chrom_intergenic ID locus__tag TSS adjTSS_intergenic min10seq min10score score prediction class strand_intergenic promoterSeq start_intergenic end_intergenic chrom locus_tag_intergenic type startIntergenic endIntergenic strand stream seq aug_seq locus_tag CDS_0003 p_0001 p_0001 902 195 TGTTTTCAA 2 0.91 poor intergenic + CTTGCCGAAAGACAGCAGGCAAGCTGGGTAAAAACACGGTCTGAACCGACATTCATGTTTTCAAAAGAACC 122 193 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0003 intergenic 823 1097 - up GTGGGACCATCCATATGGGATTACACAACCTGACGGGAAAATTGTAGTTTATTGTCTGAATGGTGGGGCGTGAGACCGTCCATCCGTGCTTTGTTTGGCAGATAACTATGATGAAGCCTGTGAACTTGCCGAAAGACAGCAGGCAAGCTGGGTAAAAACACGGTCTGAACCGACATTCATGTTTTCAAAAGAACCGCCATTTATACTGGCGAGGATGCCGCAGCGACCGGATCATCAACAAGAAATTGTTGCTGAATTTTCCTCAAGGGATGAG 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CTTTAGCTACTTCTTCCAGTTGCATGTGACAACCCTCTGTCTAATGATATTTCGATAATACCAGAAATATCTTGACCAGAATTATATTTCGATTATTCTAGAAACGTAGATTTTGTCAAGAGGGTTTAGTATGAATAGTTGGATTTCTATGCTGCA p_0011 CDS_0028 p_0013 p_0013 20626 115 ATCAAAATA 3 0.99 poor intergenic + TAAAATAACCACCATCATTTCATAACAATACCTGCTGACTATGAAGATCTACGTCATCAAAATAGCAGTTC 43 114 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0028 intergenic 20511 20641 + up GAAAAACCTCGGGGCAGCCATCGAATGATGCCATCTACAGGGGTTAAAATAACCACCATCATTTCATAACAATACCTGCTGACTATGAAGATCTACGTCATCAAAATAGCAGTTCATGGAGTCAGTCCGA TTGCGCAGATGAGATAGGAGAGCATGAAAAACCTCGGGGCAGCCATCGAATGATGCCATCTACAGGGGTTAAAATAACCACCATCATTTCATAACAATACCTGCTGACTATGAAGATCTACGTCATCAAAATAGCAGTTCATGGAGTCAGTCCGATGGTCTGGCGTCGGCTGAGAATTGC p_0013 CDS_0029 p_0014 p_0014 21302 116 TTTAAATCT 2 1.0 poor intergenic + CCGAAAAAATGTCTATAAACCTCCCTAAATCAGTGTTTATGGATTATTCTTTAAATCTCTATGATGTTTAA 45 116 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0029 intergenic 21186 21323 + up 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GAGTACTCCTTGTTGAAAGGAGGGCTAGACTACCATTATACATATGCCAAGACATTAAAATAAAAGCCTGTTACATCAACACATTACAACCCCTCAATTTACCTGTTTTAAGTGGTCAAATTGGCGCGTAGAGCGCCTATCGCTCTTGCATTGGCACGCGGCCCTGTTGAAAAAAGTTATTCGCTTTAGATAGGGTTAGGAGAGCCGTGCTTCGCCGGTAAAAAATCGGACTATCCGACGCAGGGCGGACTCATCGGCGGAGAAGCAAACTTTGACTATATCTCCCTACACTTGGAAGAGGGCTAGACTGGCCCCATAGATCACCAGACACTTCGACTCTCTTAAAATAAGAGGTAGTCTTGGAACTA