chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907_F3 p_0013 p_0013 2153 184 AAGACTATT 2 0.22 poor intergenic + ACTTGAGGCAAGCCGTTGTAGTTCGCAATCCTTCGCTCTGAATTTTTAGCTATTCAAGACTATTCTTTGCG 114 185 SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907 SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907_F3 intergenic 2151 2337 - up AGAGCAGGCTCGGTTGTCTTTGGTGCTTCTGCATTATTTCTGCTTATGCTGCCAACATTATCTCTTGACCTGCTTGTTTAATTTATTGCGCAAATAAACAAGTGGGTTTCATCACTTGAGGCAAGCCGTTGTAGTTCGCAATCCTTCGCTCTGAATTTTTAGCTATTCAAGACTATTCTTTGCGCT TCAGCAAAATCACGACAATCTTGTAAGAGCAGGCTCGGTTGTCTTTGGTGCTTCTGCATTATTTCTGCTTATGCTGCCAACATTATCTCTTGACCTGCTTGTTTAATTTATTGCGCAAATAAACAAGTGGGTTTCATCACTTGAGGCAAGCCGTTGTAGTTCGCAATCCTTCGCTCTGAATTTTTAGCTATTCAAGACTATTCTTTGCGCTATGCCACGGTTCGCAAAAGATAAGA p_0013 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F4 p_0006 p_0006 2242 99 TGTTTTTTT 3 1.0 poor intergenic + TAGAAAAGTGTAACATAGTTATATACAATTTTAAACAGCTGCGGAAGATTTTCTCTGTTTTTTTGGGTGTT 24 95 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F4 intergenic 2137 2341 - up TGCTGCGTTCACCTCTGTCGCTTGAATTTAGAAAAGTGTAACATAGTTATATACAATTTTAAACAGCTGCGGAAGATTTTCTCTGTTTTTTTGGGTGTTTAAGCGACGGCGATTGAAAACATCACAGCTGTGTGGTAAAGTCTTACTTGGAAACGCCGGATATCAAGTTAGGCGACCGATAAAAATTGAACGGAAAGCTAGTTT ACGATTGAAACCGTTTTTATCTCCATGCTGCGTTCACCTCTGTCGCTTGAATTTAGAAAAGTGTAACATAGTTATATACAATTTTAAACAGCTGCGGAAGATTTTCTCTGTTTTTTTGGGTGTTTAAGCGACGGCGATTGAAAACATCACAGCTGTGTGGTAAAGTCTTACTTGGAAACGCCGGATATCAAGTTAGGCGACCGATAAAAATTGAACGGAAAGCTAGTTTATGAAAGAGTATAAAAACGAGGACA p_0006 SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907_F3 p_0012 p_0012 2247 90 TGTTTAATT 3 1.0 poor intergenic + TTGGTGCTTCTGCATTATTTCTGCTTATGCTGCCAACATTATCTCTTGACCTGCTTGTTTAATTTATTGCG 16 87 SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907 SHVK01000001.1_124695_134537__129140_129907_F3 intergenic 2151 2337 - up AGAGCAGGCTCGGTTGTCTTTGGTGCTTCTGCATTATTTCTGCTTATGCTGCCAACATTATCTCTTGACCTGCTTGTTTAATTTATTGCGCAAATAAACAAGTGGGTTTCATCACTTGAGGCAAGCCGTTGTAGTTCGCAATCCTTCGCTCTGAATTTTTAGCTATTCAAGACTATTCTTTGCGCT TCAGCAAAATCACGACAATCTTGTAAGAGCAGGCTCGGTTGTCTTTGGTGCTTCTGCATTATTTCTGCTTATGCTGCCAACATTATCTCTTGACCTGCTTGTTTAATTTATTGCGCAAATAAACAAGTGGGTTTCATCACTTGAGGCAAGCCGTTGTAGTTCGCAATCCTTCGCTCTGAATTTTTAGCTATTCAAGACTATTCTTTGCGCTATGCCACGGTTCGCAAAAGATAAGA p_0012 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F3 p_0005 p_0005 