chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0038 p_0002 p_0002 31288 368 TTCTATAAA 3 1.0 poor intergenic + TGTGAGAACTCTGTGGGTTTTCTTTAATATTTCCATAAGTTGGAAAAATCCGGTGTTCTATAAAAAGACAC 293 364 Mycobacterium CDS_0038 intergenic 31119 31656 - up CGTTTCGCCCCTCTCGCGGTGCCCAGGTATCAACTACAGGTATCAACTACGGCAGAGTCATACTGAGTCATCTGTAGACTCTTAACCCGCCTTAGCTGCACGTTTGACACCATACACCCAGGTATGCGGGGGGTACATCTACGGGCTTTTAATCCGCACATGCAGTTAAGAACATGCAGGTCAGAGGCGGTTTTTGCGCGAGGTATCAACGAAAGTATCAACTAAGAGCCGGATCGGCGCTGGTCGGAGGGCTGCGACCCCTACACCTGCGGACACGTCTGGGCAACCCCTCGCCCCTGTGAGAACTCTGTGGGTTTTCTTTAATATTTCCATAAGTTGGAAAAATCCGGTGTTCTATAAAAAGACACTCGCTAGTGCCGTGCCCGACCAAGCAACGACAACAACCCGCTAAACGTCACCTTGGGCACTGGGTCTTTAAACGAAATCTTCAAATCACGCTCTAACGCAACTCACGTTGAGCAAGTGAACAGTCCTCGTAACTGGTGGTTACCTAAGTCCGGTAGGAGACACGCGCGC TTATTTTTCTCTGGCTCGTCGGCCACGTTTCGCCCCTCTCGCGGTGCCCAGGTATCAACTACAGGTATCAACTACGGCAGAGTCATACTGAGTCATCTGTAGACTCTTAACCCGCCTTAGCTGCACGTTTGACACCATACACCCAGGTATGCGGGGGGTACATCTACGGGCTTTTAATCCGCACATGCAGTTAAGAACATGCAGGTCAGAGGCGGTTTTTGCGCGAGGTATCAACGAAAGTATCAACTAAGAGCCGGATCGGCGCTGGTCGGAGGGCTGCGACCCCTACACCTGCGGACACGTCTGGGCAACCCCTCGCCCCTGTGAGAACTCTGTGGGTTTTCTTTAATATTTCCATAAGTTGGAAAAATCCGGTGTTCTATAAAAAGACACTCGCTAGTGCCGTGCCCGACCAAGCAACGACAACAACCCGCTAAACGTCACCTTGGGCACTGGGTCTTTAAACGAAATCTTCAAATCACGCTCTAACGCAACTCACGTTGAGCAAGTGAACAGTCCTCGTAACTGGTGGTTACCTAAGTCCGGTAGGAGACACGCGCGCATGAGCACCACGCCCCCACCCCCGT p_0002 CDS_0039 p_0001 p_0001 31360 241 TGTCTTTTT 1 0.97 poor intergenic + TGTCTTTTTATAGAACACCGGATTTTTCCAACTTATGGAAATATTAAAGAAAACCCACAGAGTTCTCACAG 170 241 Mycobacterium CDS_0039 intergenic 31119 31656 + up GCGCGCGTGTCTCCTACCGGACTTAGGTAACCACCAGTTACGAGGACTGTTCACTTGCTCAACGTGAGTTGCGTTAGAGCGTGATTTGAAGATTTCGTTTAAAGACCCAGTGCCCAAGGTGACGTTTAGCGGGTTGTTGTCGTTGCTTGGTCGGGCACGGCACTAGCGAGTGTCTTTTTATAGAACACCGGATTTTTCCAACTTATGGAAATATTAAAGAAAACCCACAGAGTTCTCACAGGGGCGAGGGGTTGCCCAGACGTGTCCGCAGGTGTAGGGGTCGCAGCCCTCCGACCAGCGCCGATCCGGCTCTTAGTTGATACTTTCGTTGATACCTCGCGCAAAAACCGCCTCTGACCTGCATGTTCTTAACTGCATGTGCGGATTAAAAGCCCGTAGATGTACCCCCCGCATACCTGGGTGTATGGTGTCAAACGTGCAGCTAAGGCGGGTTAAGAGTCTACAGATGACTCAGTATGACTCTGCCGTAGTTGATACCTGTAGTTGATACCTGGGCACCGCGAGAGGGGCGAAACG