	80	CDS_0015	intergenic	12152	12219	+	down	TTTGCATCCAATTAAAACCAAACTGTTCAATGGAAAGCCTCCCTTTAATTGGGAGGCTTTTCTTTTT	TGACTTTGTGAAGCGGTATGTTTGATTTGCATCCAATTAAAACCAAACTGTTCAATGGAAAGCCTCCCTTTAATTGGGAGGCTTTTCTTTTTTATGCAGTTATCTCTTTCTCATTAA	TTTGCATCCAATTAAAACCAAACTGTTCAATGGAAAGCCTCCCTTTAATTGGGAGGCTTT	60	TTerm_0005
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	12186	12195	10	12203	12212	10	7	100	0	20	40	60	40	60	0	12198	AAAGCCTCCC	GGGAGGCTTT	True	TTCAATGGA	TCTTTTTTA	False	True	+	AAAGCCTCCC TTTAATT GGGAGGCTTT TCTTTTTTA	80	CDS_0016	intergenic	12152	12219	-	down	AAAAAGAAAAGCCTCCCAATTAAAGGGAGGCTTTCCATTGAACAGTTTGGTTTTAATTGGATGCAAA	TTAATGAGAAAGAGATAACTGCATAAAAAAGAAAAGCCTCCCAATTAAAGGGAGGCTTTCCATTGAACAGTTTGGTTTTAATTGGATGCAAATCAAACATACCGCTTCACAAAGTCA	TTTGCATCCAATTAAAACCAAACTGTTCAATGGAAAGCCTCCCTTTAATTGGGAGGCTTT	60	TTerm_0006
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	18626	18641	16	18648	18663	16	6	100	0	32	75	25	75	25	0	18644	TTAAAAAATAGCACCA	TGGTGCTATTTTTTAA	True	TCAAATAAT	CAAGAAATT	True	True	+	TTAAAAAATAGCACCA CTTTGT TGGTGCTATTTTTTAA CAAGAAATT	96	CDS_0022	intergenic	18600	18796	+	down	TTATCCAGCAAAGCTGTTCAAATAATTAAAAAATAGCACCACTTTGTTGGTGCTATTTTTTAACAAGAAATTCATTAATTTAATAATTATAACAAGTTTATTTTCTCTTTATGTCAAATTATATGGTAGGGCTATCAAGTTAAAATAACATGGGGTACTATCCAGTAAAGAAATAATATTTATATATGCCCAGCGA	TAAAGCGTGGATTGAATTAAAGTAGTTATCCAGCAAAGCTGTTCAAATAATTAAAAAATAGCACCACTTTGTTGGTGCTATTTTTTAACAAGAAATTCATTAATTTAATAATTATAACAAGTTTATTTTCTCTTTATGTCAAATTATATGGTAGGGCTATCAAGTTAAAATAACATGGGGTACTATCCAGTAAAGAAATAATATTTATATATGCCCAGCGATGTCCGATAACGAACTGATCATCTT	TTATCCAGCAAAGCTGTTCAAATAATTAAAAAATAGCACCACTTTGTTGGTGCTATTTTTTAA	63	TTerm_0007
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	32218	32225	8	32234	32241	8	8	87	0	11	37	62	28	71	0	32229	AATGCGCC	GGCGCTTT	True	TTTGACCGA	TTTCGTTGA	False	True	+	AATGCGCC TCCTTGTG GGCGCTTT TTTCGTTGA	62	CDS_0034	intergenic	32142	32367	+	down	ATCTGGTTAAAGCAACAAGCCATTTTGCGGTTACCCTGAGCTTTCTCTGCAAAGAATTACTCACTTATTTGACCGAATGCGCCTCCTTGTGGGCGCTTTTTTCGTTGAATACTGACGCTTTGCTCAGTTATGAGAGCTCGTACTTTCAAACCGGACTTTTGTCCTGAAACTTTGTCCTGCTTCCTCATTATGATTGCGCCATCAGAACGAACGAGGAAAACATTA	GCGTATCCGCGGCATTCAAGAATAAATCTGGTTAAAGCAACAAGCCATTTTGCGGTTACCCTGAGCTTTCTCTGCAAAGAATTACTCACTTATTTGACCGAATGCGCCTCCTTGTGGGCGCTTTTTTCGTTGAATACTGACGCTTTGCTCAGTTATGAGAGCTCGTACTTTCAAACCGGACTTTTGTCCTGAAACTTTGTCCTGCTTCCTCATTATGATTGCGCCATCAGAACGAACGAGGAAAACATTATGACTGCTCATATCGCAGGTTCTGC	ATCTGGTTAAAGCAACAAGCCATTTTGCGGTTACCCTGAGCTTTCTCTGCAAAGAATTACTCACTTATTTGACCGAATGCGCCTCCTTGTGGGCGCTTT	99	TTerm_0008
