chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0001 p_0004 p_0004 250 251 TTTTATTAT 3 1.0 poor intergenic + GTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAG 179 250 pVLT31 CDS_0001 intergenic 212 501 - up TACACGGTGCCTGACTGCGTTAGCAATTTAACTGTGATAAACTACCGCATTAAAGCTCGCGCAGATCAGTTGGAAGAATTTGTCCACTACGTGAAAGGCGAGATCACCAAGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATC ACGATGAGCGCATTGTTAGATTTCATACACGGTGCCTGACTGCGTTAGCAATTTAACTGTGATAAACTACCGCATTAAAGCTCGCGCAGATCAGTTGGAAGAATTTGTCCACTACGTGAAAGGCGAGATCACCAAGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTA p_0004 CDS_0002 p_0001 p_0001 294 82 TGATAGTTT 2 1.0 poor intergenic + CAATTTGTGTAGGGCTTATTATGCACGCTTAAAAATAATAAAAGCAGACTTGACCTGATAGTTTGGCTGTG 11 82 pVLT31 CDS_0002 intergenic 212 501 + up GATATATCTCCCAATTTGTGTAGGGCTTATTATGCACGCTTAAAAATAATAAAAGCAGACTTGACCTGATAGTTTGGCTGTGAGCAATTATGTGCTTAGTGCATCTAACGCTTGAGTTAAGCCGCGCCGCGAAGCGGCGTCGGCTTGAACGAATTGTTAGACATTATTTGCCGACTACCTTGGTGATCTCGCCTTTCACGTAGTGGACAAATTCTTCCAACTGATCTGCGCGAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGTA TAACAAGAAAAAGCCAGCCTTTCATGATATATCTCCCAATTTGTGTAGGGCTTATTATGCACGCTTAAAAATAATAAAAGCAGACTTGACCTGATAGTTTGGCTGTGAGCAATTATGTGCTTAGTGCATCTAACGCTTGAGTTAAGCCGCGCCGCGAAGCGGCGTCGGCTTGAACGAATTGTTAGACATTATTTGCCGACTACCTTGGTGATCTCGCCTTTCACGTAGTGGACAAATTCTTCCAACTGATCTGCGCGAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGTATGAAATCTAACAATGCGCTCATCGT p_0001 CDS_0001 p_0003 p_0003 415 86 TGGAAGAAT 2 0.95 poor intergenic + TGCGTTAGCAATTTAACTGTGATAAACTACCGCATTAAAGCTCGCGCAGATCAGTTGGAAGAATTTGTCCA 15 86 pVLT31 CDS_0001 intergenic 212 501 - up TACACGGTGCCTGACTGCGTTAGCAATTTAACTGTGATAAACTACCGCATTAAAGCTCGCGCAGATCAGTTGGAAGAATTTGTCCACTACGTGAAAGGCGAGATCACCAAGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATC ACGATGAGCGCATTGTTAGATTTCATACACGGTGCCTGACTGCGTTAGCAATTTAACTGTGATAAACTACCGCATTAAAGCTCGCGCAGATCAGTTGGAAGAATTTGTCCACTACGTGAAAGGCGAGATCACCAAGGTAGTCGGCAAATAATGTCTAACAATTCGTTCAAGCCGACGCCGCTTCGCGGCGCGGCTTAACTCAAGCGTTAGATGCACTAAGCACATAATTGCTCACAGCCAAACTATCAGGTCAAGTCTGCTTTTATTATTTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGATATATCATGAAAGGCTGGCTTTTTCTTGTTA p_0003 CDS_0002 p_0002 p_0002 484 272 AGTTAAATT 3 0.99 poor intergenic + AGTGGACAAATTCTTCCAACTGATCTGCGCGAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACG 201 272 pVLT31 CDS_0002 intergenic 212 501 + up GATATATCTCCCAATTTGTGTAGGGCTTATTATGCACGCTTAAAAATAATAAAAGCAGACTTGACCTGATAGTTTGGCTGTGAGCAATTATGTGCTTAGTGCATCTAACGCTTGAGTTAAGCCGCGCCGCGAAGCGGCGTCGGCTTGAACGAATTGTTAGACATTATTTGCCGACTACCTTGGTGATCTCGCCTTTCACGTAGTGGACAAATTCTTCCAACTGATCTGCGCGAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGTA TAACAAGAAAAAGCCAGCCTTTCATGATATATCTCCCAATTTGTGTAGGGCTTATTATGCACGCTTAAAAATAATAAAAGCAGACTTGACCTGATAGTTTGGCTGTGAGCAATTATGTGCTTAGTGCATCTAACGCTTGAGTTAAGCCGCGCCGCGAAGCGGCGTCGGCTTGAACGAATTGTTAGACATTATTTGCCGACTACCTTGGTGATCTCGCCTTTCACGTAGTGGACAAATTCTTCCAACTGATCTGCGCGAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGCAGTCAGGCACCGTGTATGAAATCTAACAATGCGCTCATCGT p_0002 CDS_0004 p_0005 p_0005 2086 95 TTTTAAAAA 3 1.0 poor intergenic + CCTTTAATAGATTATATTACTAATTAATTGGGGACCCTAGAGGTCCCCTTTTTTATTTTAAAAATTTTTTC 25 96 pVLT31 CDS_0004 intergenic 1991 2126 + up TCCGGTGGATGACCTTTTGAATGACCTTTAATAGATTATATTACTAATTAATTGGGGACCCTAGAGGTCCCCTTTTTTATTTTAAAAATTTTTTCACAAAACGGTTTACAAGCATAAAGCTAAACGTGGCCAATA CAGCCTGCGCGAGCAGGGGAATTGATCCGGTGGATGACCTTTTGAATGACCTTTAATAGATTATATTACTAATTAATTGGGGACCCTAGAGGTCCCCTTTTTTATTTTAAAAATTTTTTCACAAAACGGTTTACAAGCATAAAGCTAAACGTGGCCAATATGGACAACTTCTTCGCCCCCGTTTT p_0005