ACGGGGGTGGGGGCGTGGTGCTCATGCGCGCGTGTCTCCTACCGGACTTAGGTAACCACCAGTTACGAGGACTGTTCACTTGCTCAACGTGAGTTGCGTTAGAGCGTGATTTGAAGATTTCGTTTAAAGACCCAGTGCCCAAGGTGACGTTTAGCGGGTTGTTGTCGTTGCTTGGTCGGGCACGGCACTAGCGAGTGTCTTTTTATAGAACACCGGATTTTTCCAACTTATGGAAATATTAAAGAAAACCCACAGAGTTCTCACAGGGGCGAGGGGTTGCCCAGACGTGTCCGCAGGTGTAGGGGTCGCAGCCCTCCGACCAGCGCCGATCCGGCTCTTAGTTGATACTTTCGTTGATACCTCGCGCAAAAACCGCCTCTGACCTGCATGTTCTTAACTGCATGTGCGGATTAAAAGCCCGTAGATGTACCCCCCGCATACCTGGGTGTATGGTGTCAAACGTGCAGCTAAGGCGGGTTAAGAGTCTACAGATGACTCAGTATGACTCTGCCGTAGTTGATACCTGTAGTTGATACCTGGGCACCGCGAGAGGGGCGAAACGTGGCCGACGAGCCAGAGAAAAATAA p_0001 CDS_0056 p_0003 p_0003 41148 292 TGATTAATC 3 0.34 poor intergenic + CAGTAAAGCGGCTGTGGTCACTAACAGCAATCCCAAAGATATCTGTTGCTAATACTGATTAATCAAAATGT 226 297 Mycobacterium CDS_0056 intergenic 40856 41225 + up TGTTTCCGATACCGGGTGCCGCCCGGTATCTTTAAACATGTGGACGCTAACAGCAACTAACTGTTTGCGGATAACAAGAAAATGCGTCCAGTAAGAACGTGTGGACTCCTACAGCAATTACACTGCTTCCACTGTTAATGGCGAGGTCTGGGTTCGAGTCCCAGTAGCGGCCCTGTGTCGCTATAGCTTAAGGGCAGAGCGCGTATGCAAAAAACGGAGTCCAGTAAAGCGGCTGTGGTCACTAACAGCAATCCCAAAGATATCTGTTGCTAATACTGATTAATCAAAATGTGACCAGTTCCGCCGCGCACAAACCCGCTACCCGGTCGACGGGGGCGGGTTTTTTGTTGCCTTAAGGGAGGACTTACA GCAGATCAAAGTCTCCGGTTCCTAATGTTTCCGATACCGGGTGCCGCCCGGTATCTTTAAACATGTGGACGCTAACAGCAACTAACTGTTTGCGGATAACAAGAAAATGCGTCCAGTAAGAACGTGTGGACTCCTACAGCAATTACACTGCTTCCACTGTTAATGGCGAGGTCTGGGTTCGAGTCCCAGTAGCGGCCCTGTGTCGCTATAGCTTAAGGGCAGAGCGCGTATGCAAAAAACGGAGTCCAGTAAAGCGGCTGTGGTCACTAACAGCAATCCCAAAGATATCTGTTGCTAATACTGATTAATCAAAATGTGACCAGTTCCGCCGCGCACAAACCCGCTACCCGGTCGACGGGGGCGGGTTTTTTGTTGCCTTAAGGGAGGACTTACATGCCTGGACCAATGTCCGCGCCCAA p_0003 CDS_0109 p_0004 p_0004 67389 90 AACCTAAAA 2 1.0 poor intergenic + CTTCCATTCAAACTTTCGCTTTAGCTTTATTCACTAAAGCATCCTAAATTTCCTAAACCTAAAAGGGGTGG 15 86 Mycobacterium CDS_0109 intergenic 67382 67479 - up ATCCCCCGTTCGTCTCCCACTTCCATTCAAACTTTCGCTTTAGCTTTATTCACTAAAGCATCCTAAATTTCCTAAACCTAAAAGGGGTGGCTCAACC AAGTGGTGGAGCGGGCGGGGGAGTAATCCCCCGTTCGTCTCCCACTTCCATTCAAACTTTCGCTTTAGCTTTATTCACTAAAGCATCCTAAATTTCCTAAACCTAAAAGGGGTGGCTCAACCATGCGTATGCAGCGTTACGAGGACA p_0004