GATATGTATGATTGTAGGTTTCCATGAGTACTCCTTGTTGAAAGGAGGGCTAGACTACCATTATACATATGCCAAGACATTAAAATAAAAGCCTGTTACATCAACACATTACAACCCCTCAATTTACCTGTTTTAAGTGGTCAAATTGGCGCGTAGAGCGCCTATCGCTCTTGCATTGGCACGCGGCCCTGTTGAAAAAAGTTATTCGCTTTAGATAGGGTTAGGAGAGCCGTGCTTCGCCGGTAAAAAATCGGACTATCCGACGCAGGGCGGACTCATCGGCGGAGAAGCAAACTTTGACTATATCTCCCTACACTTGGAAGAGGGCTAGACTGGCCCCATAGATCACCAGACACTTCGACTCTCTTAAAATAAGAGGTAGTCTTGGAACTATGTTTAATACCAGTCAGAACGATAA p_0015 CDS_0038 p_0018 p_0018 28673 118 AACTAATTT 3 1.0 poor intergenic + CTGTTCTAATGCACTTCGCATGCCAACTTTTTAATTCATTGAAATATTTGAAAATAACTAATTTTACCTGT 48 119 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0038 intergenic 28620 28791 - up TAATGTAATCCTCACTTACTGTTCTGATATCGGGCAATGCCCTGCTGCTGTTCTAATGCACTTCGCATGCCAACTTTTTAATTCATTGAAATATTTGAAAATAACTAATTTTACCTGTCGGGATAAATAGGGTAAATTGGTGAATAACACTAACAAATGGTGAATTTCATC TCGGCAAAACGAGAAAAAATACCCATAATGTAATCCTCACTTACTGTTCTGATATCGGGCAATGCCCTGCTGCTGTTCTAATGCACTTCGCATGCCAACTTTTTAATTCATTGAAATATTTGAAAATAACTAATTTTACCTGTCGGGATAAATAGGGTAAATTGGTGAATAACACTAACAAATGGTGAATTTCATCATGGCAGGATACAAAGATAATCTGC p_0018 CDS_0039 p_0017 p_0017 28693 73 GTAAAATTA 3 1.0 poor intergenic + TGAAATTCACCATTTGTTAGTGTTATTCACCAATTTACCCTATTTATCCCGACAGGTAAAATTAGTTATTT 0 71 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0039 intergenic 28620 28791 + up GATGAAATTCACCATTTGTTAGTGTTATTCACCAATTTACCCTATTTATCCCGACAGGTAAAATTAGTTATTTTCAAATATTTCAATGAATTAAAAAGTTGGCATGCGAAGTGCATTAGAACAGCAGCAGGGCATTGCCCGATATCAGAACAGTAAGTGAGGATTACATTA 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AGTTTTTCTTTAGGCTCTTGTTATAAATAACCGTTTGTTCTGTCCGGTGAATCTGACGATAATTGCCGCCG 11 82 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0044 intergenic 32826 32937 - up TAATCCACCTGTAAGTTTTTCTTTAGGCTCTTGTTATAAATAACCGTTTGTTCTGTCCGGTGAATCTGACGATAATTGCCGCCGTTACTCACACACGGAAGGTTAATTCTG TTAAGGGGGAGATAACGTCTGACCATAATCCACCTGTAAGTTTTTCTTTAGGCTCTTGTTATAAATAACCGTTTGTTCTGTCCGGTGAATCTGACGATAATTGCCGCCGTTACTCACACACGGAAGGTTAATTCTGATGAAAAAATCGTTATCTGCAACAC p_0020 CDS_0049 p_0021 p_0021 35702 129 CTTATTATT 3 1.0 poor intergenic + TACACATAGAGGTATTTTTTTCTAGATTTATATCGAATTTCGTTATCGAATTTCGCTTATTATTGATCAAC 55 126 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0049 intergenic 35573 35729 + up AGCACGCTAAGCCGTAAGTAAGCGTGCTCCTGTGAAAGCCACAGCTAAAACTGCGTAGTACACATAGAGGTATTTTTTTCTAGATTTATATCGAATTTCGTTATCGAATTTCGCTTATTATTGATCAACTCGTTGCAGATCATGAAGGCGAAAGTA