2292 155 TGTTTAAAA 3 1.0 poor intergenic + GTTTTCAATCGCCGTCGCTTAAACACCCAAAAAAACAGAGAAAATCTTCCGCAGCTGTTTAAAATTGTATA 83 154 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F3 intergenic 2137 2341 + up AAACTAGCTTTCCGTTCAATTTTTATCGGTCGCCTAACTTGATATCCGGCGTTTCCAAGTAAGACTTTACCACACAGCTGTGATGTTTTCAATCGCCGTCGCTTAAACACCCAAAAAAACAGAGAAAATCTTCCGCAGCTGTTTAAAATTGTATATAACTATGTTACACTTTTCTAAATTCAAGCGACAGAGGTGAACGCAGCA TGTCCTCGTTTTTATACTCTTTCATAAACTAGCTTTCCGTTCAATTTTTATCGGTCGCCTAACTTGATATCCGGCGTTTCCAAGTAAGACTTTACCACACAGCTGTGATGTTTTCAATCGCCGTCGCTTAAACACCCAAAAAAACAGAGAAAATCTTCCGCAGCTGTTTAAAATTGTATATAACTATGTTACACTTTTCTAAATTCAAGCGACAGAGGTGAACGCAGCATGGAGATAAAAACGGTTTCAATCGT p_0005 WVZV01000421.1_9149_21427__13817_14635_F4 p_0025 p_0025 2363 210 TATTATAAT 5 0.82 poor intergenic + TCGCAGATCCTCTTTTGCTTAGGGTCCAGTCAGATATTTTGTACTGAAGATTTTATATTATAATACGCAGC 139 210 WVZV01000421.1_9149_21427__13817_14635 WVZV01000421.1_9149_21427__13817_14635_F4 intergenic 2282 2573 - up ACCCGGACGTATACATTTAGGTGAAAAACCATATACTGATGTGATCTCTCCCGATGCGAGTGTACTCTAATGTACTGTGCGTGAGAATCCAGCAACGTGCCGGAAGAGATCTGGACACTACCGCAAGAAGAGATAGTCCTCGCAGATCCTCTTTTGCTTAGGGTCCAGTCAGATATTTTGTACTGAAGATTTTATATTATAATACGCAGCAGACTGTGTCGCGAATTAGGTGGATTTGTGGCAGAAGGGAAATTTCAACGTAAATTGCTGTTCTTATGTGGTTCTCATACT AGATGAATTATCAATTGTTATTCTGACCCGGACGTATACATTTAGGTGAAAAACCATATACTGATGTGATCTCTCCCGATGCGAGTGTACTCTAATGTACTGTGCGTGAGAATCCAGCAACGTGCCGGAAGAGATCTGGACACTACCGCAAGAAGAGATAGTCCTCGCAGATCCTCTTTTGCTTAGGGTCCAGTCAGATATTTTGTACTGAAGATTTTATATTATAATACGCAGCAGACTGTGTCGCGAATTAGGTGGATTTGTGGCAGAAGGGAAATTTCAACGTAAATTGCTGTTCTTATGTGGTTCTCATACTTTGCTCCATGTCTATACAAATCTTC p_0025 SHVF01000027.1_3143_14181__7700_8464_F2 p_0010 p_0010 3411 163 AAAAAATTA 3 0.86 poor intergenic + TAAACCGGTCCCCTCGCCGCGGGGTTTGTCGCACCGGTAAAACCCGACAAAACCCAAAAAATTAGGAGCTT 94 165 SHVF01000027.1_3143_14181__7700_8464 SHVF01000027.1_3143_14181__7700_8464_F2 intergenic 3405 3574 - up AGCCTTACTTGCTCCTATTTGCTTAGCCGCGTTACTATCTATCCATGACATCACTTCGCAGCCTCCTCCTTCGCTGCCGTGGCGGGGCCAAGTAAACCGGTCCCCTCGCCGCGGGGTTTGTCGCACCGGTAAAACCCGACAAAACCCAAAAAATTAGGAGCTTTAAAAA TAATGGAGCAGATTCACGTTTTCTAAGCCTTACTTGCTCCTATTTGCTTAGCCGCGTTACTATCTATCCATGACATCACTTCGCAGCCTCCTCCTTCGCTGCCGTGGCGGGGCCAAGTAAACCGGTCCCCTCGCCGCGGGGTTTGTCGCACCGGTAAAACCCGACAAAACCCAAAAAATTAGGAGCTTTAAAAAATGTCATCAAAAAAGAATTTCCCAG p_0010 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R2 p_0020 