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	40055	40065	11	40072	40082	11	6	90	0	17	45	54	40	60	0	40068	AATAGGGGCGA	TCGCCCCTTTT	True	TCAAAAATA	TGCGTTCAG	True	True	+	AATAGGGGCGA GTGAAT TCGCCCCTTTT TGCGTTCAG	74	CDS_0040	intergenic	39968	40184	+	down	GTCGCGTCAATGGTTAGCCAAGTAGGAGCGATGCCAAAGCAAGCTCGTGTCTAACAAGGCATTACTACGCTAGGTGATTCAAAAATAATAGGGGCGAGTGAATTCGCCCCTTTTTGCGTTCAGTTAGGGTCGTCTTAACCCAACCTTAACCTGACCCTTTTTAGTATCCACTCTCGAAAAAAGCGAAAATAATAACGAGCATGGAGAGTGGTAGCG	CAAGCTAACCAAAACTAAGCGTTAAGTCGCGTCAATGGTTAGCCAAGTAGGAGCGATGCCAAAGCAAGCTCGTGTCTAACAAGGCATTACTACGCTAGGTGATTCAAAAATAATAGGGGCGAGTGAATTCGCCCCTTTTTGCGTTCAGTTAGGGTCGTCTTAACCCAACCTTAACCTGACCCTTTTTAGTATCCACTCTCGAAAAAAGCGAAAATAATAACGAGCATGGAGAGTGGTAGCGTGACGGTTCTTATCGGTAGTCGATT	GTCGCGTCAATGGTTAGCCAAGTAGGAGCGATGCCAAAGCAAGCTCGTGTCTAACAAGGCATTACTACGCTAGGTGATTCAAAAATAATAGGGGCGAGTGAATTCGCCCCTTTT	114	TTerm_0009
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	42682	42696	15	42703	42717	15	6	86	0	20	50	50	46	53	0	42699	TAATACAACCCCTCG	CGAGGGGCTGTTTTA	True	CTTTTTGAT	AGCAAAGTA	False	True	+	TAATACAACCCCTCG ATTTAC CGAGGGGCTGTTTTA AGCAAAGTA	80	CDS_0043	intergenic	42665	42740	+	down	GTTCGACGCTTTTTGATAATACAACCCCTCGATTTACCGAGGGGCTGTTTTAAGCAAAGTACAAACGTGGAAGCT	TTTTATTGATTTTCTTCCAAATTAAGTTCGACGCTTTTTGATAATACAACCCCTCGATTTACCGAGGGGCTGTTTTAAGCAAAGTACAAACGTGGAAGCTTAACGAGAAATGATCTTGATTGAAC	GTTCGACGCTTTTTGATAATACAACCCCTCGATTTACCGAGGGGCTGTTTTA	52	TTerm_0010
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	42682	42696	15	42703	42717	15	6	86	0	20	50	50	46	53	0	42699	TAATACAACCCCTCG	CGAGGGGCTGTTTTA	True	CTTTTTGAT	AGCAAAGTA	False	True	+	TAATACAACCCCTCG ATTTAC CGAGGGGCTGTTTTA AGCAAAGTA	80	CDS_0044	intergenic	42665	42740	-	down	AGCTTCCACGTTTGTACTTTGCTTAAAACAGCCCCTCGGTAAATCGAGGGGTTGTATTATCAAAAAGCGTCGAAC	GTTCAATCAAGATCATTTCTCGTTAAGCTTCCACGTTTGTACTTTGCTTAAAACAGCCCCTCGGTAAATCGAGGGGTTGTATTATCAAAAAGCGTCGAACTTAATTTGGAAGAAAATCAATAAAA	GTTCGACGCTTTTTGATAATACAACCCCTCGATTTACCGAGGGGCTGTTTTA	52	TTerm_0011