GATCGCCTCAGAAAACGGAAAATAAAGCACGCTAAGCCGTAAGTAAGCGTGCTCCTGTGAAAGCCACAGCTAAAACTGCGTAGTACACATAGAGGTATTTTTTTCTAGATTTATATCGAATTTCGTTATCGAATTTCGCTTATTATTGATCAACTCGTTGCAGATCATGAAGGCGAAAGTATGACGAATAACCCTACCGATGACAG p_0021 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AACCGTCATCAATGAATACCAACATTTATAAAACTCCTTATGGTGTTTTTTTTGGTGTGTGTTTGGGTATGTTTTGGGTTTTAAGTGGGTTTGTTTGTCAAGTTTACCCCATTTCAACCATCAATCAATGATTATTTGTCTTGTTTTGGTGTTTTATTGGGTTGGGTATGGGTTGTTTTTGGGTTTTGTTTGGCGGGTAACAAAAGATGTCGCCGGGCTCCTCTTTTTACTGCGCCGGCTGACGCGGCGCGGCAGGAACGCTGCCTGTGGTCAGTGTCCCGCGTCCGGCCGGGCACGGGACGGGCGCTTTTACCGCTCCCGGCTGGCGTTGGTGACAGTGTACGCCAGCCCGTCGCCCTTTTCTGATGAACGCCCTTCAAGCCGCTTTCGCGGCATATCCTCGCCGTCAAAAAGACGACGGCTGCGGTATTCCACGGTCGGCCTGACCCGTTACCGGACGCGGTGAACAGCCCACAGGCAGCGGGGAACGGGCACCACAGGGGTGCCCTCCCGGTGCCCTCTGTAAGAGAAGGAGTGCTGTTATGTCCCGTTTTATCCTGGGTGACTG p_0024 CDS_0060 p_0025 p_0025 46451 407 ACACCAAAA 2 1.0 poor intergenic + TCTTTTGTTACCCGCCAAACAAAACCCAAAAACAACCCATACCCAACCCAATAAAACACCAAAACAAGACA 337 408 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0060 intergenic 46340 46858 - up TAACAGCACTCCTTCTCTTACAGAGGGCACCGGGAGGGCACCCCTGTGGTGCCCGTTCCCCGCTGCCTGTGGGCTGTTCACCGCGTCCGGTAACGGGTCAGGCCGACCGTGGAATACCGCAGCCGTCGTCTTTTTGACGGCGAGGATATGCCGCGAAAGCGGCTTGAAGGGCGTTCATCAGAAAAGGGCGACGGGCTGGCGTACACTGTCACCAACGCCAGCCGGGAGCGGTAAAAGCGCCCGTCCCGTGCCCGGCCGGACGCGGGACACTGACCACAGGCAGCGTTCCTGCCGCGCCGCGTCAGCCGGCGCAGTAAAAAGAGGAGCCCGGCGACATCTTTTGTTACCCGCCAAACAAAACCCAAAAACAACCCATACCCAACCCAATAAAACACCAAAACAAGACAAATAATCATTGATTGATGGTTGAAATGGGGTAAACTTGACAAACAAACCCACTTAAAACCCAAAACATACCCAAACACACACCAAAAAAAACACCATAAGGAGTTTTATAA 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CTGATATACAAAATTACTCTGGCCATAAGATAAAACCTTTCATTATTAAGCAATGAACTTTTCACTATAAATATGCATATAGTGTTTACAAGTAAGAAAGACACTCCTAGCAGCGCCTCTAGGATCATCCTATAAAAAAATGCGATCCGGCGCTAGGGGCGTCCCTAATATATATCAATGTTTTTCATGAAAATTGTCAGTACTGATCCTAATAAGAGTCGCTATAGGGTCGTAACAGGATCGCCAACGACTCTCTATTTAATAATTCAGAATTATTAAATATAAATAGCGTTTGTTAATTACATGATTTAAAACGTAAATCAGCAAAAACTTGTTTTTGCGTAGTGTGTGGTGCTTTTGGTGGTGAGAACCACCAACCTGTTGAGCCTTTTTGTGGAGTGGGTTAAATTATTTACGGATAAAGTCACCAGAGGTGGAAAAATGAAAAAATGGATGTTAGCAATCT p_0032 CDS_0082 p_0028 p_0028 62294 169 TATTTATAT 3 1.0 poor intergenic + ACGCAAAAACAAGTTTTTGCTGATTTACGTTTTAAATCATGTAATTAACAAACGCTATTTATATTTAATAA 