p_0020 5649 266 AATATCTAT 2 0.99 poor intergenic + ATAAATGGCTAATTGCCACTCATTTGCAAGTGCAATCCAGTTGTTTGCCCAGGTCAATATCTATACTCATG 196 267 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R2 intergenic 5647 5915 - up TAATAATTCCTTTCAGATGGAGTAGTTGTTTTAAAAATCCGGAAAACAAAAAATAAAAGAGGGCTGGAAAAAACTAAGCGCGACAGCGTGAAATATTCATGCGGCAGTAATCGATTACACGGCGTTTGGTTAATACGTTCATCACTGCCTCATTTCTTCGCTCGACAACCTGGAGGAAAGATAATCAAATTTCTGATAAATGGCTAATTGCCACTCATTTGCAAGTGCAATCCAGTTGTTTGCCCAGGTCAATATCTATACTCATGAT ACCGAGATTTTCTTAGAAATCTTCATAATAATTCCTTTCAGATGGAGTAGTTGTTTTAAAAATCCGGAAAACAAAAAATAAAAGAGGGCTGGAAAAAACTAAGCGCGACAGCGTGAAATATTCATGCGGCAGTAATCGATTACACGGCGTTTGGTTAATACGTTCATCACTGCCTCATTTCTTCGCTCGACAACCTGGAGGAAAGATAATCAAATTTCTGATAAATGGCTAATTGCCACTCATTTGCAAGTGCAATCCAGTTGTTTGCCCAGGTCAATATCTATACTCATGATATGCGCCTTCGCAGCACAGTATTGA p_0020 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R3 p_0017 p_0017 5742 95 TTTGATTAT 2 0.93 poor intergenic + GGCAAACAACTGGATTGCACTTGCAAATGAGTGGCAATTAGCCATTTATCAGAAATTTGATTATCTTTCCT 26 97 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R3 intergenic 5647 5915 + up ATCATGAGTATAGATATTGACCTGGGCAAACAACTGGATTGCACTTGCAAATGAGTGGCAATTAGCCATTTATCAGAAATTTGATTATCTTTCCTCCAGGTTGTCGAGCGAAGAAATGAGGCAGTGATGAACGTATTAACCAAACGCCGTGTAATCGATTACTGCCGCATGAATATTTCACGCTGTCGCGCTTAGTTTTTTCCAGCCCTCTTTTATTTTTTGTTTTCCGGATTTTTAAAACAACTACTCCATCTGAAAGGAATTATTA TCAATACTGTGCTGCGAAGGCGCATATCATGAGTATAGATATTGACCTGGGCAAACAACTGGATTGCACTTGCAAATGAGTGGCAATTAGCCATTTATCAGAAATTTGATTATCTTTCCTCCAGGTTGTCGAGCGAAGAAATGAGGCAGTGATGAACGTATTAACCAAACGCCGTGTAATCGATTACTGCCGCATGAATATTTCACGCTGTCGCGCTTAGTTTTTTCCAGCCCTCTTTTATTTTTTGTTTTCCGGATTTTTAAAACAACTACTCCATCTGAAAGGAATTATTATGAAGATTTCTAAGAAAATCTCGGT p_0017 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R2 p_0019 p_0019 5835 80 TGGAAAAAA 3 1.0 poor intergenic + CTTTCAGATGGAGTAGTTGTTTTAAAAATCCGGAAAACAAAAAATAAAAGAGGGCTGGAAAAAACTAAGCG 3 74 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R2 intergenic 5647 5915 - up TAATAATTCCTTTCAGATGGAGTAGTTGTTTTAAAAATCCGGAAAACAAAAAATAAAAGAGGGCTGGAAAAAACTAAGCGCGACAGCGTGAAATATTCATGCGGCAGTAATCGATTACACGGCGTTTGGTTAATACGTTCATCACTGCCTCATTTCTTCGCTCGACAACCTGGAGGAAAGATAATCAAATTTCTGATAAATGGCTAATTGCCACTCATTTGCAAGTGCAATCCAGTTGTTTGCCCAGGTCAATATCTATACTCATGAT