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	64760	64769	10	64776	64785	10	6	100	0	20	40	60	40	60	0	64772	AAACGGGCTC	GAGCCCGTTT	True	CGAATAACA	TTGTTCTTG	False	True	+	AAACGGGCTC TTGACG GAGCCCGTTT TTGTTCTTG	80	CDS_0058	intergenic	64732	64929	+	down	TACTTTCTCTATATTTTAACGAATAACAAACGGGCTCTTGACGGAGCCCGTTTTTGTTCTTGTTTGATTAACGTAAATCGTGCTCAAAAGCTTTGCGGCTGTTATTATCACTCCGCAAAATTTACCGGTTTTGTTGCTCTGGTCAGAATTTCCATTTAGGCTTTGAGCAACTAGTTGTTTTGGGCGCACTTTATCTA	AAACCAACCCGACGCAAACAGCTAGTACTTTCTCTATATTTTAACGAATAACAAACGGGCTCTTGACGGAGCCCGTTTTTGTTCTTGTTTGATTAACGTAAATCGTGCTCAAAAGCTTTGCGGCTGTTATTATCACTCCGCAAAATTTACCGGTTTTGTTGCTCTGGTCAGAATTTCCATTTAGGCTTTGAGCAACTAGTTGTTTTGGGCGCACTTTATCTATGACCAACATCTTTATCATTGTTGT	TACTTTCTCTATATTTTAACGAATAACAAACGGGCTCTTGACGGAGCCCGTTT	53	TTerm_0012
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	65624	65634	11	65640	65650	11	5	100	0	22	54	45	54	45	0	65636	AGGCTTCAACT	AGTTGAAGCCT	True	ATAGAGAGA	TTTTTGTTT	False	True	+	AGGCTTCAACT GGATT AGTTGAAGCCT TTTTTGTTT	60	CDS_0059	intergenic	65591	65745	+	down	GCATTTTGTTCCCTAGATAGTGAAATAGAGAGAGGCTTCAACTGGATTAGTTGAAGCCTTTTTTGTTTTACCGTTGAACAAAGAAGAGCACTTCGCAGCATCCATTCTGGTAGCTCCTATACTTTGATAAAGAAAGAAGAATAGGGAAGCGTTA	GGTGTTTGATACCGAAGACGAATAAGCATTTTGTTCCCTAGATAGTGAAATAGAGAGAGGCTTCAACTGGATTAGTTGAAGCCTTTTTTGTTTTACCGTTGAACAAAGAAGAGCACTTCGCAGCATCCATTCTGGTAGCTCCTATACTTTGATAAAGAAAGAAGAATAGGGAAGCGTTATGCGATATGGATGGATTCTTTCAGC	GCATTTTGTTCCCTAGATAGTGAAATAGAGAGAGGCTTCAACTGGATTAGTTGAAGCCT	59	TTerm_0013
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	73968	73982	15	73992	74006	15	9	100	0	30	60	40	60	40	0	73986	AGAGTTTGAGTTTCG	CGAAACTCAAACTCT	True	GCTAGATAA	CTTTTTTGG	False	True	+	AGAGTTTGAGTTTCG TGAGATTTG CGAAACTCAAACTCT CTTTTTTGG	84	CDS_0068	intergenic	73957	74057	+	down	GCGCTAGATAAGAGTTTGAGTTTCGTGAGATTTGCGAAACTCAAACTCTCTTTTTTGGAAGGGGAAATTGGCAAGGGTGGCTAAGCTGAGAAAACCAGCT	AGATCTGTACATCAAAGCGAAATAAGCGCTAGATAAGAGTTTGAGTTTCGTGAGATTTGCGAAACTCAAACTCTCTTTTTTGGAAGGGGAAATTGGCAAGGGTGGCTAAGCTGAGAAAACCAGCTTAAGCGCGAACTCGACGAAGCATGC	GCGCTAGATAAGAGTTTGAGTTTCGTGAGATTTGCGAAACTCAAACTCT	49	TTerm_0014
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	73968	73982	15	73992	74006	15	9	100	0	30	60	40	60	40	0	73986	AGAGTTTGAGTTTCG	CGAAACTCAAACTCT	True	GCTAGATAA	CTTTTTTGG	False	True	+	AGAGTTTGAGTTTCG TGAGATTTG CGAAACTCAAACTCT CTTTTTTGG	84	CDS_0069	intergenic	73957	74057	-	down	AGCTGGTTTTCTCAGCTTAGCCACCCTTGCCAATTTCCCCTTCCAAAAAAGAGAGTTTGAGTTTCGCAAATCTCACGAAACTCAAACTCTTATCTAGCGC	GCATGCTTCGTCGAGTTCGCGCTTAAGCTGGTTTTCTCAGCTTAGCCACCCTTGCCAATTTCCCCTTCCAAAAAAGAGAGTTTGAGTTTCGCAAATCTCACGAAACTCAAACTCTTATCTAGCGCTTATTTCGCTTTGATGTACAGATCT	GCGCTAGATAAGAGTTTGAGTTTCGTGAGATTTGCGAAACTCAAACTCT	49	TTerm_0015