93 164 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0082 intergenic 62125 62541 + up TTTTCCACCTCTGGTGACTTTATCCGTAAATAATTTAACCCACTCCACAAAAAGGCTCAACAGGTTGGTGGTTCTCACCACCAAAAGCACCACACACTACGCAAAAACAAGTTTTTGCTGATTTACGTTTTAAATCATGTAATTAACAAACGCTATTTATATTTAATAATTCTGAATTATTAAATAGAGAGTCGTTGGCGATCCTGTTACGACCCTATAGCGACTCTTATTAGGATCAGTACTGACAATTTTCATGAAAAACATTGATATATATTAGGGACGCCCCTAGCGCCGGATCGCATTTTTTTATAGGATGATCCTAGAGGCGCTGCTAGGAGTGTCTTTCTTACTTGTAAACACTATATGCATATTTATAGTGAAAAGTTCATTGCTTAATAATGAAAGGTTTTATCTTA AGATTGCTAACATCCATTTTTTCATTTTTCCACCTCTGGTGACTTTATCCGTAAATAATTTAACCCACTCCACAAAAAGGCTCAACAGGTTGGTGGTTCTCACCACCAAAAGCACCACACACTACGCAAAAACAAGTTTTTGCTGATTTACGTTTTAAATCATGTAATTAACAAACGCTATTTATATTTAATAATTCTGAATTATTAAATAGAGAGTCGTTGGCGATCCTGTTACGACCCTATAGCGACTCTTATTAGGATCAGTACTGACAATTTTCATGAAAAACATTGATATATATTAGGGACGCCCCTAGCGCCGGATCGCATTTTTTTATAGGATGATCCTAGAGGCGCTGCTAGGAGTGTCTTTCTTACTTGTAAACACTATATGCATATTTATAGTGAAAAGTTCATTGCTTAATAATGAAAGGTTTTATCTTATGGCCAGAGTAATTTTGTATATCAG p_0028 CDS_0081 p_0031 p_0031 62364 177 ATGAAAATT 3 0.74 poor intergenic + 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CTGATATACAAAATTACTCTGGCCATAAGATAAAACCTTTCATTATTAAGCAATGAACTTTTCACTATAAATATGCATATAGTGTTTACAAGTAAGAAAGACACTCCTAGCAGCGCCTCTAGGATCATCCTATAAAAAAATGCGATCCGGCGCTAGGGGCGTCCCTAATATATATCAATGTTTTTCATGAAAATTGTCAGTACTGATCCTAATAAGAGTCGCTATAGGGTCGTAACAGGATCGCCAACGACTCTCTATTTAATAATTCAGAATTATTAAATATAAATAGCGTTTGTTAATTACATGATTTAAAACGTAAATCAGCAAAAACTTGTTTTTGCGTAGTGTGTGGTGCTTTTGGTGGTGAGAACCACCAACCTGTTGAGCCTTTTTGTGGAGTGGGTTAAATTATTTACGGATAAAGTCACCAGAGGTGGAAAAATGAAAAAATGGATGTTAGCAATCT p_0031 CDS_0081 p_0030 p_0030 62468 73 TGTTTACAA 2 1.0 poor intergenic + AGATAAAACCTTTCATTATTAAGCAATGAACTTTTCACTATAAATATGCATATAGTGTTTACAAGTAAGAA 1 72 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0081 intergenic 62125 62541 - up TAAGATAAAACCTTTCATTATTAAGCAATGAACTTTTCACTATAAATATGCATATAGTGTTTACAAGTAAGAAAGACACTCCTAGCAGCGCCTCTAGGATCATCCTATAAAAAAATGCGATCCGGCGCTAGGGGCGTCCCTAATATATATCAATGTTTTTCATGAAAATTGTCAGTACTGATCCTAATAAGAGTCGCTATAGGGTCGTAACAGGATCGCCAACGACTCTCTATTTAATAATTCAGAATTATTAAATATAAATAGCGTTTGTTAATTACATGATTTAAAACGTAAATCAGCAAAAACTTGTTTTTGCGTAGTGTGTGGTGCTTTTGGTGGTGAGAACCACCAACCTGTTGAGCCTTTTTGTGGAGTGGGTTAAATTATTTACGGATAAAGTCACCAGAGGTGGAAAA