chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0002 p_0001 p_0001 3264 262 TTTTATAAT 5 0.32 poor intergenic + TCTTATTATTGATGAAAAATGTAATAATTTTAAACTGTAAAATAGTGTAAAGTTATTTTATAATATAAATA 191 262 rs14085 CDS_0002 intergenic 3229 3526 - up GTGAATGGAAAGATAGTAAGGATATACATTTTATTATTAAAAAATATTCAATAGAAGTTTATAAATATAAAATAACAAAAAGGGGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTGTTGTTTTATATTTTTATCATTTAAATAATGAAAAATAGGCTTGTCTATATTTTTAGATAGTTTTCTTATTATTGATGAAAAATGTAATAATTTTAAACTGTAAAATAGTGTAAAGTTATTTTATAATATAAATATAGTAAGATTTTAAACAAAATAAGGGGGAATAATA AACTAAATACTCTTTTAGGAAAATAGTGAATGGAAAGATAGTAAGGATATACATTTTATTATTAAAAAATATTCAATAGAAGTTTATAAATATAAAATAACAAAAAGGGGTGTCTCAAAATGAACTTTTTAGTTCATGAGGCACTCTTTTTTGTTGTTTTATATTTTTATCATTTAAATAATGAAAAATAGGCTTGTCTATATTTTTAGATAGTTTTCTTATTATTGATGAAAAATGTAATAATTTTAAACTGTAAAATAGTGTAAAGTTATTTTATAATATAAATATAGTAAGATTTTAAACAAAATAAGGGGGAATAATAATGAAAGCACCAAAAACTATTTTAA p_0001 CDS_0004 p_0002 p_0002 6020 83 TGATAAAAT 4 0.51 poor intergenic + ATATGTATTTAATTTTTATTATATCAGATTTCTAAATTAAGGTCATATTTTATTTTGATAAAATATGGATT 13 84 rs14085 CDS_0004 intergenic 5937 6164 + up GTTTACCCCCTTATATGTATTTAATTTTTATTATATCAGATTTCTAAATTAAGGTCATATTTTATTTTGATAAAATATGGATTATGAGTACATATTAATTATAGAATATTATAGTTTTATTTTTATAATATTTTAAGATATATTGATTTATTAATAGATGTGCTATACTAATGTTTGTTAGTATCTTTAAGTATATTTATATTAAATTAGATTAGGAGGATTATATT ATTTTTTTGATTTGTACTTTCTCATGTTTACCCCCTTATATGTATTTAATTTTTATTATATCAGATTTCTAAATTAAGGTCATATTTTATTTTGATAAAATATGGATTATGAGTACATATTAATTATAGAATATTATAGTTTTATTTTTATAATATTTTAAGATATATTGATTTATTAATAGATGTGCTATACTAATGTTTGTTAGTATCTTTAAGTATATTTATATTAAATTAGATTAGGAGGATTATATTTGATTTTAAAAAAGCATAGAGAGAC p_0002 CDS_0003 p_0004 p_0004 6027 137 TTCTATAAT 4 0.98 poor intergenic + ACATCTATTAATAAATCAATATATCTTAAAATATTATAAAAATAAAACTATAATATTCTATAATTAATATG 66 137 rs14085 CDS_0003 intergenic 5937 6164 - up AATATAATCCTCCTAATCTAATTTAATATAAATATACTTAAAGATACTAACAAACATTAGTATAGCACATCTATTAATAAATCAATATATCTTAAAATATTATAAAAATAAAACTATAATATTCTATAATTAATATGTACTCATAATCCATATTTTATCAAAATAAAATATGACCTTAATTTAGAAATCTGATATAATAAAAATTAAATACATATAAGGGGGTAAAC GTCTCTCTATGCTTTTTTAAAATCAAATATAATCCTCCTAATCTAATTTAATATAAATATACTTAAAGATACTAACAAACATTAGTATAGCACATCTATTAATAAATCAATATATCTTAAAATATTATAAAAATAAAACTATAATATTCTATAATTAATATGTACTCATAATCCATATTTTATCAAAATAAAATATGACCTTAATTTAGAAATCTGATATAATAAAAATTAAATACATATAAGGGGGTAAACATGAGAAAGTACAAATCAAAAAAAT p_0004 CDS_0004 p_0003 p_0003 6111 174 TGTGCTATA 2 1.0 poor intergenic + GAATATTATAGTTTTATTTTTATAATATTTTAAGATATATTGATTTATTAATAGATGTGCTATACTAATGT 105 176 rs14085 CDS_0004 intergenic 5937 6164 + up GTTTACCCCCTTATATGTATTTAATTTTTATTATATCAGATTTCTAAATTAAGGTCATATTTTATTTTGATAAAATATGGATTATGAGTACATATTAATTATAGAATATTATAGTTTTATTTTTATAATATTTTAAGATATATTGATTTATTAATAGATGTGCTATACTAATGTTTGTTAGTATCTTTAAGTATATTTATATTAAATTAGATTAGGAGGATTATATT ATTTTTTTGATTTGTACTTTCTCATGTTTACCCCCTTATATGTATTTAATTTTTATTATATCAGATTTCTAAATTAAGGTCATATTTTATTTTGATAAAATATGGATTATGAGTACATATTAATTATAGAATATTATAGTTTTATTTTTATAATATTTTAAGATATATTGATTTATTAATAGATGTGCTATACTAATGTTTGTTAGTATCTTTAAGTATATTTATATTAAATTAGATTAGGAGGATTATATTTGATTTTAAAAAAGCATAGAGAGAC p_0003