chrom Lstart Lend Lstem Rstart Rend Rstem loop match% Indels score AT GC ATpairs GCpairs GTpairs Center Lseq Rseq intergenic tailL tailR polyTL polyTR strand TTseq FACoPscore locus_tag type start end strand_y stream seq aug_seq 3primeUTR 3primeUTRlen ID Proteus 2596 2606 11 2614 2624 11 7 100 0 22 63 36 63 36 0 2609 AAATGGGTGAA TTCACCCATTT True TTAATTTTA TTTTTGGCG False True + AAATGGGTGAA TGTATTG TTCACCCATTT TTTTTGGCG 68 CDS_0002 intergenic 2562 2883 + down TCGTAATTTCGATTAGAAAGATTTATTAATTTTAAATGGGTGAATGTATTGTTCACCCATTTTTTTTGGCGCTAGATAGGGAAAGTAGGATATTTACACTAGAACAATGGAATAAAAAGTGTGATGCGTAAGAGAAAATAGTGTTCAATTTTTACTCTTTTATTAATAAATCGGTTAATTCTCGTGGATCAGATCCCAATTATAACTTTTGCACATTTTCAATGGAGTGAAATGTTTTTATATTTCACATATAACCTATTTCGTTAACAATTATGGCTTAGTGAACTTAATGTTCACGTCAGCTAATGTGGAGTATTATCA GAAAGAAGTTAAAGGCCAAGCATAATCGTAATTTCGATTAGAAAGATTTATTAATTTTAAATGGGTGAATGTATTGTTCACCCATTTTTTTTGGCGCTAGATAGGGAAAGTAGGATATTTACACTAGAACAATGGAATAAAAAGTGTGATGCGTAAGAGAAAATAGTGTTCAATTTTTACTCTTTTATTAATAAATCGGTTAATTCTCGTGGATCAGATCCCAATTATAACTTTTGCACATTTTCAATGGAGTGAAATGTTTTTATATTTCACATATAACCTATTTCGTTAACAATTATGGCTTAGTGAACTTAATGTTCACGTCAGCTAATGTGGAGTATTATCATGGATGCGTCCAATTTAGCCCCATC TCGTAATTTCGATTAGAAAGATTTATTAATTTTAAATGGGTGAATGTATTGTTCACCCATTT 62 TTerm_0001 Proteus 4276 4300 25 4305 4329 25 4 84 0 30 86 14 85 14 0 4302 TAATTAATAAATAAAAGGTATCTAT ATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTA True ACAATTACT AATTAGTTT True True + TAATTAATAAATAAAAGGTATCTAT AAAA ATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTA AATTAGTTT 76 CDS_0003 intergenic 4265 4449 + down TTACAATTACTAATTAATAAATAAAAGGTATCTATAAAAATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTAAATTAGTTTTTTTATTTTAATTATTCTAATTTTTTAATTTTATTAAATTAGAAAAAAAACAAATTGTACCTATACTTTAATTTCATTCTTTATTCTAATAAAAATAGTAGGTACAGGTTA CTTTGCTTGGTTCTTCTGGTTATAATTACAATTACTAATTAATAAATAAAAGGTATCTATAAAAATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTAAATTAGTTTTTTTATTTTAATTATTCTAATTTTTTAATTTTATTAAATTAGAAAAAAAACAAATTGTACCTATACTTTAATTTCATTCTTTATTCTAATAAAAATAGTAGGTACAGGTTATGATTACAGTTTTAGATTATTTATT TTACAATTACTAATTAATAAATAAAAGGTATCTATAAAAATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTA 64 TTerm_0002 Proteus 10869 10877 9 10887 10895 9 9 88 0 13 77 22 75 25 0 10881 TAATTGGTA TACCTATTA True ATTCATATT TATTTTGTT False True + TAATTGGTA GCTTTATTT TACCTATTA TATTTTGTT 42 CDS_0009 intergenic 10417 11004 + down AGGTAAAGTGATATAAATAGAGTGTTGAGATTAAAAACTATCCAAACGCATCTTTTTGTTAGAAAAATAGTTGACGACAAGGTAAGAGATTCGTAATATTCATCTCGTCCGAAAGGATACGCGGAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAGAATTTATCGTTTTGATGTATTAACTGACATCAAAATAATTAGAAACCGTATCGCTTTATGCTGATGCGGTTTTTTTTGCCTAAAATAAAAATAGTATCATTAACTCATTAACTCATTAACTCATTTAGTCAGTATTCTGTCGACACTCACGTCTTCTATTACAGATATCTAAGTTTATTACTTTTGTCTCTGTTTTCTACCTCCATTTATAACGCCACTATTATTTGCTATTAAATAAGAGCAATTCATATTAATTGGTAGCTTTATTTTACCTATTATATTTTGTTATCGATAATGGTAACTATTATCGTTATAGTTTTAATTCGCATTATCTTGCTATAATCTCTCTTATACCTAGCGTGGGGTAACTAACAGGCTAACATTCAA AGGTAAAGTGATATAAATAGAGTGTTGAGATTAAAAACTATCCAAACGCATCTTTTTGTTAGAAAAATAGTTGACGACAAGGTAAGAGATTCGTAATATTCATCTCGTCCGAAAGGATACGCGGAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAGAATTTATCGTTTTGATGTATTAACTGACATCAAAATAATTAGAAACCGTATCGCTTTATGCTGATGCGGTTTTTTTTGCCTAAAATAAAAATAGTATCATTAACTCATTAACTCATTAACTCATTTAGTCAGTATTCTGTCGACACTCACGTCTTCTATTACAGATATCTAAGTTTATTACTTTTGTCTCTGTTTTCTACCTCCATTTATAACGCCACTATTATTTGCTATTAAATAAGAGCAATTCATATTAATTGGTAGCTTTATTTTACCTATTA 