CTGATATACAAAATTACTCTGGCCATAAGATAAAACCTTTCATTATTAAGCAATGAACTTTTCACTATAAATATGCATATAGTGTTTACAAGTAAGAAAGACACTCCTAGCAGCGCCTCTAGGATCATCCTATAAAAAAATGCGATCCGGCGCTAGGGGCGTCCCTAATATATATCAATGTTTTTCATGAAAATTGTCAGTACTGATCCTAATAAGAGTCGCTATAGGGTCGTAACAGGATCGCCAACGACTCTCTATTTAATAATTCAGAATTATTAAATATAAATAGCGTTTGTTAATTACATGATTTAAAACGTAAATCAGCAAAAACTTGTTTTTGCGTAGTGTGTGGTGCTTTTGGTGGTGAGAACCACCAACCTGTTGAGCCTTTTTGTGGAGTGGGTTAAATTATTTACGGATAAAGTCACCAGAGGTGGAAAAATGAAAAAATGGATGTTAGCAATCT p_0030 CDS_0082 p_0029 p_0029 62530 405 TGCTTAATA 3 1.0 poor intergenic + 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TGATATTTCCGTCGGAATGGCCACATAGTGCACCTTATGGATTGCTCTAATAAAAAACGCGATGAGTGTACATCACGTTTTAAAAATATTGAATTATTAGAGCAATATTATCCTGATTCTTGCTCAAAAAACGCGCTAATGAGAGGAAGCCAATCCTCTGACACTTCACGCGGTCGCGGTTTGCCATGGAAGAAGATTATTCGGCAGTCTTTTGGTAATGCCCCATTCCCCCTGGAGTAGCGCGCACTTGCATATTTCGAACCAGGTTCCACAACATCGGCCTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC p_0063 CDS_0180 p_0062 p_0062 150598 244 GATAATATT 3 1.0 poor intergenic + GAAGTGTCAGAGGATTGGCTTCCTCTCATTAGCGCGTTTTTTGAGCAAGAATCAGGATAATATTGCTCTAA 170 241 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0180 intergenic 150354 150669 + up TGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCAAGGCCGATGTTGTGGAACCTGGTTCGAAATATGCAAGTGCGCGCTACTCCAGGGGGAATGGGGCATTACCAAAAGACTGCCGAATAATCTTCTTCCATGGCAAACCGCGACCGCGTGAAGTGTCAGAGGATTGGCTTCCTCTCATTAGCGCGTTTTTTGAGCAAGAATCAGGATAATATTGCTCTAATAATTCAATATTTTTAAAACGTGATGTACACTCATCGCGTTTTTTATTAGAGCAATCCATAAGGTGCACTA GACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCAAGGCCGATGTTGTGGAACCTGGTTCGAAATATGCAAGTGCGCGCTACTCCAGGGGGAATGGGGCATTACCAAAAGACTGCCGAATAATCTTCTTCCATGGCAAACCGCGACCGCGTGAAGTGTCAGAGGATTGGCTTCCTCTCATTAGCGCGTTTTTTGAGCAAGAATCAGGATAATATTGCTCTAATAATTCAATATTTTTAAAACGTGATGTACACTCATCGCGTTTTTTATTAGAGCAATCCATAAGGTGCACTATGTGGCCATTCCGACGGAAATATCA p_0062 CDS_0183 p_0065 p_0065 152801 71 TTGCTCTAA 1 1.0 poor intergenic + TTGCTCTAATAAATATTGATTTTTAAAACAGAGAAAGTGAAAATAAAAACATGCCGCAAGGCGCGGCATGT 0 71 pR25.0627-2_Galaxy_155k CDS_0183 intergenic 152730 152925 + up TTGCTCTAATAAATATTGATTTTTAAAACAGAGAAAGTGAAAATAAAAACATGCCGCAAGGCGCGGCATGTATCCAATCAATCACAGGAGCTGAAAATATGAACACGGCATTCAGAATCATTATGGCCGCGATCTATTTCTGGCTGTTCTCTATCACTTTTGGCGGCATCGTCGCACATGGGTAAGGGGGATGCA 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