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ATAGAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAAGTCAAAATCAAAGATATCCTTA 40 111 JAOIQD010000008.1_36561_46435__41778_42602 JAOIQD010000008.1_36561_46435__41778_42602_F3 intergenic 2300 2412 + up TCAGTCATTAAATTAACTAGTAAGCTCGAAACCGAATAGAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAAGTCAAAATCAAAGATATCCTTAGTATTG ATTGATTGCGCAAGCAGGTTTCTAGTCAGTCATTAAATTAACTAGTAAGCTCGAAACCGAATAGAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAAGTCAAAATCAAAGATATCCTTAGTATTGTGAAGATCCCAAAAAGTTTAATTTC p_0042 JAQUZN010000003.1_34511_51540__40199_40990_F4 p_0080 p_0080 2424 178 TACAATATA 3 0.98 poor intergenic + GCTATTCCAGTATCATTCTTTTATTTAAATGATTGATAATTGAAATAAAACGTAGTACAATATATACAACG 104 175 JAQUZN010000003.1_34511_51540__40199_40990 JAQUZN010000003.1_34511_51540__40199_40990_F4 intergenic 2403 2602 - up AATGTAGATCACCTCGATTAATGAAATAATAGAAATTTCAGTTACTGCCCTATTATACAATAAATATTTCATTATCTCCAAATAAATATACGAATTACAAGATGTAAGCTATTCCAGTATCATTCTTTTATTTAAATGATTGATAATTGAAATAAAACGTAGTACAATATATACAACGGAATATTAAAGGAGTAAAAGA 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JAQUVC010000002.1_8700_21695__13462_14247_F3 intergenic 3560 3659 - up ATGATTCTGGGCAAGCATATCGTATACTTGCCTTTTTTTATTTCCTTTTTTTAAGAATTAATTAAGAAAATGATGTATAATATTGTTAGAGGTGGCAAC GAGCACCACAATTCTCAAAACGTTAATGATTCTGGGCAAGCATATCGTATACTTGCCTTTTTTTATTTCCTTTTTTTAAGAATTAATTAAGAAAATGATGTATAATATTGTTAGAGGTGGCAACATGAAGATATTGGTTGTGGAAGATG p_0077 JAQUHT010000050.1_257_7755__3212_3994_R1 p_0070 p_0070 3936 198 ATAATTAAA 3 0.85 poor intergenic + TTGCTATTAACTGCATTTTTAATTTGCGTAAAAAGTTGATTTCATCATCATAATTAAATTATATTAGAAAG 127 198 JAQUHT010000050.1_257_7755__3212_3994 JAQUHT010000050.1_257_7755__3212_3994_R1 intergenic 3738 4047 + up GATTAATTACAGGAAGTTAAATAGTTTTAGTAATAATTTTTACTGATAAGATTACTTACTCTTTGTTGTACTACTTATAGAAGTATAGTGAGCATTAGAAGTATATGCTTATTCATTTCAAATGCAGTTGCTATTAACTGCATTTTTAATTTGCGTAAAAAGTTGATTTCATCATCATAATTAAATTATATTAGAAAGATACTTGATAATTAGCATATAGAAGTTTTCAAATAGGAATATATTTAATGGAACTTTATCTCAATATGGCGGTCTAAGAAAGAGTTTGGCTTCAGAAAGGAAACGAAAAAA 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TATTTATTTGATAAATTTTAATGAGTAAGAAAAATTTTTATTTTGTCTGAGAATATCCAAGTTTCAAATCTTATAGTGCTGAAAATAGTTGACTAGTCAACTATAAATGGATATAATCACTCTCGATGGAGGAATTTAAA TATTATTAATAGAAATCCAGTATGATATTTATTTGATAAATTTTAATGAGTAAGAAAAATTTTTATTTTGTCTGAGAATATCCAAGTTTCAAATCTTATAGTGCTGAAAATAGTTGACTAGTCAACTATAAATGGATATAATCACTCTCGATGGAGGAATTTAAATGCTTTTGATACGAAAAATGTGGCT p_0071 JAOOCF010000016.1_1_8643__3986_4810_R2 p_0053 