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	93229	93246	18	93253	93270	18	6	88	0	26	61	38	62	37	0	93249	CATGAAAGCCACTGTTTT	AAGACAGTGGCTTTTATG	True	AAGGCAAGC	GGCAGAAAA	False	True	+	CATGAAAGCCACTGTTTT GAGTTA AAGACAGTGGCTTTTATG GGCAGAAAA	68	CDS_0087	intergenic	93191	93414	+	down	TCATTGGTTGTAGCCAAATGGAATTGGCTAAGGCAAGCATGAAAGCCACTGTTTTGAGTTAAAGACAGTGGCTTTTATGGGCAGAAAATCGTCCCTATCCCAAGTAACCTCGCCCTAAATCCTGCATTTTGAAGTCACTTGGGAATAAATAAAGACAATAGGCTGAAACGAACGGACAGAGTGATATTAGTGCTATGTAAGAGCTTGAAACTCAAAGAGCGCC	GGGCGTTTGGCGTCCAGCTAACTAATCATTGGTTGTAGCCAAATGGAATTGGCTAAGGCAAGCATGAAAGCCACTGTTTTGAGTTAAAGACAGTGGCTTTTATGGGCAGAAAATCGTCCCTATCCCAAGTAACCTCGCCCTAAATCCTGCATTTTGAAGTCACTTGGGAATAAATAAAGACAATAGGCTGAAACGAACGGACAGAGTGATATTAGTGCTATGTAAGAGCTTGAAACTCAAAGAGCGCCTAAGCGCTCTTTTCTTTTGTACTGC	TCATTGGTTGTAGCCAAATGGAATTGGCTAAGGCAAGCATGAAAGCCACTGTTTTGAGTTAAAGACAGTGGCTTTTATG	79	TTerm_0016
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	93229	93246	18	93253	93270	18	6	88	0	26	61	38	62	37	0	93249	CATGAAAGCCACTGTTTT	AAGACAGTGGCTTTTATG	True	AAGGCAAGC	GGCAGAAAA	False	True	+	CATGAAAGCCACTGTTTT GAGTTA AAGACAGTGGCTTTTATG GGCAGAAAA	68	CDS_0088	intergenic	93191	93414	-	down	GGCGCTCTTTGAGTTTCAAGCTCTTACATAGCACTAATATCACTCTGTCCGTTCGTTTCAGCCTATTGTCTTTATTTATTCCCAAGTGACTTCAAAATGCAGGATTTAGGGCGAGGTTACTTGGGATAGGGACGATTTTCTGCCCATAAAAGCCACTGTCTTTAACTCAAAACAGTGGCTTTCATGCTTGCCTTAGCCAATTCCATTTGGCTACAACCAATGA	GCAGTACAAAAGAAAAGAGCGCTTAGGCGCTCTTTGAGTTTCAAGCTCTTACATAGCACTAATATCACTCTGTCCGTTCGTTTCAGCCTATTGTCTTTATTTATTCCCAAGTGACTTCAAAATGCAGGATTTAGGGCGAGGTTACTTGGGATAGGGACGATTTTCTGCCCATAAAAGCCACTGTCTTTAACTCAAAACAGTGGCTTTCATGCTTGCCTTAGCCAATTCCATTTGGCTACAACCAATGATTAGTTAGCTGGACGCCAAACGCCC	TCATTGGTTGTAGCCAAATGGAATTGGCTAAGGCAAGCATGAAAGCCACTGTTTTGAGTTAAAGACAGTGGCTTTTATG	79	TTerm_0017
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	96953	96964	12	96971	96982	12	6	91	0	19	54	45	54	45	0	96967	AAGAAGAGCACC	GGTGCTCTTTTT	True	TTCAAAATA	TTATCTCTG	True	True	+	AAGAAGAGCACC CGAAGC GGTGCTCTTTTT TTATCTCTG	70	CDS_0091	intergenic	96936	97000	+	down	GGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTTTTATCTCTGAACATCTAT	GGCGCAGCAAGAAGGCGGACTGTAAGGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTTTTATCTCTGAACATCTATCACTTGAGCATCCCAAGGCTTTTAA	GGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTT	46	TTerm_0018