478 TTerm_0003 Proteus 24528 24535 8 24542 24549 8 6 87 0 11 93 6 100 0 0 24538 AAATAAAA TTTCATTT True AATTGCGCA TTGTTGCGC False True + AAATAAAA GTCATT TTTCATTT TTGTTGCGC 30 CDS_0020 intergenic 24403 24740 + down CCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATAGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTTTTGTTGCGCAACAATGTGGTGGTGTAATGTTATTTCCCGCGTTTATCGTAATAAATGCTGTTTAAATCAAAGAATTATTGATTTTCACTGATTACGATAGCCACCTTTGTGGATTTTTTATATTGCGGTTTTTTGCCCGCATTGAGAGAATCAGCTATCTAGATGCTTTTTATCCGACTTGGAGTAGAAAA TTTCAAGTTAGGTGTTGGTAGGTGACCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATAGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTTTTGTTGCGCAACAATGTGGTGGTGTAATGTTATTTCCCGCGTTTATCGTAATAAATGCTGTTTAAATCAAAGAATTATTGATTTTCACTGATTACGATAGCCACCTTTGTGGATTTTTTATATTGCGGTTTTTTGCCCGCATTGAGAGAATCAGCTATCTAGATGCTTTTTATCCGACTTGGAGTAGAAAATGACCACTCGTAAAACCCTTGCAAA CCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATAGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTT 146 TTerm_0004 Proteus 4276 4300 25 4305 4329 25 4 84 0 30 86 14 85 14 0 4302 TAATTAATAAATAAAAGGTATCTAT ATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTA True ACAATTACT AATTAGTTT True True - TAATTAAAATAAAAAAGGTACCTAT TTTT ATAGATACCTTTTATTTATTAATTA AGTAATTGT 76 CDS_0003 intergenic 4265 4449 + down TTACAATTACTAATTAATAAATAAAAGGTATCTATAAAAATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTAAATTAGTTTTTTTATTTTAATTATTCTAATTTTTTAATTTTATTAAATTAGAAAAAAAACAAATTGTACCTATACTTTAATTTCATTCTTTATTCTAATAAAAATAGTAGGTACAGGTTA CTTTGCTTGGTTCTTCTGGTTATAATTACAATTACTAATTAATAAATAAAAGGTATCTATAAAAATAGGTACCTTTTTTATTTTAATTAAATTAGTTTTTTTATTTTAATTATTCTAATTTTTTAATTTTATTAAATTAGAAAAAAAACAAATTGTACCTATACTTTAATTTCATTCTTTATTCTAATAAAAATAGTAGGTACAGGTTATGATTACAGTTTTAGATTATTTATT TAACCTGTACCTACTATTTTTATTAGAATAAAGAATGAAATTAAAGTATAGGTACAATTTGTTTTTTTTCTAATTTAATAAAATTAAAAAATTAGAATAATTAAAATAAAAAAACTAATTTAATTAAAATAAAAAAGGTACCTATTTTTATAGATACCTTTTATTTATTAATT 173 TTerm_0005 Proteus 24420 24428 9 24435 24443 9 6 88 0 13 100 0 100 0 0 24431 AATTAAATA TATTTATTT True AGCGGGAAA GATTTGATA True False - AAATAAATA CTAAGC TATTTAATT TTTCCCGCT 26 CDS_0020 intergenic 24403 24740 + down CCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATAGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTTTTGTTGCGCAACAATGTGGTGGTGTAATGTTATTTCCCGCGTTTATCGTAATAAATGCTGTTTAAATCAAAGAATTATTGATTTTCACTGATTACGATAGCCACCTTTGTGGATTTTTTATATTGCGGTTTTTTGCCCGCATTGAGAGAATCAGCTATCTAGATGCTTTTTATCCGACTTGGAGTAGAAAA TTTCAAGTTAGGTGTTGGTAGGTGACCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATAGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTTTTGTTGCGCAACAATGTGGTGGTGTAATGTTATTTCCCGCGTTTATCGTAATAAATGCTGTTTAAATCAAAGAATTATTGATTTTCACTGATTACGATAGCCACCTTTGTGGATTTTTTATATTGCGGTTTTTTGCCCGCATTGAGAGAATCAGCTATCTAGATGCTTTTTATCCGACTTGGAGTAGAAAATGACCACTCGTAAAACCCTTGCAAA TTTTCTACTCCAAGTCGGATAAAAAGCATCTAGATAGCTGATTCTCTCAATGCGGGCAAAAAACCGCAATATAAAAAATCCACAAAGGTGGCTATCGTAATCAGTGAAAATCAATAATTCTTTGATTTAAACAGCATTTATTACGATAAACGCGGGAAATAACATTACACCACCACATTGTTGCGCAACAAAAATGAAAAATGACTTTTATTTGCGCAATTAAGAAGTATCTTATTAAACCTTAGCTTGATACGACTAATCAAGCTAAAATTACGTTGCTGTTTTATCTATCAAATCAAATAAATACTAAGCTATTTAAT 320 TTerm_0006