chrom	Lstart	Lend	Lstem	Rstart	Rend	Rstem	loop	match%	Indels	score	AT	GC	ATpairs	GCpairs	GTpairs	Center	Lseq	Rseq	intergenic	tailL	tailR	polyTL	polyTR	strand	TTseq	FACoPscore	locus_tag	type	start	end	strand_y	stream	seq	aug_seq	3primeUTR	3primeUTRlen	ID
msp	1146	1170	25	1175	1199	25	4	72	0	15	90	10	100	0	0	1172	AAATTAGAAAAATTATAAAAAAAAT	ATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTT	True	AGGCAAAGA	TGCTTGACA	True	True	+	AAATTAGAAAAATTATAAAAAAAAT GCGA ATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTT TGCTTGACA	38	CDS_0002	intergenic	1081	1264	+	down	TTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTA	TAAAGAAGAAATCGAAAAGTTATAATTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTATGAAAAAAATTCTGGCGATTTTGAT	TTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTT	118	TTerm_0001
msp	2915	2924	10	2929	2938	10	4	100	0	20	40	60	40	60	0	2926	AAAACCCGCC	GGCGGGTTTT	True	TATAGTTTA	TTTGTGTCT	True	True	+	AAAACCCGCC GCAA GGCGGGTTTT TTTGTGTCT	88	CDS_0003	intergenic	2895	3024	+	down	TCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAA	AATCGGTGTTAAAGTTATCTACTAATCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAATGGATTTTGATTTTTCGCGCAAGAT	TCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTT	43	TTerm_0002
msp	3002	3012	11	3020	3030	11	7	81	0	12	77	22	88	11	0	3015	AATCGGTTTTA	TAAAATGGATT	True	TATGCTATA	TTGATTTTT	False	True	+	AATCGGTTTTA GGAGGCT TAAAATGGATT TTGATTTTT	24	CDS_0003	intergenic	2895	3024	+	down	TCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAA	AATCGGTGTTAAAGTTATCTACTAATCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAATGGATTTTGATTTTTCGCGCAAGAT	TCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAATGGATT	135	TTerm_0003
msp	4693	4707	15	4716	4730	15	8	93	0	25	56	43	57	42	0	4711	AAAAAGCTGCCCAAG	CTTGGACAGCTTTTT	True	ATAAAACAA	AATTATCGG	True	True	+	AAAAAGCTGCCCAAG CATTTGAA CTTGGACAGCTTTTT AATTATCGG	74	CDS_0004	intergenic	4643	4755	+	down	GCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTTAATTATCGGTTTAAAGTAAAAGACT	CGAATGGAAGACGGAAGAACTTTAAGCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTTAATTATCGGTTTAAAGTAAAAGACTTATTTTGTCTTTAAATATTCGTTAA	GCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTT	87	TTerm_0004
msp	4693	4707	15	4716	4730	15	8	93	0	25	56	43	57	42	0	4711	AAAAAGCTGCCCAAG	CTTGGACAGCTTTTT	True	ATAAAACAA	AATTATCGG	True	True	+	AAAAAGCTGCCCAAG CATTTGAA CTTGGACAGCTTTTT AATTATCGG	74	CDS_0005	intergenic	4643	4755	-	down	AGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTTTTGTTTTATGATTTTTCTATAAATTGTCCTTCTTACAGATTTTTAATTGC	TTAACGAATATTTAAAGACAAAATAAGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTTTTGTTTTATGATTTTTCTATAAATTGTCCTTCTTACAGATTTTTAATTGCTTAAAGTTCTTCCGTCTTCCATTCG	GCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTT	87	TTerm_0005
