chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0004 p_0001 p_0001 3471 116 GTCATAAAA 3 1.0 poor intergenic + TTTTTGCGTTATTTACCGGCTGAGGCCGCGCGCTGCCTGCAACTTTGGCGTCATAAAAGATATACTGGTTT 45 116 1953_murQ-like::tet_KO CDS_0004 intergenic 3430 3587 - up AAAGCAAACTCGACAGTGAACAAAAGGGAAGACCATGGTCTTCCCTTTTTGCGTTATTTACCGGCTGAGGCCGCGCGCTGCCTGCAACTTTGGCGTCATAAAAGATATACTGGTTTGAATTGAAATAAGAAAATTAAACCAGGAGTGTGGAAGGGCC CGCCGCAGCACGATATGGCGCTGTAAAAGCAAACTCGACAGTGAACAAAAGGGAAGACCATGGTCTTCCCTTTTTGCGTTATTTACCGGCTGAGGCCGCGCGCTGCCTGCAACTTTGGCGTCATAAAAGATATACTGGTTTGAATTGAAATAAGAAAATTAAACCAGGAGTGTGGAAGGGCCATGCAAGAGGATATTAACCAGGAGA p_0001 CDS_0005 p_0002 p_0002 5426 128 AACTTTTAT 3 1.0 poor intergenic + TGCCAGGCGCGCGATGAGCATGCGCGCCTGGACTTTTGTAATTAAAGAAATTCTTAACTTTTATTTTACCC 52 123 1953_murQ-like::tet_KO CDS_0005 intergenic 5233 5554 - up AATGGAAGCCGGCGGCACCTCGCTAACGGATTCACCACTCCAAGAATTTCCCTTCTCTGCCAGGCGCGCGATGAGCATGCGCGCCTGGACTTTTGTAATTAAAGAAATTCTTAACTTTTATTTTACCCGGCAATAGATATTGAATTTTCGACCTTATTTTTTTATCCGTCTTCGCTCTATTTTTAAAATTGATTTTTTAAGTTAAATAACTGTTTGGTTTAAAATGCGAGAGTGTAAATGATATTTTAAAATAAAGTAAAAGTGCGTTAATATGCTGCCTCTTATGACCGTGTGCTACGTGATAATTCTATTATGCCTGCA CATGGAGCCGGGCCACCTCGACCTGAATGGAAGCCGGCGGCACCTCGCTAACGGATTCACCACTCCAAGAATTTCCCTTCTCTGCCAGGCGCGCGATGAGCATGCGCGCCTGGACTTTTGTAATTAAAGAAATTCTTAACTTTTATTTTACCCGGCAATAGATATTGAATTTTCGACCTTATTTTTTTATCCGTCTTCGCTCTATTTTTAAAATTGATTTTTTAAGTTAAATAACTGTTTGGTTTAAAATGCGAGAGTGTAAATGATATTTTAAAATAAAGTAAAAGTGCGTTAATATGCTGCCTCTTATGACCGTGTGCTACGTGATAATTCTATTATGCCTGCAATGAAAAAAACGATTATTTCCTTAA p_0002 CDS_0006 p_0003 p_0003 6812 176 TGTTATGTT 2 1.0 poor intergenic + ATGCATCAGGCCGCTGATTTTGCCGAGATGCGCTTTTTCTGTCGTAAATGGAGGTTGTTATGTTTGACAGC 103 174 1953_murQ-like::tet_KO CDS_0006 intergenic 6744 6988 - up AACGCGCGTTGGGGACGGTAAACTGTGACCCCGACGGCGGTAAAGCGCAGAACATTCCACTTATAGTGGCGGCAGAGGTTAAATAGTCCTGATGAATATAAGGATATGCATCAGGCCGCTGATTTTGCCGAGATGCGCTTTTTCTGTCGTAAATGGAGGTTGTTATGTTTGACAGCTTATCATCGATAAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGT CTCAGATAACCGACAATCACCCGTAAACGCGCGTTGGGGACGGTAAACTGTGACCCCGACGGCGGTAAAGCGCAGAACATTCCACTTATAGTGGCGGCAGAGGTTAAATAGTCCTGATGAATATAAGGATATGCATCAGGCCGCTGATTTTGCCGAGATGCGCTTTTTCTGTCGTAAATGGAGGTTGTTATGTTTGACAGCTTATCATCGATAAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGTATGAAATCTAACAATGCGCTCATCG p_0003 CDS_0007 p_0005 p_0005 7420 80 TGTAATCAA 2 0.99 poor intergenic + CGGGTAGATTCAGTGAAAGATTATTATCGCCGATAGCGCGGCATACATAAAGCCGTGTAATCAAAGCAAAA 14 85 1953_murQ-like::tet_KO CDS_0007 intergenic 7344 7500 - up TGACGACCCCGGGTAGATTCAGTGAAAGATTATTATCGCCGATAGCGCGGCATACATAAAGCCGTGTAATCAAAGCAAAAGGCCGCTTTTGCTACGGCAGACTCCTCCAGCGCGCGGTACACTGCGGCTTTTCGCCACAGGCTTAAGGGAGACACT CGAGGCGGGTGCTCTGAAGCCTTCATGACGACCCCGGGTAGATTCAGTGAAAGATTATTATCGCCGATAGCGCGGCATACATAAAGCCGTGTAATCAAAGCAAAAGGCCGCTTTTGCTACGGCAGACTCCTCCAGCGCGCGGTACACTGCGGCTTTTCGCCACAGGCTTAAGGGAGACACTATGGAACTGGCTTCTCTGGTCCGGG p_0005 CDS_0008 p_0004 p_0004 7479 135 GATAATAAT 3 1.0 poor intergenic + GCAAAAGCGGCCTTTTGCTTTGATTACACGGCTTTATGTATGCCGCGCTATCGGCGATAATAATCTTTCAC 59 130 1953_murQ-like::tet_KO CDS_0008 intergenic 7344 7500 + up AGTGTCTCCCTTAAGCCTGTGGCGAAAAGCCGCAGTGTACCGCGCGCTGGAGGAGTCTGCCGTAGCAAAAGCGGCCTTTTGCTTTGATTACACGGCTTTATGTATGCCGCGCTATCGGCGATAATAATCTTTCACTGAATCTACCCGGGGTCGTCA CCCGGACCAGAGAAGCCAGTTCCATAGTGTCTCCCTTAAGCCTGTGGCGAAAAGCCGCAGTGTACCGCGCGCTGGAGGAGTCTGCCGTAGCAAAAGCGGCCTTTTGCTTTGATTACACGGCTTTATGTATGCCGCGCTATCGGCGATAATAATCTTTCACTGAATCTACCCGGGGTCGTCATGAAGGCTTCAGAGCACCCGCCTCG p_0004