p_0053 6045 75 CATACTAAA 2 0.4 poor intergenic + AAATATTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTA 1 72 JAOOCF010000016.1_1_8643__3986_4810 JAOOCF010000016.1_1_8643__3986_4810_R2 intergenic 5970 6047 + up AAAAAAATATTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATA CTAGAAAAAAATTATTTTTATCCATAAAAAAATATTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATATGATTTCTTATTTTCAGGATTACGT p_0053 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277_HeR p_0015 p_0015 6093 122 TGTTATAAT 5 1.0 poor intergenic + TAAAAAGTTTAATAACACCAAATGAAAGCATCTCATTAGAAGAATTAAGAATAAATGTTATAATTAAAATG 50 121 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277_HeR intergenic 6091 6215 - up TATGAACCTCACGATAACTGTTACAATTGTATTTTATCATAATTGGGTATTTAAAAAGTTTAATAACACCAAATGAAAGCATCTCATTAGAAGAATTAAGAATAAATGTTATAATTAAAATGAA AATTCTTTGATACGATTTCTATTCATATGAACCTCACGATAACTGTTACAATTGTATTTTATCATAATTGGGTATTTAAAAAGTTTAATAACACCAAATGAAAGCATCTCATTAGAAGAATTAAGAATAAATGTTATAATTAAAATGAAATAAATAATAAGGAGAAAAAAATGG p_0015 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277_R1 p_0014 p_0014 6192 101 TGATAAAAT 4 1.0 poor intergenic + TCTTCTAATGAGATGCTTTCATTTGGTGTTATTAAACTTTTTAAATACCCAATTATGATAAAATACAATTG 28 99 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277 JAIPGC010000001.1_1187_16470__6462_7277_R1 intergenic 6091 6215 + up TTCATTTTAATTATAACATTTATTCTTAATTCTTCTAATGAGATGCTTTCATTTGGTGTTATTAAACTTTTTAAATACCCAATTATGATAAAATACAATTGTAACAGTTATCGTGAGGTTCATA 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ATCCGTCCGTCAGCATCAACATAAGCCAAAAAATTCTGGTCAGAGAAATCTGACCAGAATTTTTTCTTTTAATATTTAATTTTTCAATATATTCTTAAATAA AACTAATTGCTCAGGCAGGATATTAATCCGTCCGTCAGCATCAACATAAGCCAAAAAATTCTGGTCAGAGAAATCTGACCAGAATTTTTTCTTTTAATATTTAATTTTTCAATATATTCTTAAATAAGTGAAAACACCTAAACTTTTATTAA p_0055 JAOOID010000014.1_1503_11255__6598_7425_R2 p_0059 p_0059 7155 74 CATACTAAA 2 1.0 poor intergenic + AAAATTTTACAAAAGAATTCCACCGATGTTTTAAAAAAAACTAAAATTTTAGAAGCATACTAAAGTTAATA 0 71 JAOOID010000014.1_1503_11255__6598_7425 JAOOID010000014.1_1503_11255__6598_7425_R2 intergenic 7081 7157 + up CAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCACCGATGTTTTAAAAAAAACTAAAATTTTAGAAGCATACTAAAGTTAATATA AATTGAGAAATTCTTTTTTATCCATCAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCACCGATGTTTTAAAAAAAACTAAAATTTTAGAAGCATACTAAAGTTAATATATGATTTCTTATTTTCAAGATTACGT p_0059 JAHIRM010000026.1_5501_29617__16283_17074_F2 p_0004 p_0004 7264 164 TGCTAATAT 3 0.97 poor intergenic + TTTGATGTTTTAAATAAGAATATTCCGTGAGAGCCTTCTCTTTTATTTGTGATAATGCTAATATAAAGATA 