chrom	Lstart	Lend	Lstem	Rstart	Rend	Rstem	loop	match%	Indels	score	AT	GC	ATpairs	GCpairs	GTpairs	Center	Lseq	Rseq	intergenic	tailL	tailR	polyTL	polyTR	strand	TTseq	FACoPscore	locus_tag	type	start	end	strand_y	stream	seq	aug_seq	3primeUTR	3primeUTRlen	ID
NC_019511_-_LTR_(reversed)	7533	7554	22	7561	7582	22	6	72	0	14	68	31	68	31	0	7557	AATCAAATTAAGTAGCTAGGGT	ACTCTAGCTTTTTCATATGCTT	True	ATATTTTGA	GTATTGCCT	False	True	+	AATCAAATTAAGTAGCTAGGGT TGCTTT ACTCTAGCTTTTTCATATGCTT GTATTGCCT	44	CDS_0016	intergenic	7547	8130	+	down	CTAGGGTTGCTTTACTCTAGCTTTTTCATATGCTTGTATTGCCTATTTAACTACCTTATATAAGCAAGTAAATATTATAGGATAAATACTACCTAAAAAGTATTACCGTTGAATATAGACCTATAAGCTTAATGCTCTCTTACTGTTATAAACATCATAAGTATAAATCTATGATTTTCCTAAGTAGCAGGCGCTGTTTTCCCTTTATATTAACCGCTTCAAACAACATAAAAAAAGATTAGGTTAATAGCCTAATCTATAACTCTTTTATATAATTCTTTTATATAATTCTTGTAATTCTTTTTCTAACTTTTTTATTGTTTCTATATCATTATTTCTTTTAATAGACTGACATATAAATGCAATACCTTTAATCAAATTAAATGGTTATTTTTACACTGCATTGTATACAATTAAATCGATTGATTATAATAATTAATTTAAGCTGTAATTTCTAGTTTCTTCTATATAATAGTAAGAAATCATTTCTTTTGAAAAACTTTCGTATAACCTATTGACATTAAATACAAGATACTGTAATATAATAAGCGTAGTAAACAAACCGAAAGGAATTGATAAGATA		CTAGGGTTGCTTTACTCTAGCTTTTTCATATGCTT	35	TTerm_0001
NC_019511_-_LTR_(reversed)	9331	9337	7	9345	9351	7	7	100	0	14	57	42	57	42	0	9340	ATAAGGG	CCCTTAT	True	TTTATTAGA	TTTTTTATG	False	True	+	ATAAGGG CTAACCA CCCTTAT TTTTTTATG	52	CDS_0021	intergenic	9334	9500	+	down	GGGCTAACCACCCTTATTTTTTTATGCCTATATAACCGCTTCACATTAGTGTAAAACTTCCCTTATTTCTTTGATATAATACTTTACAAATACGAGCTTATACTGTAATATATTAATTGTAGTAAGGAACACAACAAACAAAAAAAGAAGAGGGATTGATTACTTA	GAATATTAATATATTTATTAGATAAGGGCTAACCACCCTTATTTTTTTATGCCTATATAACCGCTTCACATTAGTGTAAAACTTCCCTTATTTCTTTGATATAATACTTTACAAATACGAGCTTATACTGTAATATATTAATTGTAGTAAGGAACACAACAAACAAAAAAAGAAGAGGGATTGATTACTTATGAAAAACTATAAAACTTTAGAAGA	GGGCTAACCACCCTTAT	17	TTerm_0002
NC_019511_-_LTR_(reversed)	8440	8448	9	8453	8461	9	4	88	0	13	83	16	87	12	0	8450	AATAATAGT	ACTATCATT	True	AAAGTTAAA	AAGATAGTG	True	False	-	AATGATAGT GTCA ACTATTATT TTTAACTTT	42	CDS_0017	intergenic	8444	8517	+	down	TAGTTGACACTATCATTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAGTAAACAAACAGAAAAGGAATTGATTAATTA	TATTAAAGAAAAAAAGTTAAAATAATAGTTGACACTATCATTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAGTAAACAAACAGAAAAGGAATTGATTAATTATGAAAACACTAATTACTAACAGTAA	TAATTAATCAATTCCTTTTCTGTTTGTTTACTACATCTATTATATTACACTATCTTAATGATAGTGTCAACTATTAT	77	TTerm_0003
NC_019511_-_LTR_(reversed)	9823	9829	7	9834	9840	7	4	100	0	14	85	14	85	14	0	9831	AAAACTT	AAGTTTT	True	CAAATAAAA	AAAAAAGTG	True	False	-	AAAACTT TTTT AAGTTTT TTTTATTTG	36	CDS_0022	intergenic	9790	9917	+	down	AGGAACACAACAAAGAACAGCAAACAAATAAAAAAACTTAAAAAAGTTTTAAAAAAGTGTTGACACTATCATTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAGTAAACAAACAGAAAAGGATTGATACACA	ATTTATTAATGCAGGAAGACTATAAAGGAACACAACAAAGAACAGCAAACAAATAAAAAAACTTAAAAAAGTTTTAAAAAAGTGTTGACACTATCATTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAGTAAACAAACAGAAAAGGATTGATACACATGAATATTAAAATAGAAACTAAACC	TGTGTATCAATCCTTTTCTGTTTGTTTACTACATCTATTATATTACACTATCTTAATGATAGTGTCAACACTTTTTTAAAACTTTTTTAAGTTT	94	TTerm_0004
NC_019511_-_LTR_(reversed)	10280	10286	7	10291	10297	7	4	100	0	14	85	14	85	14	0	10288	AAAACTT	AAGTTTT	True	ACACTAAAA	AAAAAAGTG	True	False	-	AAAACTT TTTT AAGTTTT TTTTAGTGT	36	CDS_0024	intergenic	10288	10391	+	down	AAAAGTTTTAAAAAAGTGTTGACACTACACCTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAAGGAACACAACAAATAAAAAACAAACAGAAAAGGAATTGATTATAA	TATAGAGAACACTAAAAAAACTTAAAAAAGTTTTAAAAAAGTGTTGACACTACACCTAAGATAGTGTAATATAATAGATGTAAGGAACACAACAAATAAAAAACAAACAGAAAAGGAATTGATTATAATGAAAAACACAGTAAAAGAAATGGC	TTATAATCAATTCCTTTTCTGTTTGTTTTTTATTTGTTGTGTTCCTTACATCTATTATATTACACTATCTTAGGTGTAGTGTCAACACTTTTTTAAAACTTTTTTAAGTTT	111	TTerm_0005