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	96953	96964	12	96971	96982	12	6	91	0	19	54	45	54	45	0	96967	AAGAAGAGCACC	GGTGCTCTTTTT	True	TTCAAAATA	TTATCTCTG	True	True	+	AAGAAGAGCACC CGAAGC GGTGCTCTTTTT TTATCTCTG	70	CDS_0092	intergenic	96936	97000	-	down	ATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCTTATTTTGAAACCTAGCC	TTAAAAGCCTTGGGATGCTCAAGTGATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCTTATTTTGAAACCTAGCCTTACAGTCCGCCTTCTTGCTGCGCC	GGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTT	46	TTerm_0019
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	553	563	11	572	582	11	8	81	0	12	72	27	66	33	0	567	AAAGTTGATCA	TGATCTTCTTT	True	AAACGCTAA	AGGGCTGTG	True	False	-	AAAGAAGATCA TTATGATT TGATCAACTTT TTAGCGTTT	40	CDS_0001	intergenic	546	785	+	down	ACGCTAAAAGTTGATCAAATCATAATGATCTTCTTTAGGGCTGTGGTAAAGTTCACAGCCCTAACACTTTGTAATTGTTTAAAAAATAAACGCCTCAATGCTTGATTTGAGTGCATGGCGCGGAAAGGTATGGGATTTTAAATAAATTTGGTGGCTTCTACTCATAAGTGGGATCGCAACAACAAAAATCCTTTGTACAATTTATTAACATACCCGCCGTGCTATTAAGGAGTAACGCA	TTTACTCGCACAACGTGGTGAATAAACGCTAAAAGTTGATCAAATCATAATGATCTTCTTTAGGGCTGTGGTAAAGTTCACAGCCCTAACACTTTGTAATTGTTTAAAAAATAAACGCCTCAATGCTTGATTTGAGTGCATGGCGCGGAAAGGTATGGGATTTTAAATAAATTTGGTGGCTTCTACTCATAAGTGGGATCGCAACAACAAAAATCCTTTGTACAATTTATTAACATACCCGCCGTGCTATTAAGGAGTAACGCATGACGAAGTCTCTCTTTCGCCAATC	TGCGTTACTCCTTAATAGCACGGCGGGTATGTTAATAAATTGTACAAAGGATTTTTGTTGTTGCGATCCCACTTATGAGTAGAAGCCACCAAATTTATTTAAAATCCCATACCTTTCCGCGCCATGCACTCAAATCAAGCATTGAGGCGTTTATTTTTTAAACAATTACAAAGTGTTAGGGCTGTGAACTTTACCACAGCCCTAAAGAAGATCATTATGATTTGATCAACTT	232	TTerm_0020
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	8550	8562	13	8568	8580	13	5	92	0	21	50	50	50	50	0	8564	AGCGCCCAAAATA	TATTGTGGGCGCT	True	GAATAAAAA	GAATTTTAT	True	True	-	AGCGCCCACAATA CTCGA TATTTTGGGCGCT TTTTTATTC	50	CDS_0011	intergenic	8521	8611	+	down	TTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCTGAATTTTATCTGTAGTGCCTAATCGACGACT	CAATGCTAGGGCTTTGCAAAGTTGATTGTTTATCAAGAACGCTCAGAATAAAAAGCGCCCAAAATATCGAGTATTGTGGGCGCTGAATTTTATCTGTAGTGCCTAATCGACGACTTACTGTGTAAGTGGCTTAAGGTCTG	AGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGC	61	TTerm_0021
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	8550	8562	13	8568	8580	13	5	92	0	21	50	50	50	50	0	8564	AGCGCCCAAAATA	TATTGTGGGCGCT	True	GAATAAAAA	GAATTTTAT	True	True	-	AGCGCCCACAATA CTCGA TATTTTGGGCGCT TTTTTATTC	50	CDS_0012	intergenic	8521	8611	-	down	AGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGCTTTTTATTCTGAGCGTTCTTGATAAACAA	CAGACCTTAAGCCACTTACACAGTAAGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGCTTTTTATTCTGAGCGTTCTTGATAAACAATCAACTTTGCAAAGCCCTAGCATTG	AGTCGTCGATTAGGCACTACAGATAAAATTCAGCGCCCACAATACTCGATATTTTGGGCGC	61	TTerm_0022