93 164 JAHIRM010000026.1_5501_29617__16283_17074 JAHIRM010000026.1_5501_29617__16283_17074_F2 intergenic 7100 7336 + up CAAAACTATAAAAATAAACAATCGCGAAGCTAACGATTGTTTTTTTTATATCTTGATTATTCAAAAAGACATGATCTATCATTTTTTTTGAAATTTGATGTTTTAAATAAGAATATTCCGTGAGAGCCTTCTCTTTTATTTGTGATAATGCTAATATAAAGATAATAATATTTTCTTACTTTCTTTTTTTATTATCTCTTATTCATAGATGTAAAACATCAGAAGGGAAATCGCTA AACAATACTGGTCCCAACGCCTTAACAAAACTATAAAAATAAACAATCGCGAAGCTAACGATTGTTTTTTTTATATCTTGATTATTCAAAAAGACATGATCTATCATTTTTTTTGAAATTTGATGTTTTAAATAAGAATATTCCGTGAGAGCCTTCTCTTTTATTTGTGATAATGCTAATATAAAGATAATAATATTTTCTTACTTTCTTTTTTTATTATCTCTTATTCATAGATGTAAAACATCAGAAGGGAAATCGCTATGGTAAAACACTTTTTTATGTCAGT p_0004 JAOIQD010000008.1_36561_46435__41778_42602_R2 p_0043 p_0043 7277 75 CATACTAAA 2 0.96 poor intergenic + AAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTA 1 72 JAOIQD010000008.1_36561_46435__41778_42602 JAOIQD010000008.1_36561_46435__41778_42602_R2 intergenic 7202 7279 + up AAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATA CTAGAAAAAAATTATTTTTATCCATAAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATATGATTTCTTATTTTCAGGATTACGT p_0043 JAOIPA010000001.1_23837_33711__29054_29878_R2 p_0040 p_0040 7277 75 CATACTAAA 2 0.96 poor intergenic + AAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTA 1 72 JAOIPA010000001.1_23837_33711__29054_29878 JAOIPA010000001.1_23837_33711__29054_29878_R2 intergenic 7202 7279 + up AAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATA TTAGAAATAAATTATTTTTATCCATAAAAAAATTTTACAAAAGAATTCCTCTGAAGTTTGAAATAAAACTAAACTTTTTAAGAGCATACTAAAGTTATTATATGATTTCTTATTTTCAGGATTACGT p_0040 JALNYV010000001.1_259838_270234__263730_264500_R3 p_0026 p_0026 7465 102 AATCTAAAT 3 1.0 poor intergenic + TTTAAATATATAACAGTGATAATTTTTTCTTGTTTACTATTTATCTTTCTTATACAATCTAAATACATATA 25 96 JALNYV010000001.1_259838_270234__263730_264500 JALNYV010000001.1_259838_270234__263730_264500_R3 intergenic 7363 7484 + up 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GAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAATTCAAAATCAAAGATATCCTTAATA 39 110 JAOION010000005.1_14696_24570__18529_19353 JAOION010000005.1_14696_24570__18529_19353_R3 intergenic 7465 7577 - up GTCAGTCATTAAATTAACTAGTAAGCTCGAAACCGAATAGAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAATTCAAAATCAAAGATATCCTTAATAAT AATTGATTGCGCAAGCAGGTTTCTAGTCAGTCATTAAATTAACTAGTAAGCTCGAAACCGAATAGAATTCTGGCCAGGGGTTTCTCTGGCCAGAATTTTTCTTTTAATAATTCAAAATCAAAGATATCCTTAATAATGTGAAAATTCCTAAAAGTTTAATTT p_0034 