chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0009 p_0002 p_0002 15661 360 AGTTATATA 3 0.01 poor intergenic + TATGTATAGTAATTTATTAAAACTAAGAAGTACTAGTTGCATTTTACATGTTCATAGTTATATACTTGTAA 291 362 icaA CDS_0009 intergenic 15601 16021 - up AATAACATTGTGTCTAAAGCAATTTAGTAATCATTAATTTTAAAACTAACTTTATTTAAAGTTAGTTTTTTATTCGTTATCATACATAAATATACAAATTAGTTTTAAGTTCCTTCGTAAATTATATTCATTTTGATTCGAATTTATATATATAATTATTCAATAAGTAGATAAAGTTTAGTTGAATTCAATGTAACAGTAACTTGAAATATAGATAAAAAACACTTGTTAATAGTAAAATAATCCTTTTGTTAACAATTCCTCTTTGCACAATCGTTTAATATCTTTATATGTATAGTAATTTATTAAAACTAAGAAGTACTAGTTGCATTTTACATGTTCATAGTTATATACTTGTAAAAATGAATATTTTCAGTATAAAAGACTATGATTAATTAAGAAAACTATGGGGAGTTTATT ATCAATACAACAACGGACAATGGTAAATAACATTGTGTCTAAAGCAATTTAGTAATCATTAATTTTAAAACTAACTTTATTTAAAGTTAGTTTTTTATTCGTTATCATACATAAATATACAAATTAGTTTTAAGTTCCTTCGTAAATTATATTCATTTTGATTCGAATTTATATATATAATTATTCAATAAGTAGATAAAGTTTAGTTGAATTCAATGTAACAGTAACTTGAAATATAGATAAAAAACACTTGTTAATAGTAAAATAATCCTTTTGTTAACAATTCCTCTTTGCACAATCGTTTAATATCTTTATATGTATAGTAATTTATTAAAACTAAGAAGTACTAGTTGCATTTTACATGTTCATAGTTATATACTTGTAAAAATGAATATTTTCAGTATAAAAGACTATGATTAATTAAGAAAACTATGGGGAGTTTATTATGACAAAGAAAGAAAAGGATTATA p_0002 CDS_0009 p_0001 p_0001 15934 87 TTTTTTATT 3 0.61 poor intergenic + AAGCAATTTAGTAATCATTAATTTTAAAACTAACTTTATTTAAAGTTAGTTTTTTATTCGTTATCATACAT 16 87 icaA CDS_0009 intergenic 15601 16021 - up AATAACATTGTGTCTAAAGCAATTTAGTAATCATTAATTTTAAAACTAACTTTATTTAAAGTTAGTTTTTTATTCGTTATCATACATAAATATACAAATTAGTTTTAAGTTCCTTCGTAAATTATATTCATTTTGATTCGAATTTATATATATAATTATTCAATAAGTAGATAAAGTTTAGTTGAATTCAATGTAACAGTAACTTGAAATATAGATAAAAAACACTTGTTAATAGTAAAATAATCCTTTTGTTAACAATTCCTCTTTGCACAATCGTTTAATATCTTTATATGTATAGTAATTTATTAAAACTAAGAAGTACTAGTTGCATTTTACATGTTCATAGTTATATACTTGTAAAAATGAATATTTTCAGTATAAAAGACTATGATTAATTAAGAAAACTATGGGGAGTTTATT ATCAATACAACAACGGACAATGGTAAATAACATTGTGTCTAAAGCAATTTAGTAATCATTAATTTTAAAACTAACTTTATTTAAAGTTAGTTTTTTATTCGTTATCATACATAAATATACAAATTAGTTTTAAGTTCCTTCGTAAATTATATTCATTTTGATTCGAATTTATATATATAATTATTCAATAAGTAGATAAAGTTTAGTTGAATTCAATGTAACAGTAACTTGAAATATAGATAAAAAACACTTGTTAATAGTAAAATAATCCTTTTGTTAACAATTCCTCTTTGCACAATCGTTTAATATCTTTATATGTATAGTAATTTATTAAAACTAAGAAGTACTAGTTGCATTTTACATGTTCATAGTTATATACTTGTAAAAATGAATATTTTCAGTATAAAAGACTATGATTAATTAAGAAAACTATGGGGAGTTTATTATGACAAAGAAAGAAAAGGATTATA