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	15676	15687	12	15692	15703	12	4	91	0	19	54	45	54	45	0	15689	AAAGAGCCTCTC	GAGAAGCTCTTT	True	AGATAGAAA	AGGGTAGAG	True	False	-	AAAGAGCTTCTC CAAA GAGAGGCTCTTT TTTCTATCT	62	CDS_0019	intergenic	15469	15755	-	down	AGTGACATATTAATCAATTTGTTTGATCACTTAGTCACGTTATCTCTACCCTAAAGAGCTTCTCCAAAGAGAGGCTCTTTTTCTATCTGCCCGCCCTATTTCTTTGTCTGTCGCTCTTATTCAAACCACTACTCTGCAAAATTTCCGAATGTCGCATAATGGCAATTTTTACTTCCTCACACATTGTATTTTAACGCTCAAACGAACTGGTCTCAGTTTAATTCGCGCCTAGCTTGCGTCGATGGAGAACTCTGACCATCTTTCTTCATCATTAGTGAGTGTTTAT	ACTTTGAAAAAATGTACAGCAACTAAGTGACATATTAATCAATTTGTTTGATCACTTAGTCACGTTATCTCTACCCTAAAGAGCTTCTCCAAAGAGAGGCTCTTTTTCTATCTGCCCGCCCTATTTCTTTGTCTGTCGCTCTTATTCAAACCACTACTCTGCAAAATTTCCGAATGTCGCATAATGGCAATTTTTACTTCCTCACACATTGTATTTTAACGCTCAAACGAACTGGTCTCAGTTTAATTCGCGCCTAGCTTGCGTCGATGGAGAACTCTGACCATCTTTCTTCATCATTAGTGAGTGTTTATATGTCAGAGACAGCAGCAGAAAACC	AGTGACATATTAATCAATTTGTTTGATCACTTAGTCACGTTATCTCTACCCTAAAGAGCTTCTCCAAAGAGAGGCTCTT	79	TTerm_0023
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	18626	18641	16	18648	18663	16	6	100	0	32	75	25	75	25	0	18644	TTAAAAAATAGCACCA	TGGTGCTATTTTTTAA	True	TCAAATAAT	CAAGAAATT	True	True	-	TTAAAAAATAGCACCA ACAAAG TGGTGCTATTTTTTAA ATTATTTGA	96	CDS_0022	intergenic	18600	18796	+	down	TTATCCAGCAAAGCTGTTCAAATAATTAAAAAATAGCACCACTTTGTTGGTGCTATTTTTTAACAAGAAATTCATTAATTTAATAATTATAACAAGTTTATTTTCTCTTTATGTCAAATTATATGGTAGGGCTATCAAGTTAAAATAACATGGGGTACTATCCAGTAAAGAAATAATATTTATATATGCCCAGCGA	TAAAGCGTGGATTGAATTAAAGTAGTTATCCAGCAAAGCTGTTCAAATAATTAAAAAATAGCACCACTTTGTTGGTGCTATTTTTTAACAAGAAATTCATTAATTTAATAATTATAACAAGTTTATTTTCTCTTTATGTCAAATTATATGGTAGGGCTATCAAGTTAAAATAACATGGGGTACTATCCAGTAAAGAAATAATATTTATATATGCCCAGCGATGTCCGATAACGAACTGATCATCTT	TCGCTGGGCATATATAAATATTATTTCTTTACTGGATAGTACCCCATGTTATTTTAACTTGATAGCCCTACCATATAATTTGACATAAAGAGAAAATAAACTTGTTATAATTATTAAATTAATGAATTTCTTGTTAAAAAATAGCACCAACAAAGTGGTGCTATTTTTTA	170	TTerm_0024