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779_R4 p_0086 p_0086 7531 80 GGATATAAT 4 1.0 poor intergenic + TCGCCATAATATTGGCGATTTTTTATATTTTATTATTGACATATGTCATTAATGGGGATATAATTAATTAT 10 81 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779_R4 intergenic 7451 7566 + up TAATAATTATCGCCATAATATTGGCGATTTTTTATATTTTATTATTGACATATGTCATTAATGGGGATATAATTAATTATAGACATATGTCAATAATGAAAAGGAGGTGAAATAA 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TAATTTGATTTTAACCAACCTGTAGGAAATTTTAGTTTTATTTGAAAGTTGAGCGTAATTGTTTGTAAACTTTTTTTATA GCGTACTCCTGAAAATAAGAATTCATAATTTGATTTTAACCAACCTGTAGGAAATTTTAGTTTTATTTGAAAGTTGAGCGTAATTGTTTGTAAACTTTTTTTATAATGAATCTTAAAAATATTATCGGGA p_0022 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779_R5 p_0087 p_0087 7955 102 AAGTATATA 3 1.0 poor intergenic + TTTAATATATATTTGTGTAATAAAGAGAAGAACAATCTTGACTTTTATAAAGAGGAAGTATATACTTTAGA 33 104 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779 JAQVRR010000014.1_6718_15663__9994_10779_R5 intergenic 7853 8251 + up TTAAAATAAAACCTCTTATTGAGGTTTTATTTTTAATATATATTTGTGTAATAAAGAGAAGAACAATCTTGACTTTTATAAAGAGGAAGTATATACTTTAGATATCTCTTTGCAATGCATTTAGCTACATTACAATCTGATCAGGCGGTACATGATGCGCAGCCGGGCCTTAATAATGGCAACAGGATCCACCTGTGGGACGGAAATCTCGCGGGTGTTATATAGGTAACCTAACTCCCATAGAAGTGCTTGTTTTGAGACATTAATCGAAGGGAGTTTTTATTATGCTTAAATTGGTCATAAAGAAGTAGAAATATTAATAAGTGTTTATATTATATTAAGGTTTATCGGGTATCAATATAGAGTAAGAAAGGCTAATAGGAAAGGATTGATATAAA 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TTTTTTCCTCCTAAATATTGATAAGTTCATTATAGCATGTCATATGCAATATGTAATATTTTTTGCTTAATTTTACATTTTTACTTTTAATTAATAGTATATACGTGATATTTATTCGCATTTTCTCACAGGTAACATCCACTTCAAAAAAAACTTTTTTGAAAAACGTTTCAAATTTATGCCTAATATTGGTTTTTAATATGTTTTTTTCTAAAAACATAACACCAATGTTCATATGAATGATATAATATTTTTAGTAGCGTGTTGATTTTTGAAATAATTTTAGGCTTGATTTTTATTCAATTCGCCATCCTTTCTTTCAAATTTAGAGTATATATTATGAACATCATTAGCATAAGAGGAGGTGCAGCTCA AGTTTTTTAAGTTGAGTTAGTTCCATTTTTTCCTCCTAAATATTGATAAGTTCATTATAGCATGTCATATGCAATATGTAATATTTTTTGCTTAATTTTACATTTTTACTTTTAATTAATAGTATATACGTGATATTTATTCGCATTTTCTCACAGGTAACATCCACTTCAAAAAAAACTTTTTTGAAAAACGTTTCAAATTTATGCCTAATATTGGTTTTTAATATGTTTTTTTCTAAAAACATAACACCAATGTTCATATGAATGATATAATATTTTTAGTAGCGTGTTGATTTTTGAAATAATTTTAGGCTTGATTTTTATTCAATTCGCCATCCTTTCTTTCAAATTTAGAGTATATATTATGAACATCATTAGCATAAGAGGAGGTGCAGCTCAATGCACAATTCAATTCACAACTACT p_0013 JAHIVB010000006.1_103316_117045__111608_112402_HeR p_0010 p_0010 8146 227 TTCAAAAAA 3 1.0 poor intergenic + GTTTTTAGAAAAAAACATATTAAAAACCAATATTAGGCATAAATTTGAAACGTTTTTCAAAAAAGTTTTTT 158 229 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