ACCGAGATTTTCTTAGAAATCTTCATAATAATTCCTTTCAGATGGAGTAGTTGTTTTAAAAATCCGGAAAACAAAAAATAAAAGAGGGCTGGAAAAAACTAAGCGCGACAGCGTGAAATATTCATGCGGCAGTAATCGATTACACGGCGTTTGGTTAATACGTTCATCACTGCCTCATTTCTTCGCTCGACAACCTGGAGGAAAGATAATCAAATTTCTGATAAATGGCTAATTGCCACTCATTTGCAAGTGCAATCCAGTTGTTTGCCCAGGTCAATATCTATACTCATGATATGCGCCTTCGCAGCACAGTATTGA p_0019 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F1 p_0008 p_0008 5863 139 CTCTACAAT 2 1.0 poor intergenic + CAAATGTCAAGACGTAAATATGAGCGATAATTGACTTGACATTTGGCCGAAAGAACTCTACAATGACAGTT 67 138 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_F1 intergenic 5817 6002 - up TAATGGTCCCTCTTTTCTTGTTTTTTCAGTAGTGCTAAGTCCCTCTTTCAACTTATATAAATATTTCCCAAATGTCAAGACGTAAATATGAGCGATAATTGACTTGACATTTGGCCGAAAGAACTCTACAATGACAGTTGCGATAACAACAGTTGCGTTAACAACTAATGAAACGGGGCGCTTTT AGTTTCTTGAAGCTCGTGTCAGCCATAATGGTCCCTCTTTTCTTGTTTTTTCAGTAGTGCTAAGTCCCTCTTTCAACTTATATAAATATTTCCCAAATGTCAAGACGTAAATATGAGCGATAATTGACTTGACATTTGGCCGAAAGAACTCTACAATGACAGTTGCGATAACAACAGTTGCGTTAACAACTAATGAAACGGGGCGCTTTTATGCTGATGAGCAATTTGTCTATCA p_0008 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R3 p_0018 p_0018 5916 269 TGAAAGGAA 2 1.0 poor intergenic + TTTCCAGCCCTCTTTTATTTTTTGTTTTCCGGATTTTTAAAACAACTACTCCATCTGAAAGGAATTATTA 194 265 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053 VGAL01000020.1_10536_19408__14289_15053_R3 intergenic 5647 5915 + up ATCATGAGTATAGATATTGACCTGGGCAAACAACTGGATTGCACTTGCAAATGAGTGGCAATTAGCCATTTATCAGAAATTTGATTATCTTTCCTCCAGGTTGTCGAGCGAAGAAATGAGGCAGTGATGAACGTATTAACCAAACGCCGTGTAATCGATTACTGCCGCATGAATATTTCACGCTGTCGCGCTTAGTTTTTTCCAGCCCTCTTTTATTTTTTGTTTTCCGGATTTTTAAAACAACTACTCCATCTGAAAGGAATTATTA TCAATACTGTGCTGCGAAGGCGCATATCATGAGTATAGATATTGACCTGGGCAAACAACTGGATTGCACTTGCAAATGAGTGGCAATTAGCCATTTATCAGAAATTTGATTATCTTTCCTCCAGGTTGTCGAGCGAAGAAATGAGGCAGTGATGAACGTATTAACCAAACGCCGTGTAATCGATTACTGCCGCATGAATATTTCACGCTGTCGCGCTTAGTTTTTTCCAGCCCTCTTTTATTTTTTGTTTTCCGGATTTTTAAAACAACTACTCCATCTGAAAGGAATTATTATGAAGATTTCTAAGAAAATCTCGGT p_0018 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_HeR p_0007 p_0007 5956 139 ATTTATATA 3 1.0 poor intergenic + CGGCCAAATGTCAAGTCAATTATCGCTCATATTTACGTCTTGACATTTGGGAAATATTTATATAAGTTGAA 73 144 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_HeR intergenic 5817 6002 + up AAAAGCGCCCCGTTTCATTAGTTGTTAACGCAACTGTTGTTATCGCAACTGTCATTGTAGAGTTCTTTCGGCCAAATGTCAAGTCAATTATCGCTCATATTTACGTCTTGACATTTGGGAAATATTTATATAAGTTGAAAGAGGGACTTAGCACTACTGAAAAAACAAGAAAAGAGGGACCATTA