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	19984	19996	13	20006	20018	13	9	84	0	16	80	19	81	18	0	20000	ATTGAAAATCAAT	ATTGAAGTTCAAT	True	AATATTAAA	AACAATCAT	True	False	-	ATTGAACTTCAAT CGATTTTAT ATTGATTTTCAAT TTTAATATT	40	CDS_0023	intergenic	19917	20029	+	down	ACGATATTAACTGCGGTGAATTAAAAGTAGCTAGTTGTCGATTTTAAATTCGATAATTAATATTAAATTGAAAATCAATATAAAATCGATTGAAGTTCAATAACAATCATAT	TATTGTCATCGCAGACGAGATATAAACGATATTAACTGCGGTGAATTAAAAGTAGCTAGTTGTCGATTTTAAATTCGATAATTAATATTAAATTGAAAATCAATATAAAATCGATTGAAGTTCAATAACAATCATATTAATTTTTTTTATTGGTGAGTTGTG	ATATGATTGTTATTGAACTTCAATCGATTTTATATTGATTTTCAA	45	TTerm_0025
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	19984	19996	13	20006	20018	13	9	84	0	16	80	19	81	18	0	20000	ATTGAAAATCAAT	ATTGAAGTTCAAT	True	AATATTAAA	AACAATCAT	True	False	-	ATTGAACTTCAAT CGATTTTAT ATTGATTTTCAAT TTTAATATT	40	CDS_0024	intergenic	19917	20029	-	down	ATATGATTGTTATTGAACTTCAATCGATTTTATATTGATTTTCAATTTAATATTAATTATCGAATTTAAAATCGACAACTAGCTACTTTTAATTCACCGCAGTTAATATCGT	CACAACTCACCAATAAAAAAAATTAATATGATTGTTATTGAACTTCAATCGATTTTATATTGATTTTCAATTTAATATTAATTATCGAATTTAAAATCGACAACTAGCTACTTTTAATTCACCGCAGTTAATATCGTTTATATCTCGTCTGCGATGACAATA	ATATGATTGTTATTGAACTTCAATCGATTTTATATTGATTTTCAA	45	TTerm_0026
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	40055	40065	11	40072	40082	11	6	90	0	17	45	54	40	60	0	40068	AATAGGGGCGA	TCGCCCCTTTT	True	TCAAAAATA	TGCGTTCAG	True	True	-	AAAAGGGGCGA ATTCAC TCGCCCCTATT TATTTTTGA	74	CDS_0040	intergenic	39968	40184	+	down	GTCGCGTCAATGGTTAGCCAAGTAGGAGCGATGCCAAAGCAAGCTCGTGTCTAACAAGGCATTACTACGCTAGGTGATTCAAAAATAATAGGGGCGAGTGAATTCGCCCCTTTTTGCGTTCAGTTAGGGTCGTCTTAACCCAACCTTAACCTGACCCTTTTTAGTATCCACTCTCGAAAAAAGCGAAAATAATAACGAGCATGGAGAGTGGTAGCG	CAAGCTAACCAAAACTAAGCGTTAAGTCGCGTCAATGGTTAGCCAAGTAGGAGCGATGCCAAAGCAAGCTCGTGTCTAACAAGGCATTACTACGCTAGGTGATTCAAAAATAATAGGGGCGAGTGAATTCGCCCCTTTTTGCGTTCAGTTAGGGTCGTCTTAACCCAACCTTAACCTGACCCTTTTTAGTATCCACTCTCGAAAAAAGCGAAAATAATAACGAGCATGGAGAGTGGTAGCGTGACGGTTCTTATCGGTAGTCGATT	CGCTACCACTCTCCATGCTCGTTATTATTTTCGCTTTTTTCGAGAGTGGATACTAAAAAGGGTCAGGTTAAGGTTGGGTTAAGACGACCCTAACTGAACGCAAAAAGGGGCGAATTCACTCGCCCCTAT	129	TTerm_0027
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	70276	70288	13	70298	70310	13	9	92	0	21	57	42	58	41	0	70292	AAAGCTGGTTTAG	CTAGACCAGCTTT	True	CTTTGGTAA	GATACTAAT	True	False	-	AAAGCTGGTCTAG AGCTCAAAA CTAAACCAGCTTT TTACCAAAG	66	CDS_0065	intergenic	70249	70375	+	down	AGAGCCGTAGCGTTGCCCCTTTGGTAAAAGCTGGTTTAGTTTTGAGCTCTAGACCAGCTTTGATACTAATCCCTAAGTAACCTCAAAGTGCAGGGATATAATGACTAGTGGTTAATTTTATCGCGC	GCTTTTCCAAGCTAGCGCTGAATAGAGAGCCGTAGCGTTGCCCCTTTGGTAAAAGCTGGTTTAGTTTTGAGCTCTAGACCAGCTTTGATACTAATCCCTAAGTAACCTCAAAGTGCAGGGATATAATGACTAGTGGTTAATTTTATCGCGCTATATCCACTCTTGTTCTTCAGCCG	GCGCGATAAAATTAACCACTAGTCATTATATCCCTGCACTTTGAGGTTACTTAGGGATTAGTATCAAAGCTGGTCTAGAGCTCAAAACTAAACCAGCTT	99	TTerm_0028