msp	1078	1087	10	1097	1106	10	9	90	0	15	100	0	100	0	0	1091	ATAATTAATT	AATAAATTAT	True	GAAAAGTTA	TCATTGTTT	True	False	-	ATAATTTATT TATCCACCT AATTAATTAT TAACTTTTC	30	CDS_0002	intergenic	1081	1264	+	down	TTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTA	TAAAGAAGAAATCGAAAAGTTATAATTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTATGAAAAAAATTCTGGCGATTTTGAT	TAAAAAATTCCTCCTTGTTATTTGTTTGCCATTATTGTAACACAGCCAAAATCACTTGTCAAGCAAAAATACAAAAAAGTTACACAAAATTCGCATTTTTTTTATAATTTTTCTAATTTCTTTGCCTTTTTTCGGCATATTAACAACAAAAACAATGAATAATTTATTTATCCACCTAATTAATTA	186	TTerm_0006
msp	1146	1170	25	1175	1199	25	4	72	0	15	90	10	100	0	0	1172	AAATTAGAAAAATTATAAAAAAAAT	ATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTT	True	AGGCAAAGA	TGCTTGACA	True	True	-	AAAATACAAAAAAGTTACACAAAAT TCGC ATTTTTTTTATAATTTTTCTAATTT TCTTTGCCT	38	CDS_0002	intergenic	1081	1264	+	down	TTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTA	TAAAGAAGAAATCGAAAAGTTATAATTAATTAGGTGGATAAATAAATTATTCATTGTTTTTGTTGTTAATATGCCGAAAAAAGGCAAAGAAATTAGAAAAATTATAAAAAAAATGCGAATTTTGTGTAACTTTTTTGTATTTTTGCTTGACAAGTGATTTTGGCTGTGTTACAATAATGGCAAACAAATAACAAGGAGGAATTTTTTATGAAAAAAATTCTGGCGATTTTGAT	TAAAAAATTCCTCCTTGTTATTTGTTTGCCATTATTGTAACACAGCCAAAATCACTTGTCAAGCAAAAATACAAAAAAGTTACACAAAATTCGCATTTTTTTTATAATTTTTCTAATT	118	TTerm_0007
msp	2915	2924	10	2929	2938	10	4	100	0	20	40	60	40	60	0	2926	AAAACCCGCC	GGCGGGTTTT	True	TATAGTTTA	TTTGTGTCT	True	True	-	AAAACCCGCC TTGC GGCGGGTTTT TAAACTATA	88	CDS_0003	intergenic	2895	3024	+	down	TCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAA	AATCGGTGTTAAAGTTATCTACTAATCTATACCTAGTATAGTTTAAAACCCGCCGCAAGGCGGGTTTTTTTGTGTCTAATAGACTCTGCTGCTATTCTCAAAACATTGAATAATCATGCGTCTTATGCTATAATCGGTTTTAGGAGGCTTAAAATGGATTTTGATTTTTCGCGCAAGAT	TTTTAAGCCTCCTAAAACCGATTATAGCATAAGACGCATGATTATTCAATGTTTTGAGAATAGCAGCAGAGTCTATTAGACACAAAAAAACCCGCCTTGCGGCGGGTTT	109	TTerm_0008
msp	4693	4707	15	4716	4730	15	8	93	0	25	56	43	57	42	0	4711	AAAAAGCTGCCCAAG	CTTGGACAGCTTTTT	True	ATAAAACAA	AATTATCGG	True	True	-	AAAAAGCTGTCCAAG TTCAAATG CTTGGGCAGCTTTTT TTGTTTTAT	74	CDS_0004	intergenic	4643	4755	+	down	GCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTTAATTATCGGTTTAAAGTAAAAGACT	CGAATGGAAGACGGAAGAACTTTAAGCAATTAAAAATCTGTAAGAAGGACAATTTATAGAAAAATCATAAAACAAAAAAGCTGCCCAAGCATTTGAACTTGGACAGCTTTTTAATTATCGGTTTAAAGTAAAAGACTTATTTTGTCTTTAAATATTCGTTAA	AGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTT	62	TTerm_0009
msp	4693	4707	15	4716	4730	15	8	93	0	25	56	43	57	42	0	4711	AAAAAGCTGCCCAAG	CTTGGACAGCTTTTT	True	ATAAAACAA	AATTATCGG	True	True	-	AAAAAGCTGTCCAAG TTCAAATG CTTGGGCAGCTTTTT TTGTTTTAT	74	CDS_0005	intergenic	4643	4755	-	down	AGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTTTTGTTTTATGATTTTTCTATAAATTGTCCTTCTTACAGATTTTTAATTGC	TTAACGAATATTTAAAGACAAAATAAGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTTTTGTTTTATGATTTTTCTATAAATTGTCCTTCTTACAGATTTTTAATTGCTTAAAGTTCTTCCGTCTTCCATTCG	AGTCTTTTACTTTAAACCGATAATTAAAAAGCTGTCCAAGTTCAAATGCTTGGGCAGCTTTT	62	TTerm_0010