TGATAGACAAATTGCTCATCAGCATAAAAGCGCCCCGTTTCATTAGTTGTTAACGCAACTGTTGTTATCGCAACTGTCATTGTAGAGTTCTTTCGGCCAAATGTCAAGTCAATTATCGCTCATATTTACGTCTTGACATTTGGGAAATATTTATATAAGTTGAAAGAGGGACTTAGCACTACTGAAAAAACAAGAAAAGAGGGACCATTATGGCTGACACGAGCTTCAAGAAACT p_0007 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_R1 p_0009 p_0009 6895 102 TGTTATTAT 3 1.0 poor intergenic + TTTTTTGGGAATACGGGGTATTTGCTTTTCGAGGACTTGTCATTTTACCGAGATGTGTTATTATAGGTTAA 30 101 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263 SAAS01000002.1_213471_224434__219472_220263_R1 intergenic 6793 6931 + up ATCACAAACCGATAACAAATACCCCGTATCCTTTTTTGGGAATACGGGGTATTTGCTTTTCGAGGACTTGTCATTTTACCGAGATGTGTTATTATAGGTTAATTGTATAAATATTACTTATTCAGAGGTAAATCGCTA ATTTTTCGGCGCGATGCAGCCGTAAATCACAAACCGATAACAAATACCCCGTATCCTTTTTTGGGAATACGGGGTATTTGCTTTTCGAGGACTTGTCATTTTACCGAGATGTGTTATTATAGGTTAATTGTATAAATATTACTTATTCAGAGGTAAATCGCTATGGATCCCAAACGCCGCGCAATAAT p_0009 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838_HeR p_0004 p_0004 7100 92 TGATTTAAT 3 1.0 poor intergenic + AAAACAAAAACCTAGCCATCTCAAAATAAATGAAAAATAGATATACAATAAAACCTGATTTAATAATTAAA 19 90 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838_HeR intergenic 7080 7192 - up TATATGTTAATGGGTCTCTCCAAAACAAAAACCTAGCCATCTCAAAATAAATGAAAAATAGATATACAATAAAACCTGATTTAATAATTAAAGTAATAATTAAAGTGGTTTT TCAAGAACTCTGGTTTTAAGCTCCATATATGTTAATGGGTCTCTCCAAAACAAAAACCTAGCCATCTCAAAATAAATGAAAAATAGATATACAATAAAACCTGATTTAATAATTAAAGTAATAATTAAAGTGGTTTTATGGATAATGTTGAGAGAAAAAAGG p_0004 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838_R1 p_0003 p_0003 7156 76 ATTTATTTT 3 1.0 poor intergenic + CACTTTAATTATTACTTTAATTATTAAATCAGGTTTTATTGTATATCTATTTTTCATTTATTTTGAGATGG 0 71 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838 RYFX01000028.1_17759_26958__24026_24838_R1 intergenic 7080 7192 + up AAAACCACTTTAATTATTACTTTAATTATTAAATCAGGTTTTATTGTATATCTATTTTTCATTTATTTTGAGATGGCTAGGTTTTTGTTTTGGAGAGACCCATTAACATATA CCTTTTTTCTCTCAACATTATCCATAAAACCACTTTAATTATTACTTTAATTATTAAATCAGGTTTTATTGTATATCTATTTTTCATTTATTTTGAGATGGCTAGGTTTTTGTTTTGGAGAGACCCATTAACATATATGGAGCTTAAAACCAGAGTTCTTGA p_0003 WJIL01000031.1_569_12444__7026_7850_HeR p_0022 p_0022 7401 96 TGTAATAAA 4 1.0 poor intergenic + CAAATACAGCTGAGCCATAGTTGATATTAATACTTTTAAAAATATCTGTAACAAATGTAATAAATATACCT 25 96 WJIL01000031.1_569_12444__7026_7850 WJIL01000031.1_569_12444__7026_7850_HeR intergenic 7282 7497 - 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