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	70276	70288	13	70298	70310	13	9	92	0	21	57	42	58	41	0	70292	AAAGCTGGTTTAG	CTAGACCAGCTTT	True	CTTTGGTAA	GATACTAAT	True	False	-	AAAGCTGGTCTAG AGCTCAAAA CTAAACCAGCTTT TTACCAAAG	66	CDS_0066	intergenic	70249	70375	-	down	GCGCGATAAAATTAACCACTAGTCATTATATCCCTGCACTTTGAGGTTACTTAGGGATTAGTATCAAAGCTGGTCTAGAGCTCAAAACTAAACCAGCTTTTACCAAAGGGGCAACGCTACGGCTCT	CGGCTGAAGAACAAGAGTGGATATAGCGCGATAAAATTAACCACTAGTCATTATATCCCTGCACTTTGAGGTTACTTAGGGATTAGTATCAAAGCTGGTCTAGAGCTCAAAACTAAACCAGCTTTTACCAAAGGGGCAACGCTACGGCTCTCTATTCAGCGCTAGCTTGGAAAAGC	GCGCGATAAAATTAACCACTAGTCATTATATCCCTGCACTTTGAGGTTACTTAGGGATTAGTATCAAAGCTGGTCTAGAGCTCAAAACTAAACCAGCTT	99	TTerm_0029
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	83432	83443	12	83449	83460	12	5	100	0	24	58	41	58	41	0	83445	CAAAGAGCAAAG	CTTTGCTCTTTG	True	GGACAAAAC	ACAAAATAA	True	False	-	CAAAGAGCAAAG TCTTC CTTTGCTCTTTG GTTTTGTCC	72	CDS_0079	intergenic	83409	83478	-	down	AACCCCTTCTTATTTTGTCAAAGAGCAAAGTCTTCCTTTGCTCTTTGTTTTGTCCAATGGGAGATATTA	TCGTGTTTGGCATGTTGGGCGGTTAAACCCCTTCTTATTTTGTCAAAGAGCAAAGTCTTCCTTTGCTCTTTGTTTTGTCCAATGGGAGATATTAATGGAAGTTAATTTATTCGCCGAAG	AACCCCTTCTTATTTTGTCAAAGAGCAAAGTCTTCCTTTGCTCTTT	46	TTerm_0030
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	96953	96964	12	96971	96982	12	6	91	0	19	54	45	54	45	0	96967	AAGAAGAGCACC	GGTGCTCTTTTT	True	TTCAAAATA	TTATCTCTG	True	True	-	AAAAAGAGCACC GCTTCG GGTGCTCTTCTT TATTTTGAA	70	CDS_0091	intergenic	96936	97000	+	down	GGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTTTTATCTCTGAACATCTAT	GGCGCAGCAAGAAGGCGGACTGTAAGGCTAGGTTTCAAAATAAGAAGAGCACCCGAAGCGGTGCTCTTTTTTTATCTCTGAACATCTATCACTTGAGCATCCCAAGGCTTTTAA	ATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCT	47	TTerm_0031
gnl|Bactopia|pilon_re2_3	96953	96964	12	96971	96982	12	6	91	0	19	54	45	54	45	0	96967	AAGAAGAGCACC	GGTGCTCTTTTT	True	TTCAAAATA	TTATCTCTG	True	True	-	AAAAAGAGCACC GCTTCG GGTGCTCTTCTT TATTTTGAA	70	CDS_0092	intergenic	96936	97000	-	down	ATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCTTATTTTGAAACCTAGCC	TTAAAAGCCTTGGGATGCTCAAGTGATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCTTATTTTGAAACCTAGCCTTACAGTCCGCCTTCTTGCTGCGCC	ATAGATGTTCAGAGATAAAAAAAGAGCACCGCTTCGGGTGCTCTTCT	47	TTerm_0032