p_0001 CDS_0010 p_0003 p_0003 17393 205 ATTTATAAT 5 1.0 poor intergenic + ATTCTAAAATATAATAAAATTATTTAGAAAAATATTTTGTTGATAGCGTATGATTATTTATAATAGAAATA 133 204 icaA CDS_0010 intergenic 17322 17598 - up GTGCGTTTATTGTGAAAGGATATGTTCGTTGTCTAAAGCATTAATTGTTTTCATTTATTGGAATAAAAATTTTAATTTAAGACGTCCGGCATATTTATAATTTTAATTTTCGCTAGGAATGTATTCATGTTATAATTCTAAAATATAATAAAATTATTTAGAAAAATATTTTGTTGATAGCGTATGATTATTTATAATAGAAATATAATAACATGTTCGTAATTGAAAATTGATCAAACACTTACATCACGAATTAGACAACTTGAGGCTTATATC GCGCGGTTCGTAAACGTATCGTTTAGTGCGTTTATTGTGAAAGGATATGTTCGTTGTCTAAAGCATTAATTGTTTTCATTTATTGGAATAAAAATTTTAATTTAAGACGTCCGGCATATTTATAATTTTAATTTTCGCTAGGAATGTATTCATGTTATAATTCTAAAATATAATAAAATTATTTAGAAAAATATTTTGTTGATAGCGTATGATTATTTATAATAGAAATATAATAACATGTTCGTAATTGAAAATTGATCAAACACTTACATCACGAATTAGACAACTTGAGGCTTATATCATGAAACAATTTTTAAACATCACTC p_0003 CDS_0014 p_0005 p_0005 21145 145 AATTAAAAT 3 1.0 poor intergenic + GCTTAACAGTTTTTTTACAATTTCTTACGATTTATTATAAAAAATTTATAATTTTAATTAAAATTAAATAC 73 144 icaA CDS_0014 intergenic 21076 21290 - up TCTCTATGATTACTCCTTATGTAAAAGATGGAATTTTTAAAAAGTATAGTATAAAAGTATAGCGTTTTGTGCTTGCTTAACAGTTTTTTTACAATTTCTTACGATTTATTATAAAAAATTTATAATTTTAATTAAAATTAAATACCCATCACTTATAAGATATGCTAATCTATAAATATAGTTTCAAAAATATACATATTACACCAATATTGAT GAACTTAAAGTTTTAAATATTTTCATCTCTATGATTACTCCTTATGTAAAAGATGGAATTTTTAAAAAGTATAGTATAAAAGTATAGCGTTTTGTGCTTGCTTAACAGTTTTTTTACAATTTCTTACGATTTATTATAAAAAATTTATAATTTTAATTAAAATTAAATACCCATCACTTATAAGATATGCTAATCTATAAATATAGTTTCAAAAATATACATATTACACCAATATTGATGTGAAGGGGACAGTAAGTAGAATGA p_0005 CDS_0015 p_0004 p_0004 21190 114 TTTTATAAT 5 0.99 poor intergenic + AGATTAGCATATCTTATAAGTGATGGGTATTTAATTTTAATTAAAATTATAAATTTTTTATAATAAATCGT 42 113 icaA CDS_0015 intergenic 21076 21290 + up ATCAATATTGGTGTAATATGTATATTTTTGAAACTATATTTATAGATTAGCATATCTTATAAGTGATGGGTATTTAATTTTAATTAAAATTATAAATTTTTTATAATAAATCGTAAGAAATTGTAAAAAAACTGTTAAGCAAGCACAAAACGCTATACTTTTATACTATACTTTTTAAAAATTCCATCTTTTACATAAGGAGTAATCATAGAGA TCATTCTACTTACTGTCCCCTTCACATCAATATTGGTGTAATATGTATATTTTTGAAACTATATTTATAGATTAGCATATCTTATAAGTGATGGGTATTTAATTTTAATTAAAATTATAAATTTTTTATAATAAATCGTAAGAAATTGTAAAAAAACTGTTAAGCAAGCACAAAACGCTATACTTTTATACTATACTTTTTAAAAATTCCATCTTTTACATAAGGAGTAATCATAGAGATGAAAATATTTAAAACTTTAAGTTC p_0004